HMBOX1 (англ. Homeobox containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 47 278.
HMBOX1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | HMBOX1, HNF1LA, HOT1, PBHNF, homeobox containing 1, TAH1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | MGI: 2445066 HomoloGene: 11589 GeneCards: HMBOX1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ожиріння | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 8: 28.89 – 29.06 Mb | Хр. 14: 65.05 – 65.19 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLSSFPVVLL | ETMSHYTDEP | RFTIEQIDLL | QRLRRTGMTK | HEILHALETL | ||||
DRLDQEHSDK | FGRRSSYGGS | SYGNSTNNVP | ASSSTATAST | QTQHSGMSPS | ||||
PSNSYDTSPQ | PCTTNQNGRE | NNERLSTSNG | KMSPTRYHAN | SMGQRSYSFE | ||||
ASEEDLDVDD | KVEELMRRDS | SVIKEEIKAF | LANRRISQAV | VAQVTGISQS | ||||
RISHWLLQQG | SDLSEQKKRA | FYRWYQLEKT | NPGATLSMRP | APIPIEDPEW | ||||
RQTPPPVSAT | SGTFRLRRGS | RFTWRKECLA | VMESYFNENQ | YPDEAKREEI | ||||
ANACNAVIQK | PGKKLSDLER | VTSLKVYNWF | ANRRKEIKRR | ANIEAAILES | ||||
HGIDVQSPGG | HSNSDDVDGN | DYSEQDDSTS | HSDHQDPISL | AVEMAAVNHT | ||||
ILALARQGAN | EIKTEALDDD |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з HMBOX1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26137 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- UniProt, Q6NT76 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
HMBOX1 angl Homeobox containing 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 8 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 420 aminokislot a molekulyarna masa 47 278 HMBOX1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2CUF 4J19IdentifikatoriSimvoliHMBOX1 HNF1LA HOT1 PBHNF homeobox containing 1 TAH1Zovnishni ID MGI 2445066 HomoloGene 11589 GeneCards HMBOX1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaozhirinnya Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding telomerase activity double stranded telomeric DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding telomeric DNA binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific sequence specific DNA binding GO 0032403 protein containing complex binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta citoplazma klitinne yadro telomerase holoenzyme complex nukleoplazma gialoplazma yaderni tilcya telomera hromosoma Tilce Kahalya PML bodyBiologichnij proces GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated positive regulation of telomere maintenance via telomerase GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0009373 regulation of transcription DNA templated positive regulation of telomerase activity transcription DNA templated RNA dependent DNA biosynthetic process positive regulation of chromatin binding GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of telomerase activityDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez79618 219150Ensembl ENSG00000147421 ENSMUSG00000021972UniProt Q6NT76 Q8BJA3RefSeq mRNK NM 001135726 NM 024567 NM 001324382 NM 001324383 NM 001324384NM 001324385 NM 001324386 NM 001324387 NM 001324388 NM 001324389 NM 001324390 NM 001324391 NM 001324392 NM 001324393 NM 001324394 NM 001324395 NM 001330498NM 177338 NM 001347626 NM 001347627RefSeq bilok NP 001129198 NP 001311311 NP 001311312 NP 001311313 NP 001311314NP 001311315 NP 001311316 NP 001311317 NP 001311318 NP 001311319 NP 001311320 NP 001311321 NP 001311322 NP 001311323 NP 001311324 NP 001317427 NP 078843NP 001334555 NP 001334556 NP 796312Lokus UCSC Hr 8 28 89 29 06 MbHr 14 65 05 65 19 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLSSFPVVLLETMSHYTDEPRFTIEQIDLLQRLRRTGMTKHEILHALETL DRLDQEHSDKFGRRSSYGGSSYGNSTNNVPASSSTATASTQTQHSGMSPS PSNSYDTSPQPCTTNQNGRENNERLSTSNGKMSPTRYHANSMGQRSYSFE ASEEDLDVDDKVEELMRRDSSVIKEEIKAFLANRRISQAVVAQVTGISQS RISHWLLQQGSDLSEQKKRAFYRWYQLEKTNPGATLSMRPAPIPIEDPEW RQTPPPVSATSGTFRLRRGSRFTWRKECLAVMESYFNENQYPDEAKREEI ANACNAVIQKPGKKLSDLERVTSLKVYNWFANRRKEIKRRANIEAAILES HGIDVQSPGGHSNSDDVDGNDYSEQDDSTSHSDHQDPISLAVEMAAVNHT ILALARQGANEIKTEALDDD A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Impens F Radoshevich L Cossart P Ribet D 2014 Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli Proc Natl Acad Sci U S A 111 12432 12437 PMID 25114211 DOI 10 1073 pnas 1413825111 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PMID 25772364 DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z HMBOX1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 26137 angl Procitovano 7 veresnya 2017 UniProt Q6NT76 angl Arhiv originalu za 22 veresnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 8 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi