GTF2IRD1 (англ. GTF2I repeat domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 959 амінокислот, а молекулярна маса — 106 057.
GTF2IRD1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GTF2IRD1, BEN, CREAM1, GTF3, MUSTRD1, RBAP2, WBS, WBSCR11, WBSCR12, hMusTRD1alpha1, GTF2I repeat domain containing 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604318 MGI: 1861942 HomoloGene: 4158 GeneCards: GTF2IRD1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 74.45 – 74.6 Mb | Хр. 5: 134.39 – 134.49 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MALLGKRCDV | PTNGCGPDRW | NSAFTRKDEI | ITSLVSALDS | MCSALSKLNA | ||||
EVACVAVHDE | SAFVVGTEKG | RMFLNARKEL | QSDFLRFCRG | PPWKDPEAEH | ||||
PKKVQRGEGG | GRSLPRSSLE | HGSDVYLLRK | MVEEVFDVLY | SEALGRASVV | ||||
PLPYERLLRE | PGLLAVQGLP | EGLAFRRPAE | YDPKALMAIL | EHSHRIRFKL | ||||
KRPLEDGGRD | SKALVELNGV | SLIPKGSRDC | GLHGQAPKVP | PQDLPPTATS | ||||
SSMASFLYST | ALPNHAIREL | KQEAPSCPLA | PSDLGLSRPM | PEPKATGAQD | ||||
FSDCCGQKPT | GPGGPLIQNV | HASKRILFSI | VHDKSEKWDA | FIKETEDINT | ||||
LRECVQILFN | SRYAEALGLD | HMVPVPYRKI | ACDPEAVEIV | GIPDKIPFKR | ||||
PCTYGVPKLK | RILEERHSIH | FIIKRMFDER | IFTGNKFTKD | TTKLEPASPP | ||||
EDTSAEVSRA | TVLDLAGNAR | SDKGSMSEDC | GPGTSGELGG | LRPIKIEPED | ||||
LDIIQVTVPD | PSPTSEEMTD | SMPGHLPSED | SGYGMEMLTD | KGLSEDARPE | ||||
ERPVEDSHGD | VIRPLRKQVE | LLFNTRYAKA | IGISEPVKVP | YSKFLMHPEE | ||||
LFVVGLPEGI | SLRRPNCFGI | AKLRKILEAS | NSIQFVIKRP | ELLTEGVKEP | ||||
IMDSQGTASS | LGFSPPALPP | ERDSGDPLVD | ESLKRQGFQE | NYDARLSRID | ||||
IANTLREQVQ | DLFNKKYGEA | LGIKYPVQVP | YKRIKSNPGS | VIIEGLPPGI | ||||
PFRKPCTFGS | QNLERILAVA | DKIKFTVTRP | FQGLIPKPDE | DDANRLGEKV | ||||
ILREQVKELF | NEKYGEALGL | NRPVLVPYKL | IRDSPDAVEV | TGLPDDIPFR | ||||
NPNTYDIHRL | EKILKAREHV | RMVIINQLQP | FAEICNDAKV | PAKDSSIPKR | ||||
KRKRVSEGNS | VSSSSSSSSS | SSSNPDSVAS | ANQISLVQWP | MYMVDYAGLN | ||||
VQLPGPLNY |
Кодований геном білок за функціями належить до , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Osborne L.R., Campbell T., Daradich A., Scherer S.W., Tsui L.-C. (1999). Identification of a putative transcription factor gene (WBSCR11) that is commonly deleted in Williams-Beuren syndrome. Genomics. 57: 279—284. PMID 10198167 DOI:10.1006/geno.1999.5784
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tussie-Luna M.I., Bayarsaihan D., Ruddle F.H., Roy A.L. (2001). Repression of TFII-I-dependent transcription by nuclear exclusion. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 7789—7794. PMID 11438732 DOI:10.1073/pnas.141222298
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Franke Y., Peoples R.J., Francke U. (1999). Identification of GTF2IRD1, a putative transcription factor within the Williams-Beuren syndrome deletion at 7q11.23. Cytogenet. Cell Genet. 86: 296—304. PMID 10575229
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4661 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GTF2IRD1 angl GTF2I repeat domain containing 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 959 aminokislot a molekulyarna masa 106 057 GTF2IRD1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2D99 2DN5 2DZQ 2DZRIdentifikatoriSimvoliGTF2IRD1 BEN CREAM1 GTF3 MUSTRD1 RBAP2 WBS WBSCR11 WBSCR12 hMusTRD1alpha1 GTF2I repeat domain containing 1Zovnishni ID OMIM 604318 MGI 1861942 HomoloGene 4158 GeneCards GTF2IRD1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity transcription factor activity RNA polymerase II distal enhancer sequence specific binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta klitinne yadro nukleoplazma citoplazma gialoplazmaBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated transcription DNA templated transition between slow and fast fiber GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II multicellular organism development transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9569 57080Ensembl ENSG00000006704 ENSMUSG00000023079UniProt Q9UHL9 Q9JI57RefSeq mRNK NM 001199207 NM 005685 NM 016328NM 001081462 NM 001081463 NM 001081464 NM 001081465 NM 001081466NM 001081467 NM 001081468 NM 001081469 NM 001081470 NM 001244936 NM 020331 NM 001347488RefSeq bilok NP 001186136 NP 005676 NP 057412NP 001074931 NP 001074932 NP 001074933 NP 001074934 NP 001074935NP 001074936 NP 001074937 NP 001074938 NP 001074939 NP 001231865 NP 001334417 NP 065064Lokus UCSC Hr 7 74 45 74 6 MbHr 5 134 39 134 49 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MALLGKRCDVPTNGCGPDRWNSAFTRKDEIITSLVSALDSMCSALSKLNA EVACVAVHDESAFVVGTEKGRMFLNARKELQSDFLRFCRGPPWKDPEAEH PKKVQRGEGGGRSLPRSSLEHGSDVYLLRKMVEEVFDVLYSEALGRASVV PLPYERLLREPGLLAVQGLPEGLAFRRPAEYDPKALMAILEHSHRIRFKL KRPLEDGGRDSKALVELNGVSLIPKGSRDCGLHGQAPKVPPQDLPPTATS SSMASFLYSTALPNHAIRELKQEAPSCPLAPSDLGLSRPMPEPKATGAQD FSDCCGQKPTGPGGPLIQNVHASKRILFSIVHDKSEKWDAFIKETEDINT LRECVQILFNSRYAEALGLDHMVPVPYRKIACDPEAVEIVGIPDKIPFKR PCTYGVPKLKRILEERHSIHFIIKRMFDERIFTGNKFTKDTTKLEPASPP EDTSAEVSRATVLDLAGNARSDKGSMSEDCGPGTSGELGGLRPIKIEPED LDIIQVTVPDPSPTSEEMTDSMPGHLPSEDSGYGMEMLTDKGLSEDARPE ERPVEDSHGDVIRPLRKQVELLFNTRYAKAIGISEPVKVPYSKFLMHPEE LFVVGLPEGISLRRPNCFGIAKLRKILEASNSIQFVIKRPELLTEGVKEP IMDSQGTASSLGFSPPALPPERDSGDPLVDESLKRQGFQENYDARLSRID IANTLREQVQDLFNKKYGEALGIKYPVQVPYKRIKSNPGSVIIEGLPPGI PFRKPCTFGSQNLERILAVADKIKFTVTRPFQGLIPKPDEDDANRLGEKV ILREQVKELFNEKYGEALGLNRPVLVPYKLIRDSPDAVEVTGLPDDIPFR NPNTYDIHRLEKILKAREHVRMVIINQLQPFAEICNDAKVPAKDSSIPKR KRKRVSEGNSVSSSSSSSSSSSSNPDSVASANQISLVQWPMYMVDYAGLN VQLPGPLNY A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaOsborne L R Campbell T Daradich A Scherer S W Tsui L C 1999 Identification of a putative transcription factor gene WBSCR11 that is commonly deleted in Williams Beuren syndrome Genomics 57 279 284 PMID 10198167 DOI 10 1006 geno 1999 5784 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tussie Luna M I Bayarsaihan D Ruddle F H Roy A L 2001 Repression of TFII I dependent transcription by nuclear exclusion Proc Natl Acad Sci U S A 98 7789 7794 PMID 11438732 DOI 10 1073 pnas 141222298 Impens F Radoshevich L Cossart P Ribet D 2014 Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli Proc Natl Acad Sci U S A 111 12432 12437 PMID 25114211 DOI 10 1073 pnas 1413825111 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PMID 25772364 DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033 Franke Y Peoples R J Francke U 1999 Identification of GTF2IRD1 a putative transcription factor within the Williams Beuren syndrome deletion at 7q11 23 Cytogenet Cell Genet 86 296 304 PMID 10575229PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 4661 angl Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi