GRIK2 (англ. Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 908 амінокислот, а молекулярна маса — 102 583.
GRIK2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GRIK2, EAA4, GLR6, GLUK6, GLUR6, GluK2, MRT6, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2, NEDLAS | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 138244 MGI: 95815 HomoloGene: 40717 GeneCards: GRIK2 | ||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
selurampanel, топірамат | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 100.96 – 102.08 Mb | Хр. 10: 49.09 – 49.79 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKIIFPILSN | PVFRRTVKLL | LCLLWIGYSQ | GTTHVLRFGG | IFEYVESGPM | ||||
GAEELAFRFA | VNTINRNRTL | LPNTTLTYDT | QKINLYDSFE | ASKKACDQLS | ||||
LGVAAIFGPS | HSSSANAVQS | ICNALGVPHI | QTRWKHQVSD | NKDSFYVSLY | ||||
PDFSSLSRAI | LDLVQFFKWK | TVTVVYDDST | GLIRLQELIK | APSRYNLRLK | ||||
IRQLPADTKD | AKPLLKEMKR | GKEFHVIFDC | SHEMAAGILK | QALAMGMMTE | ||||
YYHYIFTTLD | LFALDVEPYR | YSGVNMTGFR | ILNTENTQVS | SIIEKWSMER | ||||
LQAPPKPDSG | LLDGFMTTDA | ALMYDAVHVV | SVAVQQFPQM | TVSSLQCNRH | ||||
KPWRFGTRFM | SLIKEAHWEG | LTGRITFNKT | NGLRTDFDLD | VISLKEEGLE | ||||
KIGTWDPASG | LNMTESQKGK | PANITDSLSN | RSLIVTTILE | EPYVLFKKSD | ||||
KPLYGNDRFE | GYCIDLLREL | STILGFTYEI | RLVEDGKYGA | QDDANGQWNG | ||||
MVRELIDHKA | DLAVAPLAIT | YVREKVIDFS | KPFMTLGISI | LYRKPNGTNP | ||||
GVFSFLNPLS | PDIWMYILLA | YLGVSCVLFV | IARFSPYEWY | NPHPCNPDSD | ||||
VVENNFTLLN | SFWFGVGALM | QQGSELMPKA | LSTRIVGGIW | WFFTLIIISS | ||||
YTANLAAFLT | VERMESPIDS | ADDLAKQTKI | EYGAVEDGAT | MTFFKKSKIS | ||||
TYDKMWAFMS | SRRQSVLVKS | NEEGIQRVLT | SDYAFLMEST | TIEFVTQRNC | ||||
NLTQIGGLID | SKGYGVGTPM | GSPYRDKITI | AILQLQEEGK | LHMMKEKWWR | ||||
GNGCPEEESK | EASALGVQNI | GGIFIVLAAG | LVLSVFVAVG | EFLYKSKKNA | ||||
QLEKRSFCSA | MVEELRMSLK | CQRRLKHKPQ | APVIVKTEEV | INMHTFNDRR | ||||
LPGKETMA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Paschen W., Blackstone C.D., Huganir R.L., Ross C.A. (1994). Human GluR6 kainate receptor (GRIK2): molecular cloning, expression, polymorphism, and chromosomal assignment. Genomics. 20: 435—440. PMID 8034316 DOI:10.1006/geno.1994.1198
- Barbon A., Vallini I., Barlati S. (2001). Genomic organization of the human GRIK2 gene and characterization of multiple splicing variants. Gene. 274: 187—197. PMID 11675011 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00611-4
- Wilkinson K.A., Konopacki F., Henley J.M. (2012). Modification and movement: Phosphorylation and SUMOylation regulate endocytosis of GluK2-containing kainate receptors. Commun. Integr. Biol. 5: 223—226. PMID 22808340 DOI:10.4161/cib.19195
- Paschen W., Hedreen J.C., Ross C.A. (1994). RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue. J. Neurochem. 63: 1596—1602. PMID 7523595
- Nutt S.L., Kamboj R.K. (1994). RNA editing of human kainate receptor subunits. NeuroReport. 5: 2625—2629. PMID 7696618
Примітки
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GRIK2 angl Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 908 aminokislot a molekulyarna masa 102 583 GRIK2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3QXM 5CMMIdentifikatoriSimvoliGRIK2 EAA4 GLR6 GLUK6 GLUR6 GluK2 MRT6 glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 NEDLASZovnishni ID OMIM 138244 MGI 95815 HomoloGene 40717 GeneCards GRIK2Reaguye na spolukuselurampanel topiramat Ontologiya genaMolekulyarna funkciya glutamate receptor activity PDZ domain binding kainate selective glutamate receptor activity protein homodimerization activity ion channel activity ionotropic glutamate receptor activity identical protein binding ligand gated ion channel activity extracellularly glutamate gated ion channel activity signaling receptor activity ubiquitin conjugating enzyme binding ubiquitin protein ligase binding ligand gated ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential transmitter gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potentialKlitinna komponenta integral component of membrane perikarion postsynaptic membrane membrana klitinna membrana sinaps integral component of plasma membrane mizhklitinni kontakti terminal bouton akson dendrit nejrobiologiya dendrite cytoplasm ionotropic glutamate receptor complex GO 0097483 GO 0097481 postsinaptichne ushilnennya kainate selective glutamate receptor complex presynaptic membrane neuronal cell body hippocampal mossy fiber to CA3 synapse glutamatergic synapseBiologichnij proces neuron apoptotic process glutamate receptor signaling pathway modulation of chemical synaptic transmission ion transport receptor clustering ion transmembrane transport positive regulation of neuron apoptotic process regulation of JNK cascade ionotropic glutamate receptor signaling pathway positive regulation of synaptic transmission excitatory postsynaptic potential negative regulation of synaptic transmission glutamatergic chemical synaptic transmission behavioral fear response cellular calcium ion homeostasis intracellular protein transport neuronal action potential synaptic transmission glutamatergic regulation of membrane potential GO 1904089 negative regulation of neuron apoptotic process regulation of long term neuronal synaptic plasticity regulation of short term neuronal synaptic plasticity Galmivnij postsinaptichnij potencial regulation of presynaptic membrane potentialDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2898 14806Ensembl ENSG00000164418 ENSMUSG00000056073UniProt Q13002 P39087RefSeq mRNK NM 001166247 NM 021956 NM 175768NM 001111268 NM 010349RefSeq bilok NP 001159719 NP 068775 NP 786944NP 001104738 NP 034479 NP 001345795Lokus UCSC Hr 6 100 96 102 08 MbHr 10 49 09 49 79 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKIIFPILSNPVFRRTVKLLLCLLWIGYSQGTTHVLRFGGIFEYVESGPM GAEELAFRFAVNTINRNRTLLPNTTLTYDTQKINLYDSFEASKKACDQLS LGVAAIFGPSHSSSANAVQSICNALGVPHIQTRWKHQVSDNKDSFYVSLY PDFSSLSRAILDLVQFFKWKTVTVVYDDSTGLIRLQELIKAPSRYNLRLK IRQLPADTKDAKPLLKEMKRGKEFHVIFDCSHEMAAGILKQALAMGMMTE YYHYIFTTLDLFALDVEPYRYSGVNMTGFRILNTENTQVSSIIEKWSMER LQAPPKPDSGLLDGFMTTDAALMYDAVHVVSVAVQQFPQMTVSSLQCNRH KPWRFGTRFMSLIKEAHWEGLTGRITFNKTNGLRTDFDLDVISLKEEGLE KIGTWDPASGLNMTESQKGKPANITDSLSNRSLIVTTILEEPYVLFKKSD KPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDANGQWNG MVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKPNGTNP GVFSFLNPLSPDIWMYILLAYLGVSCVLFVIARFSPYEWYNPHPCNPDSD VVENNFTLLNSFWFGVGALMQQGSELMPKALSTRIVGGIWWFFTLIIISS YTANLAAFLTVERMESPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKIS TYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNC NLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWR GNGCPEEESKEASALGVQNIGGIFIVLAAGLVLSVFVAVGEFLYKSKKNA QLEKRSFCSAMVEELRMSLKCQRRLKHKPQAPVIVKTEEVINMHTFNDRR LPGKETMA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv ionnih kanaliv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport ioniv transport alternativnij splajsing Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani klitinnih kontaktah sinapsah LiteraturaPaschen W Blackstone C D Huganir R L Ross C A 1994 Human GluR6 kainate receptor GRIK2 molecular cloning expression polymorphism and chromosomal assignment Genomics 20 435 440 PMID 8034316 DOI 10 1006 geno 1994 1198 Barbon A Vallini I Barlati S 2001 Genomic organization of the human GRIK2 gene and characterization of multiple splicing variants Gene 274 187 197 PMID 11675011 DOI 10 1016 S0378 1119 01 00611 4 Wilkinson K A Konopacki F Henley J M 2012 Modification and movement Phosphorylation and SUMOylation regulate endocytosis of GluK2 containing kainate receptors Commun Integr Biol 5 223 226 PMID 22808340 DOI 10 4161 cib 19195 Paschen W Hedreen J C Ross C A 1994 RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue J Neurochem 63 1596 1602 PMID 7523595 Nutt S L Kamboj R K 1994 RNA editing of human kainate receptor subunits NeuroReport 5 2625 2629 PMID 7696618PrimitkiSpoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 29 grudnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 2 sichnya 2018 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi