GCFC2 (англ. GC-rich sequence DNA-binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 89 385.
GCFC2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GCFC2, C2orf3, DNABF, GCF, TCF9, GC-rich sequence DNA-binding factor 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 189901 MGI: 2141656 HomoloGene: 2411 GeneCards: GCFC2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 75.65 – 75.71 Mb | Хр. 6: 81.92 – 81.96 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAHRPKRTFR | QRAADSSDSD | GAEESPAEPG | APRELPVPGS | AEEEPPSGGG | ||||
RAQVAGLPHR | VRGPRGRGRV | WASSRRATKA | APRADEGSES | RTLDVSTDEE | ||||
DKIHHSSESK | DDQGLSSDSS | SSLGEKELSS | TVKIPDAAFI | QAARRKRELA | ||||
RAQDDYISLD | VQHTSSISGM | KRESEDDPES | EPDDHEKRIP | FTLRPQTLRQ | ||||
RMAEESISRN | EETSEESQED | EKQDTWEQQQ | MRKAVKIIEE | RDIDLSCGNG | ||||
SSKVKKFDTS | ISFPPVNLEI | IKKQLNTRLT | LLQETHRSHL | REYEKYVQDV | ||||
KSSKSTIQNL | ESSSNQALNC | KFYKSMKIYV | ENLIDCLNEK | IINIQEIESS | ||||
MHALLLKQAM | TFMKRRQDEL | KHESTYLQQL | SRKDETSTSG | NFSVDEKTQW | ||||
ILEEIESRRT | KRRQARVLSG | NCNHQEGTSS | DDELPSAEMI | DFQKSQGDIL | ||||
QKQKKVFEEV | QDDFCNIQNI | LLKFQQWREK | FPDSYYEAFI | SLCIPKLLNP | ||||
LIRVQLIDWN | PLKLESTGLK | EMPWFKSVEE | FMDSSVEDSK | KESSSDKKVL | ||||
SAIINKTIIP | RLTDFVEFLW | DPLSTSQTTS | LITHCRVILE | EHSTCENEVS | ||||
KSRQDLLKSI | VSRMKKAVED | DVFIPLYPKS | AVENKTSPHS | KFQERQFWSG | ||||
LKLFRNILLW | NGLLTDDTLQ | ELGLGKLLNR | YLIIALLNAT | PGPDVVKKCN | ||||
QVAACLPEKW | FENSAMRTSI | PQLENFIQFL | LQSAHKLSRS | EFRDEVEEII | ||||
LILVKIKALN | QAESFIGEHH | LDHLKSLIKE | D |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Kageyama R., Pastan I. (1989). Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that represses transcription. Cell. 59: 815—825. PMID 2556218 DOI:10.1016/0092-8674(89)90605-3
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yoshimoto R., Okawa K., Yoshida M., Ohno M., Kataoka N. (2014). Identification of a novel component C2ORF3 in the lariat-intron complex: lack of C2ORF3 interferes with pre-mRNA splicing via intron turnover pathway. Genes Cells. 19: 78—87. PMID 24304693 DOI:10.1111/gtc.12114
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1317 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GCFC2 angl GC rich sequence DNA binding factor 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 781 aminokislot a molekulyarna masa 89 385 GCFC2IdentifikatoriSimvoliGCFC2 C2orf3 DNABF GCF TCF9 GC rich sequence DNA binding factor 2Zovnishni ID OMIM 189901 MGI 2141656 HomoloGene 2411 GeneCards GCFC2Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding DNA binding GO 0001078 GO 0001214 GO 0001206 DNA binding transcription repressor activity RNA polymerase II specific GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta yaderce klitinne yadro U2 type post mRNA release spliceosomal complex nukleoplazma gialoplazmaBiologichnij proces mRNA processing spliceosomal complex assembly GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0009373 regulation of transcription DNA templated GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated Splajsing RNK mRNA splicing via spliceosomeDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6936 330361Ensembl ENSG00000005436 ENSMUSG00000035125UniProt P16383 Q8BKT3RefSeq mRNK NM 001201334 NM 001201335 NM 003203NM 177884RefSeq bilok NP 001188263 NP 001188264 NP 003194NP 808552Lokus UCSC Hr 2 75 65 75 71 MbHr 6 81 92 81 96 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAHRPKRTFRQRAADSSDSDGAEESPAEPGAPRELPVPGSAEEEPPSGGG RAQVAGLPHRVRGPRGRGRVWASSRRATKAAPRADEGSESRTLDVSTDEE DKIHHSSESKDDQGLSSDSSSSLGEKELSSTVKIPDAAFIQAARRKRELA RAQDDYISLDVQHTSSISGMKRESEDDPESEPDDHEKRIPFTLRPQTLRQ RMAEESISRNEETSEESQEDEKQDTWEQQQMRKAVKIIEERDIDLSCGNG SSKVKKFDTSISFPPVNLEIIKKQLNTRLTLLQETHRSHLREYEKYVQDV KSSKSTIQNLESSSNQALNCKFYKSMKIYVENLIDCLNEKIINIQEIESS MHALLLKQAMTFMKRRQDELKHESTYLQQLSRKDETSTSGNFSVDEKTQW ILEEIESRRTKRRQARVLSGNCNHQEGTSSDDELPSAEMIDFQKSQGDIL QKQKKVFEEVQDDFCNIQNILLKFQQWREKFPDSYYEAFISLCIPKLLNP LIRVQLIDWNPLKLESTGLKEMPWFKSVEEFMDSSVEDSKKESSSDKKVL SAIINKTIIPRLTDFVEFLWDPLSTSQTTSLITHCRVILEEHSTCENEVS KSRQDLLKSIVSRMKKAVEDDVFIPLYPKSAVENKTSPHSKFQERQFWSG LKLFRNILLWNGLLTDDTLQELGLGKLLNRYLIIALLNATPGPDVVKKCN QVAACLPEKWFENSAMRTSIPQLENFIQFLLQSAHKLSRSEFRDEVEEII LILVKIKALNQAESFIGEHHLDHLKSLIKED A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK transkripciya regulyaciya transkripciyi polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaKageyama R Pastan I 1989 Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that represses transcription Cell 59 815 825 PMID 2556218 DOI 10 1016 0092 8674 89 90605 3 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Yoshimoto R Okawa K Yoshida M Ohno M Kataoka N 2014 Identification of a novel component C2ORF3 in the lariat intron complex lack of C2ORF3 interferes with pre mRNA splicing via intron turnover pathway Genes Cells 19 78 87 PMID 24304693 DOI 10 1111 gtc 12114PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 1317 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 23 veresnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi