Гліцил-тРНК-синтаза (англ. Glycyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном GARS, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 83 166.
Гліцил-тРНК-синтаза | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GARS1, CMT2D, DSMAV, GlyRS, HMN5, SMAD1, glycyl-tRNA synthetase, GARS, glycyl-tRNA synthetase 1, HMN5A, SMAJI | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600287 MGI: 2449057 HomoloGene: 1547 GeneCards: GARS1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Charcot-Marie-Tooth disease type 2D, Distal hereditary motor neuropathy type V, distal hereditary motor neuronopathy type 5 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 30.58 – 30.63 Mb | Хр. 6: 55.01 – 55.06 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPSPRPVLLR | GARAALLLLL | PPRLLARPSL | LLRRSLSAAS | CPPISLPAAA | ||||
SRSSMDGAGA | EEVLAPLRLA | VRQQGDLVRK | LKEDKAPQVD | VDKAVAELKA | ||||
RKRVLEAKEL | ALQPKDDIVD | RAKMEDTLKR | RFFYDQAFAI | YGGVSGLYDF | ||||
GPVGCALKNN | IIQTWRQHFI | QEEQILEIDC | TMLTPEPVLK | TSGHVDKFAD | ||||
FMVKDVKNGE | CFRADHLLKA | HLQKLMSDKK | CSVEKKSEME | SVLAQLDNYG | ||||
QQELADLFVN | YNVKSPITGN | DLSPPVSFNL | MFKTFIGPGG | NMPGYLRPET | ||||
AQGIFLNFKR | LLEFNQGKLP | FAAAQIGNSF | RNEISPRSGL | IRVREFTMAE | ||||
IEHFVDPSEK | DHPKFQNVAD | LHLYLYSAKA | QVSGQSARKM | RLGDAVEQGV | ||||
INNTVLGYFI | GRIYLYLTKV | GISPDKLRFR | QHMENEMAHY | ACDCWDAESK | ||||
TSYGWIEIVG | CADRSCYDLS | CHARATKVPL | VAEKPLKEPK | TVNVVQFEPS | ||||
KGAIGKAYKK | DAKLVMEYLA | ICDECYITEM | EMLLNEKGEF | TIETEGKTFQ | ||||
LTKDMINVKR | FQKTLYVEEV | VPNVIEPSFG | LGRIMYTVFE | HTFHVREGDE | ||||
QRTFFSFPAV | VAPFKCSVLP | LSQNQEFMPF | VKELSEALTR | HGVSHKVDDS | ||||
SGSIGRRYAR | TDEIGVAFGV | TIDFDTVNKT | PHTATLRDRD | SMRQIRAEIS | ||||
ELPSIVQDLA | NGNITWADVE | ARYPLFEGQE | TGKKETIEE |
Цей білок за функціями належить до гідролаз, лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках. Також секретований назовні.
Література
- Williams J.H., Osvath S.R., Khong T.-F., Pearse M.J., Power D.A. (1995). Cloning, sequencing and bacterial expression of human glycine tRNA synthetase. Nucleic Acids Res. 23: 1307—1310. PMID 7753621 DOI:10.1093/nar/23.8.1307
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Xie W., Nangle L.A., Zhang W., Schimmel P., Yang X.-L. (2007). Long-range structural effects of a Charcot-Marie-Tooth disease-causing mutation in human glycyl-tRNA synthetase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 9976—9981. PMID 17545306 DOI:10.1073/pnas.0703908104
- Guo R.-T., Chong Y.E., Guo M., Yang X.-L. (2009). Crystal structures and biochemical analyses suggest a unique mechanism and role for human glycyl-tRNA synthetase in Ap4A homeostasis. J. Biol. Chem. 284: 28968—28976. PMID 19710017 DOI:10.1074/jbc.M109.030692
- Shiba K., Schimmel P., Motegi H., Noda T. (1994). Human glycyl-tRNA synthetase. Wide divergence of primary structure from bacterial counterpart and species-specific aminoacylation. J. Biol. Chem. 269: 30049—30055. PMID 7962006
- Ge Q., Trieu E.P., Targoff I.N. (1994). Primary structure and functional expression of human glycyl-tRNA synthetase, an autoantigen in myositis. J. Biol. Chem. 269: 28790—28797. PMID 7961834
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з Гліцил-тРНК-синтаза переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4162 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Glicil tRNK sintaza angl Glycyl tRNA synthetase bilok yakij koduyetsya genom GARS roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 739 aminokislot a molekulyarna masa 83 166 Glicil tRNK sintazaNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2PME 2PMF 2Q5H 2Q5I 2ZT5 2ZT6 2ZT7 2ZT8 2ZXF 4KQE 4KR2 4QEI 5E6MIdentifikatoriSimvoliGARS1 CMT2D DSMAV GlyRS HMN5 SMAD1 glycyl tRNA synthetase GARS glycyl tRNA synthetase 1 HMN5A SMAJIZovnishni ID OMIM 600287 MGI 2449057 HomoloGene 1547 GeneCards GARS1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaCharcot Marie Tooth disease type 2D Distal hereditary motor neuropathy type V distal hereditary motor neuronopathy type 5 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya aminoacyl tRNA ligase activity nucleotide binding ligase activity protein dimerization activity ATP binding bis 5 nucleosyl tetraphosphatase asymmetrical activity hydrolase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding glycine tRNA ligase activity transferase activityKlitinna komponenta akson mitohondrialnij matriks cell projection secretory granule gialoplazma ekzosoma extracellular region citoplazma mitohondriyaBiologichnij proces diadenosine tetraphosphate biosynthetic process Biosintez bilkiv glycyl tRNA aminoacylation mitochondrial glycyl tRNA aminoacylation tRNA aminoacylation for protein translationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2617 353172Ensembl ENSG00000106105 ENSMUSG00000029777UniProt P41250 Q9CZD3RefSeq mRNK NM 002047 NM 001316772NM 180678RefSeq bilok NP 001303701 NP 002038NP 851009Lokus UCSC Hr 7 30 58 30 63 MbHr 6 55 01 55 06 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPSPRPVLLRGARAALLLLLPPRLLARPSLLLRRSLSAASCPPISLPAAA SRSSMDGAGAEEVLAPLRLAVRQQGDLVRKLKEDKAPQVDVDKAVAELKA RKRVLEAKELALQPKDDIVDRAKMEDTLKRRFFYDQAFAIYGGVSGLYDF GPVGCALKNNIIQTWRQHFIQEEQILEIDCTMLTPEPVLKTSGHVDKFAD FMVKDVKNGECFRADHLLKAHLQKLMSDKKCSVEKKSEMESVLAQLDNYG QQELADLFVNYNVKSPITGNDLSPPVSFNLMFKTFIGPGGNMPGYLRPET AQGIFLNFKRLLEFNQGKLPFAAAQIGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAE IEHFVDPSEKDHPKFQNVADLHLYLYSAKAQVSGQSARKMRLGDAVEQGV INNTVLGYFIGRIYLYLTKVGISPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESK TSYGWIEIVGCADRSCYDLSCHARATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPS KGAIGKAYKKDAKLVMEYLAICDECYITEMEMLLNEKGEFTIETEGKTFQ LTKDMINVKRFQKTLYVEEVVPNVIEPSFGLGRIMYTVFEHTFHVREGDE QRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRHGVSHKVDDS SGSIGRRYARTDEIGVAFGVTIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEIS ELPSIVQDLANGNITWADVEARYPLFEGQETGKKETIEE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Cej bilok za funkciyami nalezhit do gidrolaz ligaz aminoacil tRNK sintetaz Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak biosintez bilka Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u citoplazmi klitinnih vidrostkah Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaWilliams J H Osvath S R Khong T F Pearse M J Power D A 1995 Cloning sequencing and bacterial expression of human glycine tRNA synthetase Nucleic Acids Res 23 1307 1310 PMID 7753621 DOI 10 1093 nar 23 8 1307 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Xie W Nangle L A Zhang W Schimmel P Yang X L 2007 Long range structural effects of a Charcot Marie Tooth disease causing mutation in human glycyl tRNA synthetase Proc Natl Acad Sci U S A 104 9976 9981 PMID 17545306 DOI 10 1073 pnas 0703908104 Guo R T Chong Y E Guo M Yang X L 2009 Crystal structures and biochemical analyses suggest a unique mechanism and role for human glycyl tRNA synthetase in Ap4A homeostasis J Biol Chem 284 28968 28976 PMID 19710017 DOI 10 1074 jbc M109 030692 Shiba K Schimmel P Motegi H Noda T 1994 Human glycyl tRNA synthetase Wide divergence of primary structure from bacterial counterpart and species specific aminoacylation J Biol Chem 269 30049 30055 PMID 7962006 Ge Q Trieu E P Targoff I N 1994 Primary structure and functional expression of human glycyl tRNA synthetase an autoantigen in myositis J Biol Chem 269 28790 28797 PMID 7961834PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z Glicil tRNK sintaza pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 4162 angl Procitovano 21 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 18 serpnya 2017 Procitovano 21 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 7 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi