GAD1 (англ. Glutamate decarboxylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 66 897.
GAD1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | GAD1, CPSQ1, GAD, SCP, glutamate decarboxylase 1, DEE89 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605363 MGI: 95632 HomoloGene: 635 GeneCards: GAD1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 170.81 – 170.86 Mb | Хр. 2: 70.38 – 70.43 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASSTPSSSA | TSSNAGADPN | TTNLRPTTYD | TWCGVAHGCT | RKLGLKICGF | ||||
LQRTNSLEEK | SRLVSAFKER | QSSKNLLSCE | NSDRDARFRR | TETDFSNLFA | ||||
RDLLPAKNGE | EQTVQFLLEV | VDILLNYVRK | TFDRSTKVLD | FHHPHQLLEG | ||||
MEGFNLELSD | HPESLEQILV | DCRDTLKYGV | RTGHPRFFNQ | LSTGLDIIGL | ||||
AGEWLTSTAN | TNMFTYEIAP | VFVLMEQITL | KKMREIVGWS | SKDGDGIFSP | ||||
GGAISNMYSI | MAARYKYFPE | VKTKGMAAVP | KLVLFTSEQS | HYSIKKAGAA | ||||
LGFGTDNVIL | IKCNERGKII | PADFEAKILE | AKQKGYVPFY | VNATAGTTVY | ||||
GAFDPIQEIA | DICEKYNLWL | HVDAAWGGGL | LMSRKHRHKL | NGIERANSVT | ||||
WNPHKMMGVL | LQCSAILVKE | KGILQGCNQM | CAGYLFQPDK | QYDVSYDTGD | ||||
KAIQCGRHVD | IFKFWLMWKA | KGTVGFENQI | NKCLELAEYL | YAKIKNREEF | ||||
EMVFNGEPEH | TNVCFWYIPQ | SLRGVPDSPQ | RREKLHKVAP | KIKALMMESG | ||||
TTMVGYQPQG | DKANFFRMVI | SNPAATQSDI | DFLIEEIERL | GQDL |
Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.
Література
- Bu D.-F., Tobin A.J. (1994). The exon-intron organization of the genes (GAD1 and GAD2) encoding two human glutamate decarboxylases (GAD67 and GAD65) suggests that they derive from a common ancestral GAD. Genomics. 21: 222—228. PMID 8088791 DOI:10.1006/geno.1994.1246
- Kelly C.D., Carter N.D., Johnstone A.P., Nussey S.S. (1991). Cloning of large isoform of human brain glutamic acid decarboxylase. Lancet. 338: 1468—1469. PMID 1683462 DOI:10.1016/0140-6736(91)92780-6
- Yamashita K., Cram D.S., Harrison L.C. (1993). Molecular cloning of full-length glutamic acid decarboxylase 67 from human pancreas and islets. Biochem. Biophys. Res. Commun. 192: 1347—1352. PMID 8507202 DOI:10.1006/bbrc.1993.1564
- Chessler S.D., Lernmark A. (2000). Alternative splicing of GAD67 results in the synthesis of a third form of glutamic-acid decarboxylase in human islets and other non-neural tissues. J. Biol. Chem. 275: 5188—5192. PMID 10671565 DOI:10.1074/jbc.275.7.5188
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cram D.S., Barnett L.D., Joseph J.L., Harrison L.C. (1991). Cloning and partial nucleotide sequence of human glutamic acid decarboxylase cDNA from brain and pancreatic islets. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176: 1239—1244. PMID 2039509 DOI:10.1016/0006-291X(91)90418-7
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4092 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
GAD1 angl Glutamate decarboxylase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 594 aminokislot a molekulyarna masa 66 897 GAD1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2OKJ 3VP6IdentifikatoriSimvoliGAD1 CPSQ1 GAD SCP glutamate decarboxylase 1 DEE89Zovnishni ID OMIM 605363 MGI 95632 HomoloGene 635 GeneCards GAD1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding katalitichna aktivnist lyase activity protein heterodimerization activity pyridoxal phosphate binding carboxy lyase activity glutamate binding glutamate decarboxylase activity protein N terminus bindingKlitinna komponenta vesicle membrane klitinna membrana clathrin sculpted gamma aminobutyric acid transport vesicle membrane vnutrishnoklitinnij presynaptic active zone citoplazma cell cortex akson axon terminus neuron projection terminus sinaps inhibitory synapseBiologichnij proces gamma aminobutyric acid biosynthetic process glutamate catabolic process carboxylic acid metabolic process neurotransmitter biosynthetic process protein pyridoxal 5 phosphate linkage glutamate decarboxylation to succinate chemical synaptic transmission socialna povedinka locomotory exploration behavior GO 0010554 neurotransmitter secretionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez2571 14415Ensembl ENSG00000128683 ENSMUSG00000070880UniProt Q99259 P48318RefSeq mRNK NM 000817 NM 013445NM 008077 NM 001312900RefSeq bilok NP 000808 NP 038473NP 001299829 NP 032103Lokus UCSC Hr 2 170 81 170 86 MbHr 2 70 38 70 43 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MASSTPSSSATSSNAGADPNTTNLRPTTYDTWCGVAHGCTRKLGLKICGF LQRTNSLEEKSRLVSAFKERQSSKNLLSCENSDRDARFRRTETDFSNLFA RDLLPAKNGEEQTVQFLLEVVDILLNYVRKTFDRSTKVLDFHHPHQLLEG MEGFNLELSDHPESLEQILVDCRDTLKYGVRTGHPRFFNQLSTGLDIIGL AGEWLTSTANTNMFTYEIAPVFVLMEQITLKKMREIVGWSSKDGDGIFSP GGAISNMYSIMAARYKYFPEVKTKGMAAVPKLVLFTSEQSHYSIKKAGAA LGFGTDNVILIKCNERGKIIPADFEAKILEAKQKGYVPFYVNATAGTTVY GAFDPIQEIADICEKYNLWLHVDAAWGGGLLMSRKHRHKLNGIERANSVT WNPHKMMGVLLQCSAILVKEKGILQGCNQMCAGYLFQPDKQYDVSYDTGD KAIQCGRHVDIFKFWLMWKAKGTVGFENQINKCLELAEYLYAKIKNREEF EMVFNGEPEHTNVCFWYIPQSLRGVPDSPQRREKLHKVAPKIKALMMESG TTMVGYQPQGDKANFFRMVISNPAATQSDIDFLIEEIERLGQDL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do liaz dekarboksilaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak polimorfizm alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z piridoksal fosfatom LiteraturaBu D F Tobin A J 1994 The exon intron organization of the genes GAD1 and GAD2 encoding two human glutamate decarboxylases GAD67 and GAD65 suggests that they derive from a common ancestral GAD Genomics 21 222 228 PMID 8088791 DOI 10 1006 geno 1994 1246 Kelly C D Carter N D Johnstone A P Nussey S S 1991 Cloning of large isoform of human brain glutamic acid decarboxylase Lancet 338 1468 1469 PMID 1683462 DOI 10 1016 0140 6736 91 92780 6 Yamashita K Cram D S Harrison L C 1993 Molecular cloning of full length glutamic acid decarboxylase 67 from human pancreas and islets Biochem Biophys Res Commun 192 1347 1352 PMID 8507202 DOI 10 1006 bbrc 1993 1564 Chessler S D Lernmark A 2000 Alternative splicing of GAD67 results in the synthesis of a third form of glutamic acid decarboxylase in human islets and other non neural tissues J Biol Chem 275 5188 5192 PMID 10671565 DOI 10 1074 jbc 275 7 5188 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Cram D S Barnett L D Joseph J L Harrison L C 1991 Cloning and partial nucleotide sequence of human glutamic acid decarboxylase cDNA from brain and pancreatic islets Biochem Biophys Res Commun 176 1239 1244 PMID 2039509 DOI 10 1016 0006 291X 91 90418 7PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 4092 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi