Ця стаття потребує додаткових для поліпшення її . (вересень 2015) |
G-квадруплекс, G4 — тип чотирьохланцюжкової структури, яку можуть сформувати нуклеїнові кислоти, багаті на гуанін (також відомо як G-тетради або G4-ДНК). Вони складаються із пласких квадратних структур (тетрад), складених із залишків гуаніну, стабілізованих за допомогою водневих зв'язків. Вони можуть бути ще сильніше стабілізовані за допомогою моновалентного катіону (особливо калію) в центрі тетрад. Ці структури можуть формуватися ДНК, РНК, (LNA) і (PNA), і можуть бути внутрішньомолекулярними, бімолекулярними і тетрамолекулярними. Залежно від напряму ланцюжків, що формують тетради, структура може бути «паралельною» або «антипаралельною». Цікавим є те, що G-квадруплекси можуть знаходитись в регуляторних ділянках генів, таких як сайти сплайсингу чи [en].
Для реплікації квадруплексів необхідні такі фактори, як FANCJ (англ. helicase Fanconi anaemia group J), полімераза REV1 та праймаза-полімераза PrimPol.
У 2015 році було створено методику G4-seq, яка дозволяє вивчити розміщення G-квадруплексів у геномі і засновується на принципі пауз, які робить ДНК-полімераза при проходженні ділянки, що містить квадруплекс. Ці паузи потім можна відстежити за допомогою секвенування. При аналізі лейкоцитів людини за допомогою цієї методики встановлено, що ДНК лейкоцитів містить більше ніж 500 тисяч G4 структур. Причому через наявність в них нерегулярностей та неканонічних для G4-структур послідовностей, таких як довгі шпильки, до 70% знайдених квадруплексів не можна було вирахувати за допомогою комп'ютерного моделювання.
Примітки
- Zlotorynski Eytan (2015). Technique: Mapping DNA G-quadruplex structures. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 16 (9): 518—518. doi:10.1038/nrm4052. ISSN 1471-0072.
- Zlotorynski, Eytan (2015). DNA replication: Quad-jumping. Nature Reviews Genetics. 17 (2): 67—67. doi:10.1038/nrg.2015.24. ISSN 1471-0056.
- Chambers Vicki S, Marsico Giovanni, Boutell Jonathan M та ін. (2015). High-throughput sequencing of DNA G-quadruplex structures in the human genome. Nature Biotechnology. 33 (8): 877—881. doi:10.1038/nbt.3295. ISSN 1087-0156.
{{}}
: Явне використання «та ін.» у:|author=
()
Це незавершена стаття з молекулярної біології. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Cya stattya potrebuye dodatkovih posilan na dzherela dlya polipshennya yiyi perevirnosti Bud laska dopomozhit udoskonaliti cyu stattyu dodavshi posilannya na nadijni avtoritetni dzherela Zvernitsya na storinku obgovorennya za poyasnennyami ta dopomozhit vipraviti nedoliki Material bez dzherel mozhe buti piddano sumnivu ta vilucheno veresen 2015 G kvadrupleks G4 tip chotirohlancyuzhkovoyi strukturi yaku mozhut sformuvati nukleyinovi kisloti bagati na guanin takozh vidomo yak G tetradi abo G4 DNK Voni skladayutsya iz plaskih kvadratnih struktur tetrad skladenih iz zalishkiv guaninu stabilizovanih za dopomogoyu vodnevih zv yazkiv Voni mozhut buti she silnishe stabilizovani za dopomogoyu monovalentnogo kationu osoblivo kaliyu v centri tetrad Ci strukturi mozhut formuvatisya DNK RNK LNA i PNA i mozhut buti vnutrishnomolekulyarnimi bimolekulyarnimi i tetramolekulyarnimi Zalezhno vid napryamu lancyuzhkiv sho formuyut tetradi struktura mozhe buti paralelnoyu abo antiparalelnoyu Cikavim ye te sho G kvadrupleksi mozhut znahoditis v regulyatornih dilyankah geniv takih yak sajti splajsingu chi en Struktura G kvadrupleksa Livoruch G tetrada Pravoruch vnutrishnomolekulyarnij G kvadrupleks Dlya replikaciyi kvadrupleksiv neobhidni taki faktori yak FANCJ angl helicase Fanconi anaemia group J polimeraza REV1 ta prajmaza polimeraza PrimPol U 2015 roci bulo stvoreno metodiku G4 seq yaka dozvolyaye vivchiti rozmishennya G kvadrupleksiv u genomi i zasnovuyetsya na principi pauz yaki robit DNK polimeraza pri prohodzhenni dilyanki sho mistit kvadrupleks Ci pauzi potim mozhna vidstezhiti za dopomogoyu sekvenuvannya Pri analizi lejkocitiv lyudini za dopomogoyu ciyeyi metodiki vstanovleno sho DNK lejkocitiv mistit bilshe nizh 500 tisyach G4 struktur Prichomu cherez nayavnist v nih neregulyarnostej ta nekanonichnih dlya G4 struktur poslidovnostej takih yak dovgi shpilki do 70 znajdenih kvadrupleksiv ne mozhna bulo virahuvati za dopomogoyu komp yuternogo modelyuvannya PrimitkiZlotorynski Eytan 2015 Technique Mapping DNA G quadruplex structures Nature Reviews Molecular Cell Biology 16 9 518 518 doi 10 1038 nrm4052 ISSN 1471 0072 Zlotorynski Eytan 2015 DNA replication Quad jumping Nature Reviews Genetics 17 2 67 67 doi 10 1038 nrg 2015 24 ISSN 1471 0056 Chambers Vicki S Marsico Giovanni Boutell Jonathan M ta in 2015 High throughput sequencing of DNA G quadruplex structures in the human genome Nature Biotechnology 33 8 877 881 doi 10 1038 nbt 3295 ISSN 1087 0156 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite journal title Shablon Cite journal cite journal a Yavne vikoristannya ta in u author dovidka Ce nezavershena stattya z molekulyarnoyi biologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi