DNMT3B (англ. DNA methyltransferase 3 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 853 амінокислот, а молекулярна маса — 95 751.
DNMT3B | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | DNMT3B, ICF, ICF1, M.HsaIIIB, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta, DNA methyltransferase 3 beta, FSHD4 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602900 MGI: 1261819 HomoloGene: 56000 GeneCards: DNMT3B | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
запальні захворювання кишківника, immunodeficiency-centromeric instability-facial anomalies syndrome | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 20: 32.76 – 32.81 Mb | Хр. 2: 153.49 – 153.53 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKGDTRHLNG | EEDAGGREDS | ILVNGACSDQ | SSDSPPILEA | IRTPEIRGRR | ||||
SSSRLSKREV | SSLLSYTQDL | TGDGDGEDGD | GSDTPVMPKL | FRETRTRSES | ||||
PAVRTRNNNS | VSSRERHRPS | PRSTRGRQGR | NHVDESPVEF | PATRSLRRRA | ||||
TASAGTPWPS | PPSSYLTIDL | TDDTEDTHGT | PQSSSTPYAR | LAQDSQQGGM | ||||
ESPQVEADSG | DGDSSEYQDG | KEFGIGDLVW | GKIKGFSWWP | AMVVSWKATS | ||||
KRQAMSGMRW | VQWFGDGKFS | EVSADKLVAL | GLFSQHFNLA | TFNKLVSYRK | ||||
AMYHALEKAR | VRAGKTFPSS | PGDSLEDQLK | PMLEWAHGGF | KPTGIEGLKP | ||||
NNTQPVVNKS | KVRRAGSRKL | ESRKYENKTR | RRTADDSATS | DYCPAPKRLK | ||||
TNCYNNGKDR | GDEDQSREQM | ASDVANNKSS | LEDGCLSCGR | KNPVSFHPLF | ||||
EGGLCQTCRD | RFLELFYMYD | DDGYQSYCTV | CCEGRELLLC | SNTSCCRCFC | ||||
VECLEVLVGT | GTAAEAKLQE | PWSCYMCLPQ | RCHGVLRRRK | DWNVRLQAFF | ||||
TSDTGLEYEA | PKLYPAIPAA | RRRPIRVLSL | FDGIATGYLV | LKELGIKVGK | ||||
YVASEVCEES | IAVGTVKHEG | NIKYVNDVRN | ITKKNIEEWG | PFDLVIGGSP | ||||
CNDLSNVNPA | RKGLYEGTGR | LFFEFYHLLN | YSRPKEGDDR | PFFWMFENVV | ||||
AMKVGDKRDI | SRFLECNPVM | IDAIKVSAAH | RARYFWGNLP | GMNRPVIASK | ||||
NDKLELQDCL | EYNRIAKLKK | VQTITTKSNS | IKQGKNQLFP | VVMNGKEDVL | ||||
WCTELERIFG | FPVHYTDVSN | MGRGARQKLL | GRSWSVPVIR | HLFAPLKDYF | ||||
ACE |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, активаторів, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.
Література
- Kang E.S., Park C.W., Chung J.H. (2001). Dnmt3b, de novo DNA methyltransferase, interacts with SUMO-1 and Ubc9 through its N-terminal region and is subject to modification by SUMO-1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289: 862—868. PMID 11735126 DOI:10.1006/bbrc.2001.6057
- Kim G.-D., Ni J., Kelesoglu N., Roberts R.J., Pradhan S. (2002). Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine-5) methyltransferases. EMBO J. 21: 4183—4195. PMID 12145218 DOI:10.1093/emboj/cdf401
- Okano M., Bell D.W., Haber D.A., Li E. (1999). DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b are essential for de novo methylation and mammalian development. Cell. 99: 247—257. PMID 10555141 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81656-6
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з DNMT3B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2979 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
DNMT3B angl DNA methyltransferase 3 beta bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 853 aminokislot a molekulyarna masa 95 751 DNMT3BNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3QKJ 3FLG 5CIUIdentifikatoriSimvoliDNMT3B ICF ICF1 M HsaIIIB DNA cytosine 5 methyltransferase 3 beta DNA methyltransferase 3 beta FSHD4Zovnishni ID OMIM 602900 MGI 1261819 HomoloGene 56000 GeneCards DNMT3BPov yazani genetichni zahvoryuvannyazapalni zahvoryuvannya kishkivnika immunodeficiency centromeric instability facial anomalies syndrome Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity transferase activity DNA binding GO 0001106 transcription corepressor activity DNA methyltransferase activity chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding DNA cytosine 5 methyltransferase activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific histone deacetylase bindingKlitinna komponenta citoplazma vnutrishnoklitinna membranna organela nukleoplazma klitinne yadroBiologichnij proces response to ionizing radiation C 5 methylation of cytosine response to estradiol response to hypoxia cellular response to hyperoxia GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II response to activity cellular response to dexamethasone stimulus response to vitamin A Metilyuvannya DNK Metilyuvannya GO 1901313 positive regulation of gene expression negative regulation of gene expression epigenetic positive regulation of histone H3 K4 methylation positive regulation of neuron differentiation negative regulation of histone H3 K9 methylation regulyaciya ekspresiyi geniv response to caffeine response to toxic substance response to cocaineDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1789 13436Ensembl ENSG00000088305 ENSMUSG00000027478UniProt Q9UBC3 O88509RefSeq mRNK NM 001207055 NM 001207056 NM 006892 NM 175848 NM 175849NM 175850NM 001003960 NM 001003961 NM 001003963 NM 001122997 NM 001271744NM 001271745 NM 001271746 NM 001271747 NM 010068RefSeq bilok NP 001193984 NP 001193985 NP 008823 NP 787044 NP 787045NP 787046NP 001003960 NP 001003961 NP 001003963 NP 001116469 NP 001258673NP 001258674 NP 001258675 NP 001258676 NP 034198Lokus UCSC Hr 20 32 76 32 81 MbHr 2 153 49 153 53 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKGDTRHLNGEEDAGGREDSILVNGACSDQSSDSPPILEAIRTPEIRGRR SSSRLSKREVSSLLSYTQDLTGDGDGEDGDGSDTPVMPKLFRETRTRSES PAVRTRNNNSVSSRERHRPSPRSTRGRQGRNHVDESPVEFPATRSLRRRA TASAGTPWPSPPSSYLTIDLTDDTEDTHGTPQSSSTPYARLAQDSQQGGM ESPQVEADSGDGDSSEYQDGKEFGIGDLVWGKIKGFSWWPAMVVSWKATS KRQAMSGMRWVQWFGDGKFSEVSADKLVALGLFSQHFNLATFNKLVSYRK AMYHALEKARVRAGKTFPSSPGDSLEDQLKPMLEWAHGGFKPTGIEGLKP NNTQPVVNKSKVRRAGSRKLESRKYENKTRRRTADDSATSDYCPAPKRLK TNCYNNGKDRGDEDQSREQMASDVANNKSSLEDGCLSCGRKNPVSFHPLF EGGLCQTCRDRFLELFYMYDDDGYQSYCTVCCEGRELLLCSNTSCCRCFC VECLEVLVGTGTAAEAKLQEPWSCYMCLPQRCHGVLRRRKDWNVRLQAFF TSDTGLEYEAPKLYPAIPAARRRPIRVLSLFDGIATGYLVLKELGIKVGK YVASEVCEESIAVGTVKHEGNIKYVNDVRNITKKNIEEWGPFDLVIGGSP CNDLSNVNPARKGLYEGTGRLFFEFYHLLNYSRPKEGDDRPFFWMFENVV AMKVGDKRDISRFLECNPVMIDAIKVSAAHRARYFWGNLPGMNRPVIASK NDKLELQDCLEYNRIAKLKKVQTITTKSNSIKQGKNQLFPVVMNGKEDVL WCTELERIFGFPVHYTDVSNMGRGARQKLLGRSWSVPVIRHLFAPLKDYF ACE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz represoriv aktivatoriv metiltransferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK S adenozil L metioninom Lokalizovanij u yadri LiteraturaKang E S Park C W Chung J H 2001 Dnmt3b de novo DNA methyltransferase interacts with SUMO 1 and Ubc9 through its N terminal region and is subject to modification by SUMO 1 Biochem Biophys Res Commun 289 862 868 PMID 11735126 DOI 10 1006 bbrc 2001 6057 Kim G D Ni J Kelesoglu N Roberts R J Pradhan S 2002 Co operation and communication between the human maintenance and de novo DNA cytosine 5 methyltransferases EMBO J 21 4183 4195 PMID 12145218 DOI 10 1093 emboj cdf401 Okano M Bell D W Haber D A Li E 1999 DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b are essential for de novo methylation and mammalian development Cell 99 247 257 PMID 10555141 DOI 10 1016 S0092 8674 00 81656 6PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z DNMT3B pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2979 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 20 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi