DNMT1 (англ. DNA methyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 616 амінокислот, а молекулярна маса — 183 165.
DNMT1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | DNMT1, ADCADN, AIM, CXXC9, DNMT, HSN1E, MCMT, m.HsaI, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 1, DNA methyltransferase 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 126375 MGI: 94912 HomoloGene: 124071 GeneCards: DNMT1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
hereditary sensory neuropathy-deafness-dementia syndrome, autosomal dominant cerebellar ataxia, deafness and narcolepsy | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
decitabine | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 10.13 – 10.23 Mb | Хр. 9: 20.82 – 20.87 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPARTAPARV | PTLAVPAISL | PDDVRRRLKD | LERDSLTEKE | CVKEKLNLLH | ||||
EFLQTEIKNQ | LCDLETKLRK | EELSEEGYLA | KVKSLLNKDL | SLENGAHAYN | ||||
REVNGRLENG | NQARSEARRV | GMADANSPPK | PLSKPRTPRR | SKSDGEAKPE | ||||
PSPSPRITRK | STRQTTITSH | FAKGPAKRKP | QEESERAKSD | ESIKEEDKDQ | ||||
DEKRRRVTSR | ERVARPLPAE | EPERAKSGTR | TEKEEERDEK | EEKRLRSQTK | ||||
EPTPKQKLKE | EPDREARAGV | QADEDEDGDE | KDEKKHRSQP | KDLAAKRRPE | ||||
EKEPEKVNPQ | ISDEKDEDEK | EEKRRKTTPK | EPTEKKMARA | KTVMNSKTHP | ||||
PKCIQCGQYL | DDPDLKYGQH | PPDAVDEPQM | LTNEKLSIFD | ANESGFESYE | ||||
ALPQHKLTCF | SVYCKHGHLC | PIDTGLIEKN | IELFFSGSAK | PIYDDDPSLE | ||||
GGVNGKNLGP | INEWWITGFD | GGEKALIGFS | TSFAEYILMD | PSPEYAPIFG | ||||
LMQEKIYISK | IVVEFLQSNS | DSTYEDLINK | IETTVPPSGL | NLNRFTEDSL | ||||
LRHAQFVVEQ | VESYDEAGDS | DEQPIFLTPC | MRDLIKLAGV | TLGQRRAQAR | ||||
RQTIRHSTRE | KDRGPTKATT | TKLVYQIFDT | FFAEQIEKDD | REDKENAFKR | ||||
RRCGVCEVCQ | QPECGKCKAC | KDMVKFGGSG | RSKQACQERR | CPNMAMKEAD | ||||
DDEEVDDNIP | EMPSPKKMHQ | GKKKKQNKNR | ISWVGEAVKT | DGKKSYYKKV | ||||
CIDAETLEVG | DCVSVIPDDS | SKPLYLARVT | ALWEDSSNGQ | MFHAHWFCAG | ||||
TDTVLGATSD | PLELFLVDEC | EDMQLSYIHS | KVKVIYKAPS | ENWAMEGGMD | ||||
PESLLEGDDG | KTYFYQLWYD | QDYARFESPP | KTQPTEDNKF | KFCVSCARLA | ||||
EMRQKEIPRV | LEQLEDLDSR | VLYYSATKNG | ILYRVGDGVY | LPPEAFTFNI | ||||
KLSSPVKRPR | KEPVDEDLYP | EHYRKYSDYI | KGSNLDAPEP | YRIGRIKEIF | ||||
CPKKSNGRPN | ETDIKIRVNK | FYRPENTHKS | TPASYHADIN | LLYWSDEEAV | ||||
VDFKAVQGRC | TVEYGEDLPE | CVQVYSMGGP | NRFYFLEAYN | AKSKSFEDPP | ||||
NHARSPGNKG | KGKGKGKGKP | KSQACEPSEP | EIEIKLPKLR | TLDVFSGCGG | ||||
LSEGFHQAGI | SDTLWAIEMW | DPAAQAFRLN | NPGSTVFTED | CNILLKLVMA | ||||
GETTNSRGQR | LPQKGDVEML | CGGPPCQGFS | GMNRFNSRTY | SKFKNSLVVS | ||||
FLSYCDYYRP | RFFLLENVRN | FVSFKRSMVL | KLTLRCLVRM | GYQCTFGVLQ | ||||
AGQYGVAQTR | RRAIILAAAP | GEKLPLFPEP | LHVFAPRACQ | LSVVVDDKKF | ||||
VSNITRLSSG | PFRTITVRDT | MSDLPEVRNG | ASALEISYNG | EPQSWFQRQL | ||||
RGAQYQPILR | DHICKDMSAL | VAARMRHIPL | APGSDWRDLP | NIEVRLSDGT | ||||
MARKLRYTHH | DRKNGRSSSG | ALRGVCSCVE | AGKACDPAAR | QFNTLIPWCL | ||||
PHTGNRHNHW | AGLYGRLEWD | GFFSTTVTNP | EPMGKQGRVL | HPEQHRVVSV | ||||
RECARSQGFP | DTYRLFGNIL | DKHRQVGNAV | PPPLAKAIGL | EIKLCMLAKA | ||||
RESASAKIKE | EEAAKD |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, активаторів, , метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.
Література
- Yoder J.A., Yen R.-W.C., Vertino P.M., Bestor T.H., Baylin S.B. (1996). New 5' regions of the murine and human genes for DNA (cytosine-5)-methyltransferase. J. Biol. Chem. 271: 31092—31097. PMID 8940105 DOI:10.1074/jbc.271.49.31092
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Bonfils C., Beaulieu N., Chan E., Cotton-Montpetit J., MacLeod A.R. (2000). Characterization of the human DNA methyltransferase splice variant Dnmt1b. J. Biol. Chem. 275: 10754—10760. PMID 10753866 DOI:10.1074/jbc.275.15.10754
- Tatematsu K., Yamazaki T., Ishikawa F. (2000). MBD2-MBD3 complex binds to hemi-methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase. Genes Cells. 5: 677—688. PMID 10947852 DOI:10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x
- Rountree M.R., Bachman K.E., Baylin S.B. (2000). DNMT1 binds HDAC2 and a new co-repressor, DMAP1, to form a complex at replication foci. Nat. Genet. 25: 269—277. PMID 10888872 DOI:10.1038/77023
- Kim G.-D., Ni J., Kelesoglu N., Roberts R.J., Pradhan S. (2002). Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine-5) methyltransferases. EMBO J. 21: 4183—4195. PMID 12145218 DOI:10.1093/emboj/cdf401
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з DNMT1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з DNA methyltransferase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
DNMT1 angl DNA methyltransferase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 616 aminokislot a molekulyarna masa 183 165 DNMT1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4YOC 3EPZ 3PTA 3SWR 4WXXIdentifikatoriSimvoliDNMT1 ADCADN AIM CXXC9 DNMT HSN1E MCMT m HsaI DNA cytosine 5 methyltransferase 1 DNA methyltransferase 1Zovnishni ID OMIM 126375 MGI 94912 HomoloGene 124071 GeneCards DNMT1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyahereditary sensory neuropathy deafness dementia syndrome autosomal dominant cerebellar ataxia deafness and narcolepsy Reaguye na spolukudecitabine Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity DNA binding transferase activity promoter specific chromatin binding methyl CpG binding zinc ion binding DNA methyltransferase activity chromatin binding zv yazuvannya z ionom metalu GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding DNA cytosine 5 methyltransferase activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta pericentric heterochromatin replication fork nukleoplazma GO 0035328 Geterohromatin klitinne yadroBiologichnij proces C 5 methylation of cytosine GO 0009373 regulation of transcription DNA templated maintenance of DNA methylation positive regulation of DNA methylation dependent heterochromatin assembly GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated Metilyuvannya Metilyuvannya DNK GO 1901313 positive regulation of gene expression negative regulation of gene expression epigenetic positive regulation of histone H3 K4 methylation regulation of cell population proliferation negative regulation of histone H3 K9 methylation cellular response to amino acid stimulus regulyaciya ekspresiyi geniv Ras protein signal transduction GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated DNA methylation on cytosine DNA methylation involved in embryo development GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization DNA methylation on cytosine within a CG sequence negative regulation of gene expression positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation negative regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation involved in phenotypic switchingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1786 13433Ensembl ENSG00000130816 ENSMUSG00000004099UniProt P26358 P13864RefSeq mRNK NM 001130823 NM 001379 NM 001318730 NM 001318731NM 001199431 NM 001199432 NM 001199433 NM 010066 NM 001314011RefSeq bilok NP 001124295 NP 001305659 NP 001305660 NP 001370NP 001186360 NP 001186361 NP 001186362 NP 001300940 NP 034196NP 001391614Lokus UCSC Hr 19 10 13 10 23 MbHr 9 20 82 20 87 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPARTAPARVPTLAVPAISLPDDVRRRLKDLERDSLTEKECVKEKLNLLH EFLQTEIKNQLCDLETKLRKEELSEEGYLAKVKSLLNKDLSLENGAHAYN REVNGRLENGNQARSEARRVGMADANSPPKPLSKPRTPRRSKSDGEAKPE PSPSPRITRKSTRQTTITSHFAKGPAKRKPQEESERAKSDESIKEEDKDQ DEKRRRVTSRERVARPLPAEEPERAKSGTRTEKEEERDEKEEKRLRSQTK EPTPKQKLKEEPDREARAGVQADEDEDGDEKDEKKHRSQPKDLAAKRRPE EKEPEKVNPQISDEKDEDEKEEKRRKTTPKEPTEKKMARAKTVMNSKTHP PKCIQCGQYLDDPDLKYGQHPPDAVDEPQMLTNEKLSIFDANESGFESYE ALPQHKLTCFSVYCKHGHLCPIDTGLIEKNIELFFSGSAKPIYDDDPSLE GGVNGKNLGPINEWWITGFDGGEKALIGFSTSFAEYILMDPSPEYAPIFG LMQEKIYISKIVVEFLQSNSDSTYEDLINKIETTVPPSGLNLNRFTEDSL LRHAQFVVEQVESYDEAGDSDEQPIFLTPCMRDLIKLAGVTLGQRRAQAR RQTIRHSTREKDRGPTKATTTKLVYQIFDTFFAEQIEKDDREDKENAFKR RRCGVCEVCQQPECGKCKACKDMVKFGGSGRSKQACQERRCPNMAMKEAD DDEEVDDNIPEMPSPKKMHQGKKKKQNKNRISWVGEAVKTDGKKSYYKKV CIDAETLEVGDCVSVIPDDSSKPLYLARVTALWEDSSNGQMFHAHWFCAG TDTVLGATSDPLELFLVDECEDMQLSYIHSKVKVIYKAPSENWAMEGGMD PESLLEGDDGKTYFYQLWYDQDYARFESPPKTQPTEDNKFKFCVSCARLA EMRQKEIPRVLEQLEDLDSRVLYYSATKNGILYRVGDGVYLPPEAFTFNI KLSSPVKRPRKEPVDEDLYPEHYRKYSDYIKGSNLDAPEPYRIGRIKEIF CPKKSNGRPNETDIKIRVNKFYRPENTHKSTPASYHADINLLYWSDEEAV VDFKAVQGRCTVEYGEDLPECVQVYSMGGPNRFYFLEAYNAKSKSFEDPP NHARSPGNKGKGKGKGKGKPKSQACEPSEPEIEIKLPKLRTLDVFSGCGG LSEGFHQAGISDTLWAIEMWDPAAQAFRLNNPGSTVFTEDCNILLKLVMA GETTNSRGQRLPQKGDVEMLCGGPPCQGFSGMNRFNSRTYSKFKNSLVVS FLSYCDYYRPRFFLLENVRNFVSFKRSMVLKLTLRCLVRMGYQCTFGVLQ AGQYGVAQTRRRAIILAAAPGEKLPLFPEPLHVFAPRACQLSVVVDDKKF VSNITRLSSGPFRTITVRDTMSDLPEVRNGASALEISYNGEPQSWFQRQL RGAQYQPILRDHICKDMSALVAARMRHIPLAPGSDWRDLPNIEVRLSDGT MARKLRYTHHDRKNGRSSSGALRGVCSCVEAGKACDPAARQFNTLIPWCL PHTGNRHNHWAGLYGRLEWDGFFSTTVTNPEPMGKQGRVLHPEQHRVVSV RECARSQGFPDTYRLFGNILDKHRQVGNAVPPPLAKAIGLEIKLCMLAKA RESASAKIKEEEAAKD A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz represoriv aktivatoriv metiltransferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK S adenozil L metioninom Lokalizovanij u yadri LiteraturaYoder J A Yen R W C Vertino P M Bestor T H Baylin S B 1996 New 5 regions of the murine and human genes for DNA cytosine 5 methyltransferase J Biol Chem 271 31092 31097 PMID 8940105 DOI 10 1074 jbc 271 49 31092 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Bonfils C Beaulieu N Chan E Cotton Montpetit J MacLeod A R 2000 Characterization of the human DNA methyltransferase splice variant Dnmt1b J Biol Chem 275 10754 10760 PMID 10753866 DOI 10 1074 jbc 275 15 10754 Tatematsu K Yamazaki T Ishikawa F 2000 MBD2 MBD3 complex binds to hemi methylated DNA and forms a complex containing DNMT1 at the replication foci in late S phase Genes Cells 5 677 688 PMID 10947852 DOI 10 1046 j 1365 2443 2000 00359 x Rountree M R Bachman K E Baylin S B 2000 DNMT1 binds HDAC2 and a new co repressor DMAP1 to form a complex at replication foci Nat Genet 25 269 277 PMID 10888872 DOI 10 1038 77023 Kim G D Ni J Kelesoglu N Roberts R J Pradhan S 2002 Co operation and communication between the human maintenance and de novo DNA cytosine 5 methyltransferases EMBO J 21 4183 4195 PMID 12145218 DOI 10 1093 emboj cdf401PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z DNMT1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z DNA methyltransferase 1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 19 veresnya 2016 Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 11 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi