DDR1 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 913 амінокислот, а молекулярна маса — 101 128.
DDR1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | DDR1, CAK, CD167, DDR, EHGK2, MCK10, NEP, NTRK4, PTK3, PTK3A, RTK6, TRKE, discoidin domain receptor tyrosine kinase 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600408 MGI: 99216 HomoloGene: 68212 GeneCards: DDR1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 30.88 – 30.9 Mb | Хр. 17: 35.99 – 36.02 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGPEALSSLL | LLLLVASGDA | DMKGHFDPAK | CRYALGMQDR | TIPDSDISAS | ||||
SSWSDSTAAR | HSRLESSDGD | GAWCPAGSVF | PKEEEYLQVD | LQRLHLVALV | ||||
GTQGRHAGGL | GKEFSRSYRL | RYSRDGRRWM | GWKDRWGQEV | ISGNEDPEGV | ||||
VLKDLGPPMV | ARLVRFYPRA | DRVMSVCLRV | ELYGCLWRDG | LLSYTAPVGQ | ||||
TMYLSEAVYL | NDSTYDGHTV | GGLQYGGLGQ | LADGVVGLDD | FRKSQELRVW | ||||
PGYDYVGWSN | HSFSSGYVEM | EFEFDRLRAF | QAMQVHCNNM | HTLGARLPGG | ||||
VECRFRRGPA | MAWEGEPMRH | NLGGNLGDPR | ARAVSVPLGG | RVARFLQCRF | ||||
LFAGPWLLFS | EISFISDVVN | NSSPALGGTF | PPAPWWPPGP | PPTNFSSLEL | ||||
EPRGQQPVAK | AEGSPTAILI | GCLVAIILLL | LLIIALMLWR | LHWRRLLSKA | ||||
ERRVLEEELT | VHLSVPGDTI | LINNRPGPRE | PPPYQEPRPR | GNPPHSAPCV | ||||
PNGSALLLSN | PAYRLLLATY | ARPPRGPGPP | TPAWAKPTNT | QAYSGDYMEP | ||||
EKPGAPLLPP | PPQNSVPHYA | EADIVTLQGV | TGGNTYAVPA | LPPGAVGDGP | ||||
PRVDFPRSRL | RFKEKLGEGQ | FGEVHLCEVD | SPQDLVSLDF | PLNVRKGHPL | ||||
LVAVKILRPD | ATKNARNDFL | KEVKIMSRLK | DPNIIRLLGV | CVQDDPLCMI | ||||
TDYMENGDLN | QFLSAHQLED | KAAEGAPGDG | QAAQGPTISY | PMLLHVAAQI | ||||
ASGMRYLATL | NFVHRDLATR | NCLVGENFTI | KIADFGMSRN | LYAGDYYRVQ | ||||
GRAVLPIRWM | AWECILMGKF | TTASDVWAFG | VTLWEVLMLC | RAQPFGQLTD | ||||
EQVIENAGEF | FRDQGRQVYL | SRPPACPQGL | YELMLRCWSR | ESEQRPPFSQ | ||||
LHRFLAEDAL | NTV |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Johnson J.D., Edman J.C., Rutter W.J. (1993). A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5677—5681. PMID 8390675 DOI:10.1073/pnas.90.12.5677
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Weiner T.M., Liu E.T., Craven R.J., Cance W.G. (1994). Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors. Ann. Surg. Oncol. 1: 18—27. PMID 7834423 DOI:10.1007/BF02303537
- Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
- Hou G., Vogel W.F., Bendeck M.P. (2002). Tyrosine kinase activity of discoidin domain receptor 1 is necessary for smooth muscle cell migration and matrix metalloproteinase expression. Circ. Res. 90: 1147—1149. PMID 12065315 DOI:10.1161/01.RES.0000022166.74073.F8
- Huang Y., Arora P., McCulloch C.A., Vogel W.F. (2009). The collagen receptor DDR1 regulates cell spreading and motility by associating with myosin IIA. J. Cell Sci. 122: 1637—1646. PMID 19401332 DOI:10.1242/jcs.046219
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2730 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
DDR1 angl Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 913 aminokislot a molekulyarna masa 101 128 DDR1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3ZOS 4AG4 4BKJ 4CKR 5BVK 5BVN 5BVO 5BVW 5FDPIdentifikatoriSimvoliDDR1 CAK CD167 DDR EHGK2 MCK10 NEP NTRK4 PTK3 PTK3A RTK6 TRKE discoidin domain receptor tyrosine kinase 1Zovnishni ID OMIM 600408 MGI 99216 HomoloGene 68212 GeneCards DDR1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya transferase activity nucleotide binding protein kinase activity collagen binding zv yazuvannya z ionom metalu kinase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity protein tyrosine kinase collagen receptor activity protein tyrosine kinase activity ATP binding receptor tyrosine kinaseKlitinna komponenta integral component of membrane membrana receptor complex klitinna membrana integral component of plasma membrane extracellular region ekzosoma mizhklitinnij prostirBiologichnij proces collagen activated tyrosine kinase receptor signaling pathway branching involved in mammary gland duct morphogenesis fosforilyuvannya transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway zhinocha vagitnist extracellular matrix organization ear development mammary gland alveolus development regulation of extracellular matrix disassembly smooth muscle cell migration smooth muscle cell matrix adhesion regulation of cell matrix adhesion protein phosphorylation adgeziya klitin regulation of cell growth peptidyl tyrosine phosphorylation laktaciya wound healing spreading of cells embryo implantation negative regulation of cell population proliferation peptidyl tyrosine autophosphorylation protein autophosphorylation axon development neuron projection extension cell matrix adhesion positive regulation of cell population proliferation diferenciaciya klitin regulation of extracellular matrix organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez780 12305Ensembl ENSG00000215522 ENSG00000137332 ENSG00000229767 ENSG00000230456 ENSG00000234078ENSG00000204580 ENSG00000223680 ENSMUSG00000003534UniProt Q08345 Q03146RefSeq mRNK NM 001202521 NM 001202522 NM 001202523 NM 001297652 NM 001297653NM 001297654 NM 001954 NM 013993 NM 013994NM 001198831 NM 001198833 NM 007584 NM 172962RefSeq bilok NP 001189450 NP 001189451 NP 001189452 NP 001284581 NP 001284582NP 001284583 NP 001945 NP 054699 NP 054700 NP 001284583 1 NP 054699 2NP 001185760 NP 001185762 NP 031610 NP 766550Lokus UCSC Hr 6 30 88 30 9 MbHr 17 35 99 36 02 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGPEALSSLLLLLLVASGDADMKGHFDPAKCRYALGMQDRTIPDSDISAS SSWSDSTAARHSRLESSDGDGAWCPAGSVFPKEEEYLQVDLQRLHLVALV GTQGRHAGGLGKEFSRSYRLRYSRDGRRWMGWKDRWGQEVISGNEDPEGV VLKDLGPPMVARLVRFYPRADRVMSVCLRVELYGCLWRDGLLSYTAPVGQ TMYLSEAVYLNDSTYDGHTVGGLQYGGLGQLADGVVGLDDFRKSQELRVW PGYDYVGWSNHSFSSGYVEMEFEFDRLRAFQAMQVHCNNMHTLGARLPGG VECRFRRGPAMAWEGEPMRHNLGGNLGDPRARAVSVPLGGRVARFLQCRF LFAGPWLLFSEISFISDVVNNSSPALGGTFPPAPWWPPGPPPTNFSSLEL EPRGQQPVAKAEGSPTAILIGCLVAIILLLLLIIALMLWRLHWRRLLSKA ERRVLEEELTVHLSVPGDTILINNRPGPREPPPYQEPRPRGNPPHSAPCV PNGSALLLSNPAYRLLLATYARPPRGPGPPTPAWAKPTNTQAYSGDYMEP EKPGAPLLPPPPQNSVPHYAEADIVTLQGVTGGNTYAVPALPPGAVGDGP PRVDFPRSRLRFKEKLGEGQFGEVHLCEVDSPQDLVSLDFPLNVRKGHPL LVAVKILRPDATKNARNDFLKEVKIMSRLKDPNIIRLLGVCVQDDPLCMI TDYMENGDLNQFLSAHQLEDKAAEGAPGDGQAAQGPTISYPMLLHVAAQI ASGMRYLATLNFVHRDLATRNCLVGENFTIKIADFGMSRNLYAGDYYRVQ GRAVLPIRWMAWECILMGKFTTASDVWAFGVTLWEVLMLCRAQPFGQLTD EQVIENAGEFFRDQGRQVYLSRPPACPQGLYELMLRCWSRESEQRPPFSQ LHRFLAEDALNTV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz kinaz receptoriv tirozinovih proteyinkinaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaJohnson J D Edman J C Rutter W J 1993 A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I like domain Proc Natl Acad Sci U S A 90 5677 5681 PMID 8390675 DOI 10 1073 pnas 90 12 5677 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Weiner T M Liu E T Craven R J Cance W G 1994 Expression of growth factor receptors the focal adhesion kinase and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors Ann Surg Oncol 1 18 27 PMID 7834423 DOI 10 1007 BF02303537 Vogel W Gish G D Alves F Pawson T 1997 The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen Mol Cell 1 13 23 PMID 9659899 DOI 10 1016 S1097 2765 00 80003 9 Hou G Vogel W F Bendeck M P 2002 Tyrosine kinase activity of discoidin domain receptor 1 is necessary for smooth muscle cell migration and matrix metalloproteinase expression Circ Res 90 1147 1149 PMID 12065315 DOI 10 1161 01 RES 0000022166 74073 F8 Huang Y Arora P McCulloch C A Vogel W F 2009 The collagen receptor DDR1 regulates cell spreading and motility by associating with myosin IIA J Cell Sci 122 1637 1646 PMID 19401332 DOI 10 1242 jcs 046219PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2730 angl Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 28 serpnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi