Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

COL9A1 англ Collagen type IX alpha 1 chain білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плеч

COL9A1

COL9A1

COL9A1 (англ. Collagen type IX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 921 амінокислот, а молекулярна маса — 91 869.

COL9A1
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL9A1, DJ149L1.1.2, EDM6, MED, STL4, collagen type IX alpha 1, collagen type IX alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 120210 MGI: 88465 HomoloGene: 1393 GeneCards: COL9A1
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1297
12839
Ensembl
ENSG00000112280
ENSMUSG00000026147
UniProt
P20849
Q05722
RefSeq (мРНК)
NM_001851
NM_078485
NM_001377289
NM_001377290
NM_001377291
NM_001290691
NM_007740
RefSeq (білок)
NP_001842
NP_511040
NP_001364218
NP_001364219
NP_001364220
NP_001277620
NP_031766
Локус (UCSC) Хр. 6: 70.22 – 70.3 Mb Хр. 1: 24.22 – 24.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MKTCWKIPVFFFVCSFLEPWASAAVKRRPRFPVNSNSNGGNELCPKIRIG
QDDLPGFDLISQFQVDKAASRRAIQRVVGSATLQVAYKLGNNVDFRIPTR
NLYPSGLPEEYSFLTTFRMTGSTLKKNWNIWQIQDSSGKEQVGIKINGQT
QSVVFSYKGLDGSLQTAAFSNLSSLFDSQWHKIMIGVERSSATLFVDCNR
IESLPIKPRGPIDIDGFAVLGKLADNPQVSVPFELQWMLIHCDPLRPRRE
TCHELPARITPSQTTDERGPPGEQGPPGPPGPPGVPGIDGIDGDRGPKGP
PGPPGPAGEPGKPGAPGKPGTPGADGLTGPDGSPGSIGSKGQKGEPGVPG
SRGFPGRGIPGPPGPPGTAGLPGELGRVGPVGDPGRRGPPGPPGPPGPRG
TIGFHDGDPLCPNACPPGRSGYPGLPGMRGHKGAKGEIGEPGRQGHKGEE
GDQGELGEVGAQGPPGAQGLRGITGIVGDKGEKGARGLDGEPGPQGLPGA
PGDQGQRGPPGEAGPKGDRGAEGARGIPGLPGPKGDTGLPGVDGRDGIPG
MPGTKGEPGKPGPPGDAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQM
GNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGELGPVGSPGLPGKLGSLGSPGL
PGLPGPPGLPGMKGDRGVVGEPGPKGEQGASGEEGEAGERGELGDIGLPG
PKGSAGNPGEPGLRGPEGSRGLPGVEGPRGPPGPRGVQGEQGATGLPGVQ
GPPGRAPTDQHIKQVCMRVIQEHFAEMAASLKRPDSGATGLPGRPGPPGP
PGPPGENGFPGQMGIRGLPGIKGPPGALGLRGPKGDLGEKGERGPPGRGP
NGLPGAIGLPGDPGPASYGRNGRDGERGPPGVAGIPGVPGPPGPPGLPGF
CEPASCTMQAGQRAFNKGPDP

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Muragaki Y., Kimura T., Ninomiya Y., Olsen B.R. (1990). The complete primary structure of two distinct forms of human alpha 1 (IX) collagen chains. Eur. J. Biochem. 192: 703—708. PMID 2209617 DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb19279.x
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Diab M., Wu J.J., Eyre D.R. (1996). Collagen type IX from human cartilage: a structural profile of intermolecular cross-linking sites. Biochem. J. 314: 327—332. PMID 8660302 DOI:10.1042/bj3140327
  • Muragaki Y., Nishimura I., Henney A., Ninomiya Y., Olsen B.R. (1990). The alpha 1 (IX) collagen gene gives rise to two different transcripts in both mouse embryonic and human fetal RNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2400—2404. PMID 1690886 DOI:10.1073/pnas.87.7.2400

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 27 листопада 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також


image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

COL9A1 angl Collagen type IX alpha 1 chain bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 921 aminokislot a molekulyarna masa 91 869 COL9A1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2UURIdentifikatoriSimvoliCOL9A1 DJ149L1 1 2 EDM6 MED STL4 collagen type IX alpha 1 collagen type IX alpha 1 chainZovnishni ID OMIM 120210 MGI 88465 HomoloGene 1393 GeneCards COL9A1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength zv yazuvannya z ionom metalu extracellular matrix structural constituentKlitinna komponenta collagen type IX trimer extracellular region kolagen endoplasmic reticulum lumen mizhklitinnij prostir GO 0005578 Pozaklitinna matricya collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces animal organ morphogenesis extracellular matrix organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1297 12839Ensembl ENSG00000112280 ENSMUSG00000026147UniProt P20849 Q05722RefSeq mRNK NM 001851 NM 078485 NM 001377289 NM 001377290 NM 001377291NM 001290691 NM 007740RefSeq bilok NP 001842 NP 511040 NP 001364218 NP 001364219 NP 001364220NP 001277620 NP 031766Lokus UCSC Hr 6 70 22 70 3 MbHr 1 24 22 24 29 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKTCWKIPVFFFVCSFLEPWASAAVKRRPRFPVNSNSNGGNELCPKIRIG QDDLPGFDLISQFQVDKAASRRAIQRVVGSATLQVAYKLGNNVDFRIPTR NLYPSGLPEEYSFLTTFRMTGSTLKKNWNIWQIQDSSGKEQVGIKINGQT QSVVFSYKGLDGSLQTAAFSNLSSLFDSQWHKIMIGVERSSATLFVDCNR IESLPIKPRGPIDIDGFAVLGKLADNPQVSVPFELQWMLIHCDPLRPRRE TCHELPARITPSQTTDERGPPGEQGPPGPPGPPGVPGIDGIDGDRGPKGP PGPPGPAGEPGKPGAPGKPGTPGADGLTGPDGSPGSIGSKGQKGEPGVPG SRGFPGRGIPGPPGPPGTAGLPGELGRVGPVGDPGRRGPPGPPGPPGPRG TIGFHDGDPLCPNACPPGRSGYPGLPGMRGHKGAKGEIGEPGRQGHKGEE GDQGELGEVGAQGPPGAQGLRGITGIVGDKGEKGARGLDGEPGPQGLPGA PGDQGQRGPPGEAGPKGDRGAEGARGIPGLPGPKGDTGLPGVDGRDGIPG MPGTKGEPGKPGPPGDAGLQGLPGVPGIPGAKGVAGEKGSTGAPGKPGQM GNSGKPGQQGPPGEVGPRGPQGLPGSRGELGPVGSPGLPGKLGSLGSPGL PGLPGPPGLPGMKGDRGVVGEPGPKGEQGASGEEGEAGERGELGDIGLPG PKGSAGNPGEPGLRGPEGSRGLPGVEGPRGPPGPRGVQGEQGATGLPGVQ GPPGRAPTDQHIKQVCMRVIQEHFAEMAASLKRPDSGATGLPGRPGPPGP PGPPGENGFPGQMGIRGLPGIKGPPGALGLRGPKGDLGEKGERGPPGRGP NGLPGAIGLPGDPGPASYGRNGRDGERGPPGVAGIPGVPGPPGPPGLPGF CEPASCTMQAGQRAFNKGPDP A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaMuragaki Y Kimura T Ninomiya Y Olsen B R 1990 The complete primary structure of two distinct forms of human alpha 1 IX collagen chains Eur J Biochem 192 703 708 PMID 2209617 DOI 10 1111 j 1432 1033 1990 tb19279 x The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Diab M Wu J J Eyre D R 1996 Collagen type IX from human cartilage a structural profile of intermolecular cross linking sites Biochem J 314 327 332 PMID 8660302 DOI 10 1042 bj3140327 Muragaki Y Nishimura I Henney A Ninomiya Y Olsen B R 1990 The alpha 1 IX collagen gene gives rise to two different transcripts in both mouse embryonic and human fetal RNA Proc Natl Acad Sci U S A 87 2400 2404 PMID 1690886 DOI 10 1073 pnas 87 7 2400PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 15 veresnya 2015 Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 27 listopada 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ