COL4A4 (англ. Collagen type IV alpha 4 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 690 амінокислот, а молекулярна маса — 164 038.
COL4A4 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | COL4A4, CA44, collagen type IV alpha 4, collagen type IV alpha 4 chain, BFH, ATS2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 120131 MGI: 104687 HomoloGene: 20071 GeneCards: COL4A4 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
натуральна віспа | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
ocriplasmin | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 2: 227 – 227.16 Mb | Хр. 1: 82.43 – 82.56 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MWSLHIVLMR | CSFRLTKSLA | TGPWSLILIL | FSVQYVYGSG | KKYIGPCGGR | ||||
DCSVCHCVPE | KGSRGPPGPP | GPQGPIGPLG | APGPIGLSGE | KGMRGDRGPP | ||||
GAAGDKGDKG | PTGVPGFPGL | DGIPGHPGPP | GPRGKPGMSG | HNGSRGDPGF | ||||
PGGRGALGPG | GPLGHPGEKG | EKGNSVFILG | AVKGIQGDRG | DPGLPGLPGS | ||||
WGAGGPAGPT | GYPGEPGLVG | PPGQPGRPGL | KGNPGVGVKG | QMGDPGEVGQ | ||||
QGSPGPTLLV | EPPDFCLYKG | EKGIKGIPGM | VGLPGPPGRK | GESGIGAKGE | ||||
KGIPGFPGPR | GDPGSYGSPG | FPGLKGELGL | VGDPGLFGLI | GPKGDPGNRG | ||||
HPGPPGVLVT | PPLPLKGPPG | DPGFPGRYGE | TGDVGPPGPP | GLLGRPGEAC | ||||
AGMIGPPGPQ | GFPGLPGLPG | EAGIPGRPDS | APGKPGKPGS | PGLPGAPGLQ | ||||
GLPGSSVIYC | SVGNPGPQGI | KGKVGPPGGR | GPKGEKGNEG | LCACEPGPMG | ||||
PPGPPGLPGR | QGSKGDLGLP | GWLGTKGDPG | PPGAEGPPGL | PGKHGASGPP | ||||
GNKGAKGDMV | VSRVKGHKGE | RGPDGPPGFP | GQPGSHGRDG | HAGEKGDPGP | ||||
PGDHEDATPG | GKGFPGPLGP | PGKAGPVGPP | GLGFPGPPGE | RGHPGVPGHP | ||||
GVRGPDGLKG | QKGDTISCNV | TYPGRHGPPG | FDGPPGPKGF | PGPQGAPGLS | ||||
GSDGHKGRPG | TPGTAEIPGP | PGFRGDMGDP | GFGGEKGSSP | VGPPGPPGSP | ||||
GVNGQKGIPG | DPAFGHLGPP | GKRGLSGVPG | IKGPRGDPGC | PGAEGPAGIP | ||||
GFLGLKGPKG | REGHAGFPGV | PGPPGHSCER | GAPGIPGQPG | LPGYPGSPGA | ||||
PGGKGQPGDV | GPPGPAGMKG | LPGLPGRPGA | HGPPGLPGIP | GPFGDDGLPG | ||||
PPGPKGPRGL | PGFPGFPGER | GKPGAEGCPG | AKGEPGEKGM | SGLPGDRGLR | ||||
GAKGAIGPPG | DEGEMAIISQ | KGTPGEPGPP | GDDGFPGERG | DKGTPGMQGR | ||||
RGEPGRYGPP | GFHRGEPGEK | GQPGPPGPPG | PPGSTGLRGF | IGFPGLPGDQ | ||||
GEPGSPGPPG | FSGIDGARGP | KGNKGDPASH | FGPPGPKGEP | GSPGCPGHFG | ||||
ASGEQGLPGI | QGPRGSPGRP | GPPGSSGPPG | CPGDHGMPGL | RGQPGEMGDP | ||||
GPRGLQGDPG | IPGPPGIKGP | SGSPGLNGLH | GLKGQKGTKG | ASGLHDVGPP | ||||
GPVGIPGLKG | ERGDPGSPGI | SPPGPRGKKG | PPGPPGSSGP | PGPAGATGRA | ||||
PKDIPDPGPP | GDQGPPGPDG | PRGAPGPPGL | PGSVDLLRGE | PGDCGLPGPP | ||||
GPPGPPGPPG | YKGFPGCDGK | DGQKGPVGFP | GPQGPHGFPG | PPGEKGLPGP | ||||
PGRKGPTGLP | GPRGEPGPPA | DVDDCPRIPG | LPGAPGMRGP | EGAMGLPGMR | ||||
GPSGPGCKGE | PGLDGRRGVD | GVPGSPGPPG | RKGDTGEDGY | PGGPGPPGPI | ||||
GDPGPKGFGP | GYLGGFLLVL | HSQTDQEPTC | PLGMPRLWTG | YSLLYLEGQE | ||||
KAHNQDLGLA | GSCLPVFSTL | PFAYCNIHQV | CHYAQRNDRS | YWLASAAPLP | ||||
MMPLSEEAIR | PYVSRCAVCE | APAQAVAVHS | QDQSIPPCPQ | TWRSLWIGYS | ||||
FLMHTGAGDQ | GGGQALMSPG | SCLEDFRAAP | FLECQGRQGT | CHFFANKYSF | ||||
WLTTVKADLQ | FSSAPAPDTL | KESQAQRQKI | SRCQVCVKYS |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Sugimoto M., Oohashi T., Yoshioka H., Matsuo N., Ninomiya Y. (1993). cDNA isolation and partial gene structure of the human alpha 4(IV) collagen chain. FEBS Lett. 330: 122—128. PMID 8365481 DOI:10.1016/0014-5793(93)80256-T
- Lemmink H.H., Schroeder C.H., Monnens L.A.H., Smeets H.J.M. (1997). The clinical spectrum of type IV collagen mutations. Hum. Mutat. 9: 477—499. PMID 9195222 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1997)9:6<477::AID-HUMU1>3.3.CO;2-H
- Leinonen A., Mariyama M., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human type IV collagen alpha 4(IV) chain. Comparison with structure and expression of the other alpha (IV) chains. J. Biol. Chem. 269: 26172—26177. PMID 7523402
- Kamagata Y., Mattei M.-G., Ninomiya Y. (1992). Isolation and sequencing of cDNAs and genomic DNAs encoding the alpha 4 chain of basement membrane collagen type IV and assignment of the gene to the distal long arm of human chromosome 2. J. Biol. Chem. 267: 23753—23758. PMID 1429714
- Mariyama M., Leinonen A., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human alpha 3(IV) collagen chain. Coexpression of the alpha 3(IV) and alpha 4(IV) collagen chains in human tissues. J. Biol. Chem. 269: 23013—23017. PMID 8083201
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з COL4A4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з COL4A4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 13 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
COL4A4 angl Collagen type IV alpha 4 chain bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 690 aminokislot a molekulyarna masa 164 038 COL4A4IdentifikatoriSimvoliCOL4A4 CA44 collagen type IV alpha 4 collagen type IV alpha 4 chain BFH ATS2Zovnishni ID OMIM 120131 MGI 104687 HomoloGene 20071 GeneCards COL4A4Pov yazani genetichni zahvoryuvannyanaturalna vispa Reaguye na spolukuocriplasmin Ontologiya genaMolekulyarna funkciya extracellular matrix structural constituent extracellular matrix structural constituent conferring tensile strengthKlitinna komponenta extracellular region bazalna membrana kolagen collagen type IV trimer endoplasmic reticulum lumen mizhklitinnij prostir GO 0005578 Pozaklitinna matricya collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces extracellular matrix organization glomerular basement membrane development Angiogenez endothelial cell morphogenesisDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1286 12829Ensembl ENSG00000081052 ENSMUSG00000067158UniProt P53420 Q9QZR9RefSeq mRNK NM 000092NM 007735RefSeq bilok NP 000083NP 031761Lokus UCSC Hr 2 227 227 16 MbHr 1 82 43 82 56 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MWSLHIVLMRCSFRLTKSLATGPWSLILILFSVQYVYGSGKKYIGPCGGR DCSVCHCVPEKGSRGPPGPPGPQGPIGPLGAPGPIGLSGEKGMRGDRGPP GAAGDKGDKGPTGVPGFPGLDGIPGHPGPPGPRGKPGMSGHNGSRGDPGF PGGRGALGPGGPLGHPGEKGEKGNSVFILGAVKGIQGDRGDPGLPGLPGS WGAGGPAGPTGYPGEPGLVGPPGQPGRPGLKGNPGVGVKGQMGDPGEVGQ QGSPGPTLLVEPPDFCLYKGEKGIKGIPGMVGLPGPPGRKGESGIGAKGE KGIPGFPGPRGDPGSYGSPGFPGLKGELGLVGDPGLFGLIGPKGDPGNRG HPGPPGVLVTPPLPLKGPPGDPGFPGRYGETGDVGPPGPPGLLGRPGEAC AGMIGPPGPQGFPGLPGLPGEAGIPGRPDSAPGKPGKPGSPGLPGAPGLQ GLPGSSVIYCSVGNPGPQGIKGKVGPPGGRGPKGEKGNEGLCACEPGPMG PPGPPGLPGRQGSKGDLGLPGWLGTKGDPGPPGAEGPPGLPGKHGASGPP GNKGAKGDMVVSRVKGHKGERGPDGPPGFPGQPGSHGRDGHAGEKGDPGP PGDHEDATPGGKGFPGPLGPPGKAGPVGPPGLGFPGPPGERGHPGVPGHP GVRGPDGLKGQKGDTISCNVTYPGRHGPPGFDGPPGPKGFPGPQGAPGLS GSDGHKGRPGTPGTAEIPGPPGFRGDMGDPGFGGEKGSSPVGPPGPPGSP GVNGQKGIPGDPAFGHLGPPGKRGLSGVPGIKGPRGDPGCPGAEGPAGIP GFLGLKGPKGREGHAGFPGVPGPPGHSCERGAPGIPGQPGLPGYPGSPGA PGGKGQPGDVGPPGPAGMKGLPGLPGRPGAHGPPGLPGIPGPFGDDGLPG PPGPKGPRGLPGFPGFPGERGKPGAEGCPGAKGEPGEKGMSGLPGDRGLR GAKGAIGPPGDEGEMAIISQKGTPGEPGPPGDDGFPGERGDKGTPGMQGR RGEPGRYGPPGFHRGEPGEKGQPGPPGPPGPPGSTGLRGFIGFPGLPGDQ GEPGSPGPPGFSGIDGARGPKGNKGDPASHFGPPGPKGEPGSPGCPGHFG ASGEQGLPGIQGPRGSPGRPGPPGSSGPPGCPGDHGMPGLRGQPGEMGDP GPRGLQGDPGIPGPPGIKGPSGSPGLNGLHGLKGQKGTKGASGLHDVGPP GPVGIPGLKGERGDPGSPGISPPGPRGKKGPPGPPGSSGPPGPAGATGRA PKDIPDPGPPGDQGPPGPDGPRGAPGPPGLPGSVDLLRGEPGDCGLPGPP GPPGPPGPPGYKGFPGCDGKDGQKGPVGFPGPQGPHGFPGPPGEKGLPGP PGRKGPTGLPGPRGEPGPPADVDDCPRIPGLPGAPGMRGPEGAMGLPGMR GPSGPGCKGEPGLDGRRGVDGVPGSPGPPGRKGDTGEDGYPGGPGPPGPI GDPGPKGFGPGYLGGFLLVLHSQTDQEPTCPLGMPRLWTGYSLLYLEGQE KAHNQDLGLAGSCLPVFSTLPFAYCNIHQVCHYAQRNDRSYWLASAAPLP MMPLSEEAIRPYVSRCAVCEAPAQAVAVHSQDQSIPPCPQTWRSLWIGYS FLMHTGAGDQGGGQALMSPGSCLEDFRAAPFLECQGRQGTCHFFANKYSF WLTTVKADLQFSSAPAPDTLKESQAQRQKISRCQVCVKYS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak polimorfizm Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi bazalnij membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaSugimoto M Oohashi T Yoshioka H Matsuo N Ninomiya Y 1993 cDNA isolation and partial gene structure of the human alpha 4 IV collagen chain FEBS Lett 330 122 128 PMID 8365481 DOI 10 1016 0014 5793 93 80256 T Lemmink H H Schroeder C H Monnens L A H Smeets H J M 1997 The clinical spectrum of type IV collagen mutations Hum Mutat 9 477 499 PMID 9195222 DOI 10 1002 SICI 1098 1004 1997 9 6 lt 477 AID HUMU1 gt 3 3 CO 2 H Leinonen A Mariyama M Mochizuki T Tryggvason K Reeders S T 1994 Complete primary structure of the human type IV collagen alpha 4 IV chain Comparison with structure and expression of the other alpha IV chains J Biol Chem 269 26172 26177 PMID 7523402 Kamagata Y Mattei M G Ninomiya Y 1992 Isolation and sequencing of cDNAs and genomic DNAs encoding the alpha 4 chain of basement membrane collagen type IV and assignment of the gene to the distal long arm of human chromosome 2 J Biol Chem 267 23753 23758 PMID 1429714 Mariyama M Leinonen A Mochizuki T Tryggvason K Reeders S T 1994 Complete primary structure of the human alpha 3 IV collagen chain Coexpression of the alpha 3 IV and alpha 4 IV collagen chains in human tissues J Biol Chem 269 23013 23017 PMID 8083201PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z COL4A4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z COL4A4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 16 bereznya 2016 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 13 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi