CNGB1 (англ. Cyclic nucleotide gated channel beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 251 амінокислот, а молекулярна маса — 139 678.
CNGB1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CNGB1, CNCG2, CNCG3L, CNCG4, CNG4, CNGB1B, GAR1, GARP, GARP2, RCNC2, RCNCb, RCNCbeta, RP45, cyclic nucleotide gated channel beta 1, cyclic nucleotide gated channel subunit beta 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600724 HomoloGene: 993 GeneCards: CNGB1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
retinitis pigmentosa 45 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 57.88 – 57.97 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLGWVQRVLP | QPPGTPRKTK | MQEEEEVEPE | PEMEAEVEPE | PNPEEAETES | ||||
ESMPPEESFK | EEEVAVADPS | PQETKEAALT | STISLRAQGA | EISEMNSPSR | ||||
RVLTWLMKGV | EKVIPQPVHS | ITEDPAQILG | HGSTGDTGCT | DEPNEALEAQ | ||||
DTRPGLRLLL | WLEQNLERVL | PQPPKSSEVW | RDEPAVATGA | ASDPAPPGRP | ||||
QEMGPKLQAR | ETPSLPTPIP | LQPKEEPKEA | PAPEPQPGSQ | AQTSSLPPTR | ||||
DPARLVAWVL | HRLEMALPQP | VLHGKIGEQE | PDSPGICDVQ | TISILPGGQV | ||||
EPDLVLEEVE | PPWEDAHQDV | STSPQGTEVV | PAYEEENKAV | EKMPRELSRI | ||||
EEEKEDEEEE | EEEEEEEEEE | EVTEVLLDSC | VVSQVGVGQS | EEDGTRPQST | ||||
SDQKLWEEVG | EEAKKEAEEK | AKEEAEEVAE | EEAEKEPQDW | AETKEEPEAE | ||||
AEAASSGVPA | TKQHPEVQVE | DTDADSCPLM | AEENPPSTVL | PPPSPAKSDT | ||||
LIVPSSASGT | HRKKLPSEDD | EAEELKALSP | AESPVVAWSD | PTTPKDTDGQ | ||||
DRAASTASTN | SAIINDRLQE | LVKLFKERTE | KVKEKLIDPD | VTSDEESPKP | ||||
SPAKKAPEPA | PDTKPAEAEP | VEEEHYCDML | CCKFKHRPWK | KYQFPQSIDP | ||||
LTNLMYVLWL | FFVVMAWNWN | CWLIPVRWAF | PYQTPDNIHH | WLLMDYLCDL | ||||
IYFLDITVFQ | TRLQFVRGGD | IITDKKDMRN | NYLKSRRFKM | DLLSLLPLDF | ||||
LYLKVGVNPL | LRLPRCLKYM | AFFEFNSRLE | SILSKAYVYR | VIRTTAYLLY | ||||
SLHLNSCLYY | WASAYQGLGS | THWVYDGVGN | SYIRCYYFAV | KTLITIGGLP | ||||
DPKTLFEIVF | QLLNYFTGVF | AFSVMIGQMR | DVVGAATAGQ | TYYRSCMDST | ||||
VKYMNFYKIP | KSVQNRVKTW | YEYTWHSQGM | LDESELMVQL | PDKMRLDLAI | ||||
DVNYNIVSKV | ALFQGCDRQM | IFDMLKRLRS | VVYLPNDYVC | KKGEIGREMY | ||||
IIQAGQVQVL | GGPDGKSVLV | TLKAGSVFGE | ISLLAVGGGN | RRTANVVAHG | ||||
FTNLFILDKK | DLNEILVHYP | ESQKLLRKKA | RRMLRSNNKP | KEEKSVLILP | ||||
PRAGTPKLFN | AALAMTGKMG | GKGAKGGKLA | HLRARLKELA | ALEAAAKQQE | ||||
LVEQAKSSQD | VKGEEGSAAP | DQHTHPKEAA | TDPPAPRTPP | EPPGSPPSSP | ||||
PPASLGRPEG | EEEGPAEPEE | HSVRICMSPG | PEPGEQILSV | KMPEEREEKA | ||||
E |
Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами. Локалізований у мембрані.
Література
- Grunwald M.E., Yu W.P., Yu H.H., Yau K.W. (1998). Identification of a domain on the beta-subunit of the rod cGMP-gated cation channel that mediates inhibition by calcium-calmodulin. J. Biol. Chem. 273: 9148—9157. PMID 9535905 DOI:10.1074/jbc.273.15.9148
- Ardell M.D., Bedsole D.L., Schoborg R.V., Pittler S.J. (2000). Genomic organization of the human rod photoreceptor cGMP-gated cation channel beta-subunit gene. Gene. 245: 311—318. PMID 10717482 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00023-8
- Bradley J., Boenigk W., Yau K.-W., Frings S. (2004). Calmodulin permanently associates with rat olfactory CNG channels under native conditions. Nat. Neurosci. 7: 705—710. PMID 15195096 DOI:10.1038/nn1266
- Pentia D.C., Hosier S., Cote R.H. (2006). The glutamic acid-rich protein-2 (GARP2) is a high affinity rod photoreceptor phosphodiesterase (PDE6)-binding protein that modulates its catalytic properties. J. Biol. Chem. 281: 5500—5505. PMID 16407240 DOI:10.1074/jbc.M507488200
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з CNGB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2151 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CNGB1 angl Cyclic nucleotide gated channel beta 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 251 aminokislot a molekulyarna masa 139 678 CNGB1IdentifikatoriSimvoliCNGB1 CNCG2 CNCG3L CNCG4 CNG4 CNGB1B GAR1 GARP GARP2 RCNC2 RCNCb RCNCbeta RP45 cyclic nucleotide gated channel beta 1 cyclic nucleotide gated channel subunit beta 1Zovnishni ID OMIM 600724 HomoloGene 993 GeneCards CNGB1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaretinitis pigmentosa 45 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding intracellular cyclic nucleotide activated cation channel activity cyclic nucleotide gated ion channel activity cAMP binding cGMP binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding ligand gated ion channel activity voltage gated potassium channel activity intracellular cGMP activated cation channel activity intracellular cAMP activated cation channel activityKlitinna komponenta integral component of membrane membrana Golgi membrane photoreceptor outer segment ciliary membrane Golgi associated vesicle membrane transmembrane transporter complex terminal bouton intracellular cyclic nucleotide activated cation channel complex klitinna membrana integral component of plasma membraneBiologichnij proces protein localization to organelle vidpovid na stimul regulation of rhodopsin mediated signaling pathway regulation of membrane potential cation transport ion transport photoreceptor cell outer segment organization cation transmembrane transport detection of light stimulus involved in visual perception sensory perception of smell retina homeostasis photoreceptor cell maintenance zir rhodopsin mediated signaling pathway phototransduction regulation of cytosolic calcium ion concentration potassium ion transmembrane transport protein heterotetramerizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1258 83686Ensembl ENSG00000070729 ENSRNOG00000031773UniProt Q14028 n dRefSeq mRNK NM 001135639 NM 001286130 NM 001297NM 031809 NM 001389260RefSeq bilok NP 001129111 NP 001273059 NP 001288n dLokus UCSC Hr 16 57 88 57 97 Mbn dPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLGWVQRVLPQPPGTPRKTKMQEEEEVEPEPEMEAEVEPEPNPEEAETES ESMPPEESFKEEEVAVADPSPQETKEAALTSTISLRAQGAEISEMNSPSR RVLTWLMKGVEKVIPQPVHSITEDPAQILGHGSTGDTGCTDEPNEALEAQ DTRPGLRLLLWLEQNLERVLPQPPKSSEVWRDEPAVATGAASDPAPPGRP QEMGPKLQARETPSLPTPIPLQPKEEPKEAPAPEPQPGSQAQTSSLPPTR DPARLVAWVLHRLEMALPQPVLHGKIGEQEPDSPGICDVQTISILPGGQV EPDLVLEEVEPPWEDAHQDVSTSPQGTEVVPAYEEENKAVEKMPRELSRI EEEKEDEEEEEEEEEEEEEEEVTEVLLDSCVVSQVGVGQSEEDGTRPQST SDQKLWEEVGEEAKKEAEEKAKEEAEEVAEEEAEKEPQDWAETKEEPEAE AEAASSGVPATKQHPEVQVEDTDADSCPLMAEENPPSTVLPPPSPAKSDT LIVPSSASGTHRKKLPSEDDEAEELKALSPAESPVVAWSDPTTPKDTDGQ DRAASTASTNSAIINDRLQELVKLFKERTEKVKEKLIDPDVTSDEESPKP SPAKKAPEPAPDTKPAEAEPVEEEHYCDMLCCKFKHRPWKKYQFPQSIDP LTNLMYVLWLFFVVMAWNWNCWLIPVRWAFPYQTPDNIHHWLLMDYLCDL IYFLDITVFQTRLQFVRGGDIITDKKDMRNNYLKSRRFKMDLLSLLPLDF LYLKVGVNPLLRLPRCLKYMAFFEFNSRLESILSKAYVYRVIRTTAYLLY SLHLNSCLYYWASAYQGLGSTHWVYDGVGNSYIRCYYFAVKTLITIGGLP DPKTLFEIVFQLLNYFTGVFAFSVMIGQMRDVVGAATAGQTYYRSCMDST VKYMNFYKIPKSVQNRVKTWYEYTWHSQGMLDESELMVQLPDKMRLDLAI DVNYNIVSKVALFQGCDRQMIFDMLKRLRSVVYLPNDYVCKKGEIGREMY IIQAGQVQVLGGPDGKSVLVTLKAGSVFGEISLLAVGGGNRRTANVVAHG FTNLFILDKKDLNEILVHYPESQKLLRKKARRMLRSNNKPKEEKSVLILP PRAGTPKLFNAALAMTGKMGGKGAKGGKLAHLRARLKELAALEAAAKQQE LVEQAKSSQDVKGEEGSAAPDQHTHPKEAATDPPAPRTPPEPPGSPPSSP PPASLGRPEGEEEGPAEPEEHSVRICMSPGPEPGEQILSVKMPEEREEKA E A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do ionnih kanaliv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport ioniv transport alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z nukleotidami Lokalizovanij u membrani LiteraturaGrunwald M E Yu W P Yu H H Yau K W 1998 Identification of a domain on the beta subunit of the rod cGMP gated cation channel that mediates inhibition by calcium calmodulin J Biol Chem 273 9148 9157 PMID 9535905 DOI 10 1074 jbc 273 15 9148 Ardell M D Bedsole D L Schoborg R V Pittler S J 2000 Genomic organization of the human rod photoreceptor cGMP gated cation channel beta subunit gene Gene 245 311 318 PMID 10717482 DOI 10 1016 S0378 1119 00 00023 8 Bradley J Boenigk W Yau K W Frings S 2004 Calmodulin permanently associates with rat olfactory CNG channels under native conditions Nat Neurosci 7 705 710 PMID 15195096 DOI 10 1038 nn1266 Pentia D C Hosier S Cote R H 2006 The glutamic acid rich protein 2 GARP2 is a high affinity rod photoreceptor phosphodiesterase PDE6 binding protein that modulates its catalytic properties J Biol Chem 281 5500 5505 PMID 16407240 DOI 10 1074 jbc M507488200PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CNGB1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 2151 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi