CLCA1

CLCA1 (англ. Chloride channel accessory 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 914 амінокислот, а молекулярна маса — 100 226.

CLCA1
Ідентифікатори
Символи	CLCA1, CACC, CACC1, CLCRG1, CaCC-1, GOB5, hhCaCC-1, chloride channel accessory 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603906 MGI: 1346342 HomoloGene: 984 GeneCards: CLCA1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • chloride channel activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity Клітинна компонента • extracellular region • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • Мікроворсинки • zymogen granule membrane • мембрана • клітинна мембрана • secretory granule • міжклітинний простір Біологічний процес • calcium ion transport • протеоліз • chloride transport • ion transport • ion transmembrane transport • cellular response to hypoxia • chloride transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1179	23844
Ensembl	ENSG00000016490	ENSMUSG00000028255
UniProt	A8K7I4	Q9D7Z6
RefSeq (мРНК)	NM_001285	NM_017474
RefSeq (білок)	NP_001276	NP_059502
Локус (UCSC)	Хр. 1: 86.47 – 86.5 Mb	Хр. 3: 144.71 – 144.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPFKSSVFI		LILHLLEGAL		SNSLIQLNNN		GYEGIVVAID		PNVPEDETLI
QQIKDMVTQA		SLYLLEATGK		RFYFKNVAIL		IPETWKTKAD		YVRPKLETYK
NADVLVAEST		PPGNDEPYTE		QMGNCGEKGE		RIHLTPDFIA		GKKLAEYGPQ
GRAFVHEWAH		LRWGVFDEYN		NDEKFYLSNG		RIQAVRCSAG		ITGTNVVKKC
QGGSCYTKRC		TFNKVTGLYE		KGCEFVLQSR		QTEKASIMFA		QHVDSIVEFC
TEQNHNKEAP		NKQNQKCNLR		STWEVIRDSE		DFKKTTPMTT		QPPNPTFSLL
QIGQRIVCLV		LDKSGSMATG		NRLNRLNQAG		QLFLLQTVEL		GSWVGMVTFD
SAAHVQNELI		QINSGSDRDT		LAKRLPAAAS		GGTSICSGLR		SAFTVIRKKY
PTDGSEIVLL		TDGEDNTISG		CFNEVKQSGA		IIHTVALGPS		AAQELEELSK
MTGGLQTYAS		DQVQNNGLID		AFGALSSGNG		AVSQRSIQLE		SKGLTLQNSQ
WMNGTVIVDS		TVGKDTLFLI		TWTMQPPQIL		LWDPSGQKQG		GFVVDKNTKM
AYLQIPGIAK		VGTWKYSLQA		SSQTLTLTVT		SRASNATLPP		ITVTSKTNKD
TSKFPSPLVV		YANIRQGASP		ILRASVTALI		ESVNGKTVTL		ELLDNGAGAD
ATKDDGVYSR		YFTTYDTNGR		YSVKVRALGG		VNAARRRVIP		QQSGALYIPG
WIENDEIQWN		PPRPEINKDD		VQHKQVCFSR		TSSGGSFVAS		DVPNAPIPDL
FPPGQITDLK		AEIHGGSLIN		LTWTAPGDDY		DHGTAHKYII		RISTSILDLR
DKFNESLQVN		TTALIPKEAN		SEEVFLFKPE		NITFENGTDL		FIAIQAVDKV
DLKSEISNIA		RVSLFIPPQT		PPETPSPDET		SAPCPNIHIN		STIPGIHILK
IMWKWIGELQ		LSIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
• Bustin S.A., Li S.-R., Dorudi S. (2001). Expression of the Ca2+-activated chloride channel genes CLCA1 and CLCA2 is downregulated in human colorectal cancer. DNA Cell Biol. 20: 331—338. PMID 11445004 DOI:10.1089/10445490152122442
• Toda M., Tulic M.K., Levitt R.C., Hamid Q. (2002). A calcium-activated chloride channel (HCLCA1) is strongly related to IL-9 expression and mucus production in bronchial epithelium of patients with asthma. J. Allergy Clin. Immunol. 109: 246—250. PMID 11842292 DOI:10.1067/mai.2002.121555
• Thai P., Chen Y., Dolganov G., Wu R. (2005). Differential regulation of MUC5AC/Muc5ac and hCLCA-1/mGob-5 expression in airway epithelium. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 33: 523—530. PMID 16151054 DOI:10.1165/rcmb.2004-0220RC

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2015 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
4. (англ.) . Архів оригіналу за 14 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1