CIITA (англ. Class II major histocompatibility complex transactivator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 123 514.
CIITA | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CIITA, C2TA, CIITAIV, MHC2TA, NLRA, class II, major histocompatibility complex, transactivator, class II major histocompatibility complex transactivator | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600005 MGI: 108445 HomoloGene: 207 GeneCards: CIITA | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
неспецифічний виразковий коліт, bare lymphocyte syndrome 2 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 10.87 – 10.94 Mb | Хр. 16: 10.3 – 10.35 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRCLAPRPAG | SYLSEPQGSS | QCATMELGPL | EGGYLELLNS | DADPLCLYHF | ||||
YDQMDLAGEE | EIELYSEPDT | DTINCDQFSR | LLCDMEGDEE | TREAYANIAE | ||||
LDQYVFQDSQ | LEGLSKDIFK | HIGPDEVIGE | SMEMPAEVGQ | KSQKRPFPEE | ||||
LPADLKHWKP | AEPPTVVTGS | LLVRPVSDCS | TLPCLPLPAL | FNQEPASGQM | ||||
RLEKTDQIPM | PFSSSSLSCL | NLPEGPIQFV | PTISTLPHGL | WQISEAGTGV | ||||
SSIFIYHGEV | PQASQVPPPS | GFTVHGLPTS | PDRPGSTSPF | APSATDLPSM | ||||
PEPALTSRAN | MTEHKTSPTQ | CPAAGEVSNK | LPKWPEPVEQ | FYRSLQDTYG | ||||
AEPAGPDGIL | VEVDLVQARL | ERSSSKSLER | ELATPDWAER | QLAQGGLAEV | ||||
LLAAKEHRRP | RETRVIAVLG | KAGQGKSYWA | GAVSRAWACG | RLPQYDFVFS | ||||
VPCHCLNRPG | DAYGLQDLLF | SLGPQPLVAA | DEVFSHILKR | PDRVLLILDG | ||||
FEELEAQDGF | LHSTCGPAPA | EPCSLRGLLA | GLFQKKLLRG | CTLLLTARPR | ||||
GRLVQSLSKA | DALFELSGFS | MEQAQAYVMR | YFESSGMTEH | QDRALTLLRD | ||||
RPLLLSHSHS | PTLCRAVCQL | SEALLELGED | AKLPSTLTGL | YVGLLGRAAL | ||||
DSPPGALAEL | AKLAWELGRR | HQSTLQEDQF | PSADVRTWAM | AKGLVQHPPR | ||||
AAESELAFPS | FLLQCFLGAL | WLALSGEIKD | KELPQYLALT | PRKKRPYDNW | ||||
LEGVPRFLAG | LIFQPPARCL | GALLGPSAAA | SVDRKQKVLA | RYLKRLQPGT | ||||
LRARQLLELL | HCAHEAEEAG | IWQHVVQELP | GRLSFLGTRL | TPPDAHVLGK | ||||
ALEAAGQDFS | LDLRSTGICP | SGLGSLVGLS | CVTRFRAALS | DTVALWESLQ | ||||
QHGETKLLQA | AEEKFTIEPF | KAKSLKDVED | LGKLVQTQRT | RSSSEDTAGE | ||||
LPAVRDLKKL | EFALGPVSGP | QAFPKLVRIL | TAFSSLQHLD | LDALSENKIG | ||||
DEGVSQLSAT | FPQLKSLETL | NLSQNNITDL | GAYKLAEALP | SLAASLLRLS | ||||
LYNNCICDVG | AESLARVLPD | MVSLRVMDVQ | YNKFTAAGAQ | QLAASLRRCP | ||||
HVETLAMWTP | TIPFSVQEHL | QQQDSRISLR |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, активаторів, ацилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.
Література
- Steimle V., Otten L.A., Zufferey M., Mach B. (1993). Complementation cloning of an MHC class II transactivator mutated in hereditary MHC class II deficiency (or bare lymphocyte syndrome). Cell. 75: 135—146. PMID 8402893 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80090-X
- Riley J.L., Westerheide S.D., Price J.A., Brown J.A., Boss J.M. (1995). Activation of class II MHC genes requires both the X box region and the class II transactivator (CIITA). Immunity. 2: 533—543. PMID 7749984 DOI:10.1016/1074-7613(95)90033-0
- Day N.E., Ugai H., Yokoyama K.K., Ichiki A.T. (2003). K-562 cells lack MHC class II expression due to an alternatively spliced CIITA transcript with a truncated coding region. Leuk. Res. 27: 1027—1038. PMID 12859996 DOI:10.1016/S0145-2126(03)00072-9
- Harton J.A., Cressman D.E., Chin K.C., Der C.J., Ting J.P. (1999). GTP binding by class II transactivator: role in nuclear import. Science. 285: 1402—1405. PMID 10464099 DOI:10.1126/science.285.5432.1402
- Soe K.C., Devaiah B.N., Singer D.S. (2013). Transcriptional coactivator CIITA, a functional homolog of TAF1, has kinase activity. Biochim. Biophys. Acta. 1829: 1184—1190. PMID 24036077 DOI:10.1016/j.bbagrm.2013.09.001
- Quan V., Towey M., Sacks S., Kelly A.P. (1999). Absence of MHC class II gene expression in a patient with a single amino acid substitution in the class II transactivator protein CIITA. Immunogenetics. 49: 957—963. PMID 10501838 DOI:10.1007/s002510050579
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з CIITA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CIITA angl Class II major histocompatibility complex transactivator bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 130 aminokislot a molekulyarna masa 123 514 CIITAIdentifikatoriSimvoliCIITA C2TA CIITAIV MHC2TA NLRA class II major histocompatibility complex transactivator class II major histocompatibility complex transactivatorZovnishni ID OMIM 600005 MGI 108445 HomoloGene 207 GeneCards CIITAPov yazani genetichni zahvoryuvannyanespecifichnij virazkovij kolit bare lymphocyte syndrome 2 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya transferase activity DNA binding nucleotide binding GO 0001105 transcription coactivator activity GTP binding kinase activity protein C terminus binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding acyltransferase activity ATP binding GO 0032403 protein containing complex bindingKlitinna komponenta PML body nukleoplazma klitinne yadroBiologichnij proces positive regulation of MHC class II biosynthetic process GO 0009373 regulation of transcription DNA templated response to interferon gamma fosforilyuvannya interferon gamma mediated signaling pathway GO 1904576 response to antibiotic GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated positive regulation of MHC class I biosynthetic process negative regulation of collagen biosynthetic process GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II inflammatory responseDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4261 12265Ensembl ENSG00000179583 ENSMUSG00000022504UniProt P33076 P79621RefSeq mRNK NM 000246 NM 001286402 NM 001286403 NM 001379330 NM 001379331NM 001379332 NM 001379333 NM 001379334NM 001243760 NM 001243761 NM 007575 NM 001302618 NM 001302619RefSeq bilok NP 000237 NP 001273331 NP 001273332 NP 001366259 NP 001366260NP 001366261 NP 001366262 NP 001366263NP 001230689 NP 001230690 NP 001289547 NP 001289548 NP 031601Lokus UCSC Hr 16 10 87 10 94 MbHr 16 10 3 10 35 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRCLAPRPAGSYLSEPQGSSQCATMELGPLEGGYLELLNSDADPLCLYHF YDQMDLAGEEEIELYSEPDTDTINCDQFSRLLCDMEGDEETREAYANIAE LDQYVFQDSQLEGLSKDIFKHIGPDEVIGESMEMPAEVGQKSQKRPFPEE LPADLKHWKPAEPPTVVTGSLLVRPVSDCSTLPCLPLPALFNQEPASGQM RLEKTDQIPMPFSSSSLSCLNLPEGPIQFVPTISTLPHGLWQISEAGTGV SSIFIYHGEVPQASQVPPPSGFTVHGLPTSPDRPGSTSPFAPSATDLPSM PEPALTSRANMTEHKTSPTQCPAAGEVSNKLPKWPEPVEQFYRSLQDTYG AEPAGPDGILVEVDLVQARLERSSSKSLERELATPDWAERQLAQGGLAEV LLAAKEHRRPRETRVIAVLGKAGQGKSYWAGAVSRAWACGRLPQYDFVFS VPCHCLNRPGDAYGLQDLLFSLGPQPLVAADEVFSHILKRPDRVLLILDG FEELEAQDGFLHSTCGPAPAEPCSLRGLLAGLFQKKLLRGCTLLLTARPR GRLVQSLSKADALFELSGFSMEQAQAYVMRYFESSGMTEHQDRALTLLRD RPLLLSHSHSPTLCRAVCQLSEALLELGEDAKLPSTLTGLYVGLLGRAAL DSPPGALAELAKLAWELGRRHQSTLQEDQFPSADVRTWAMAKGLVQHPPR AAESELAFPSFLLQCFLGALWLALSGEIKDKELPQYLALTPRKKRPYDNW LEGVPRFLAGLIFQPPARCLGALLGPSAAASVDRKQKVLARYLKRLQPGT LRARQLLELLHCAHEAEEAGIWQHVVQELPGRLSFLGTRLTPPDAHVLGK ALEAAGQDFSLDLRSTGICPSGLGSLVGLSCVTRFRAALSDTVALWESLQ QHGETKLLQAAEEKFTIEPFKAKSLKDVEDLGKLVQTQRTRSSSEDTAGE LPAVRDLKKLEFALGPVSGPQAFPKLVRILTAFSSLQHLDLDALSENKIG DEGVSQLSATFPQLKSLETLNLSQNNITDLGAYKLAEALPSLAASLLRLS LYNNCICDVGAESLARVLPDMVSLRVMDVQYNKFTAAGAQQLAASLRRCP HVETLAMWTPTIPFSVQEHLQQQDSRISLR A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz kinaz aktivatoriv aciltransferaz fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami GTF Lokalizovanij u yadri LiteraturaSteimle V Otten L A Zufferey M Mach B 1993 Complementation cloning of an MHC class II transactivator mutated in hereditary MHC class II deficiency or bare lymphocyte syndrome Cell 75 135 146 PMID 8402893 DOI 10 1016 S0092 8674 05 80090 X Riley J L Westerheide S D Price J A Brown J A Boss J M 1995 Activation of class II MHC genes requires both the X box region and the class II transactivator CIITA Immunity 2 533 543 PMID 7749984 DOI 10 1016 1074 7613 95 90033 0 Day N E Ugai H Yokoyama K K Ichiki A T 2003 K 562 cells lack MHC class II expression due to an alternatively spliced CIITA transcript with a truncated coding region Leuk Res 27 1027 1038 PMID 12859996 DOI 10 1016 S0145 2126 03 00072 9 Harton J A Cressman D E Chin K C Der C J Ting J P 1999 GTP binding by class II transactivator role in nuclear import Science 285 1402 1405 PMID 10464099 DOI 10 1126 science 285 5432 1402 Soe K C Devaiah B N Singer D S 2013 Transcriptional coactivator CIITA a functional homolog of TAF1 has kinase activity Biochim Biophys Acta 1829 1184 1190 PMID 24036077 DOI 10 1016 j bbagrm 2013 09 001 Quan V Towey M Sacks S Kelly A P 1999 Absence of MHC class II gene expression in a patient with a single amino acid substitution in the class II transactivator protein CIITA Immunogenetics 49 957 963 PMID 10501838 DOI 10 1007 s002510050579PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CIITA pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 23 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 16 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi