CHAF1A (англ. Chromatin assembly factor 1 subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 956 амінокислот, а молекулярна маса — 106 926.
CHAF1A | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CHAF1A, CAF-1, CAF1, CAF1B, CAF1P150, P150, chromatin assembly factor 1 subunit A | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601246 MGI: 1351331 HomoloGene: 4003 GeneCards: CHAF1A | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 19: 4.4 – 4.45 Mb | Хр. 17: 56.35 – 56.38 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLEELECGAP | GARGAATAMD | CKDRPAFPVK | KLIQARLPFK | RLNLVPKGKA | ||||
DDMSDDQGTS | VQSKSPDLEA | SLDTLENNCH | VGSDIDFRPK | LVNGKGPLDN | ||||
FLRNRIETSI | GQSTVIIDLT | EDSNEQPDSL | VDHNKLNSEA | SPSREAINGQ | ||||
REDTGDQQGL | LKAIQNDKLA | FPGETLSDIP | CKTEEEGVGC | GGAGRRGDSQ | ||||
ECSPRSCPEL | TSGPRMCPRK | EQDSWSEAGG | ILFKGKVPMV | VLQDILAVRP | ||||
PQIKSLPATP | QGKNMTPESE | VLESFPEEDS | VLSHSSLSSP | SSTSSPEGPP | ||||
APPKQHSSTS | PFPTSTPLRR | ITKKFVKGST | EKNKLRLQRD | QERLGKQLKL | ||||
RAEREEKEKL | KEEAKRAKEE | AKKKKEEEKE | LKEKERREKR | EKDEKEKAEK | ||||
QRLKEERRKE | RQEALEAKLE | EKRKKEEEKR | LREEEKRIKA | EKAEITRFFQ | ||||
KPKTPQAPKT | LAGSCGKFAP | FEIKEHMVLA | PRRRTAFHPD | LCSQLDQLLQ | ||||
QQSGEFSFLK | DLKGRQPLRS | GPTHVSTRNA | DIFNSDVVIV | ERGKGDGVPE | ||||
RRKFGRMKLL | QFCENHRPAY | WGTWNKKTAL | IRARDPWAQD | TKLLDYEVDS | ||||
DEEWEEEEPG | ESLSHSEGDD | DDDMGEDEDE | DDGFFVPHGY | LSEDEGVTEE | ||||
CADPENHKVR | QKLKAKEWDE | FLAKGKRFRV | LQPVKIGCVW | AADRDCAGDD | ||||
LKVLQQFAAC | FLETLPAQEE | QTPKASKRER | RDEQILAQLL | PLLHGNVNGS | ||||
KVIIREFQEH | CRRGLLSNHT | GSPRSPSTTY | LHTPTPSEDA | AIPSKSRLKR | ||||
LISENSVYEK | RPDFRMCWYV | HPQVLQSFQQ | EHLPVPCQWS | YVTSVPSAPK | ||||
EDSGSVPSTG | PSQGTPISLK | RKSAGSMCIT | QFMKKRRHDG | QIGAEDMDGF | ||||
QADTEEEEEE | EGDCMIVDVP | DAAEVQAPCG | AASGAGGGVG | VDTGKATLTS | ||||
SPLGAS |
Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kaufman P.D., Kobayashi R., Kessler N., Stillman B. (1995). The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I: a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication. Cell. 81: 1105—1114. PMID 7600578 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80015-7
- Shibahara K., Stillman B. (1999). Replication-dependent marking of DNA by PCNA facilitates CAF-1-coupled inheritance of chromatin. Cell. 96: 575—585. PMID 10052459 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80661-3
- Quivy J.-P., Grandi P., Almouzni G. (2001). Dimerization of the largest subunit of chromatin assembly factor 1: importance in vitro and during Xenopus early development. EMBO J. 20: 2015—2027. PMID 11296234 DOI:10.1093/emboj/20.8.2015
- Reese B.E., Bachman K.E., Baylin S.B., Rountree M.R. (2003). The methyl-CpG binding protein MBD1 interacts with the p150 subunit of chromatin assembly factor 1. Mol. Cell. Biol. 23: 3226—3236. PMID 12697822 DOI:10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003
- Sarraf S.A., Stancheva I. (2004). Methyl-CpG binding protein MBD1 couples histone H3 methylation at lysine 9 by SETDB1 to DNA replication and chromatin assembly. Mol. Cell. 15: 595—605. PMID 15327775 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.043
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1910 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CHAF1A angl Chromatin assembly factor 1 subunit A bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 19 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 956 aminokislot a molekulyarna masa 106 926 CHAF1ANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1S4ZIdentifikatoriSimvoliCHAF1A CAF 1 CAF1 CAF1B CAF1P150 P150 chromatin assembly factor 1 subunit AZovnishni ID OMIM 601246 MGI 1351331 HomoloGene 4003 GeneCards CHAF1AOntologiya genaMolekulyarna funkciya unfolded protein binding chromatin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding chromo shadow domain binding identical protein bindingKlitinna komponenta CAF 1 complex klitinne yadro GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces replikaciya DNK klitinnij cikl GO 0100026 Reparaciya DNK cellular response to DNA damage stimulus GO 0034723 DNA replication dependent chromatin assembly nucleosome assemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10036 27221Ensembl ENSG00000167670 ENSMUSG00000002835UniProt Q13111 Q9QWF0RefSeq mRNK NM 005483NM 013733RefSeq bilok NP 005474NP 038761Lokus UCSC Hr 19 4 4 4 45 MbHr 17 56 35 56 38 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLEELECGAPGARGAATAMDCKDRPAFPVKKLIQARLPFKRLNLVPKGKA DDMSDDQGTSVQSKSPDLEASLDTLENNCHVGSDIDFRPKLVNGKGPLDN FLRNRIETSIGQSTVIIDLTEDSNEQPDSLVDHNKLNSEASPSREAINGQ REDTGDQQGLLKAIQNDKLAFPGETLSDIPCKTEEEGVGCGGAGRRGDSQ ECSPRSCPELTSGPRMCPRKEQDSWSEAGGILFKGKVPMVVLQDILAVRP PQIKSLPATPQGKNMTPESEVLESFPEEDSVLSHSSLSSPSSTSSPEGPP APPKQHSSTSPFPTSTPLRRITKKFVKGSTEKNKLRLQRDQERLGKQLKL RAEREEKEKLKEEAKRAKEEAKKKKEEEKELKEKERREKREKDEKEKAEK QRLKEERRKERQEALEAKLEEKRKKEEEKRLREEEKRIKAEKAEITRFFQ KPKTPQAPKTLAGSCGKFAPFEIKEHMVLAPRRRTAFHPDLCSQLDQLLQ QQSGEFSFLKDLKGRQPLRSGPTHVSTRNADIFNSDVVIVERGKGDGVPE RRKFGRMKLLQFCENHRPAYWGTWNKKTALIRARDPWAQDTKLLDYEVDS DEEWEEEEPGESLSHSEGDDDDDMGEDEDEDDGFFVPHGYLSEDEGVTEE CADPENHKVRQKLKAKEWDEFLAKGKRFRVLQPVKIGCVWAADRDCAGDD LKVLQQFAACFLETLPAQEEQTPKASKRERRDEQILAQLLPLLHGNVNGS KVIIREFQEHCRRGLLSNHTGSPRSPSTTYLHTPTPSEDAAIPSKSRLKR LISENSVYEKRPDFRMCWYVHPQVLQSFQQEHLPVPCQWSYVTSVPSAPK EDSGSVPSTGPSQGTPISLKRKSAGSMCITQFMKKRRHDGQIGAEDMDGF QADTEEEEEEEGDCMIVDVPDAAEVQAPCGAASGAGGGVGVDTGKATLTS SPLGAS A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do shaperoniv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl poshkodzhennya DNK reparaciya DNK replikaciya DNK alternativnij splajsing Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kaufman P D Kobayashi R Kessler N Stillman B 1995 The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication Cell 81 1105 1114 PMID 7600578 DOI 10 1016 S0092 8674 05 80015 7 Shibahara K Stillman B 1999 Replication dependent marking of DNA by PCNA facilitates CAF 1 coupled inheritance of chromatin Cell 96 575 585 PMID 10052459 DOI 10 1016 S0092 8674 00 80661 3 Quivy J P Grandi P Almouzni G 2001 Dimerization of the largest subunit of chromatin assembly factor 1 importance in vitro and during Xenopus early development EMBO J 20 2015 2027 PMID 11296234 DOI 10 1093 emboj 20 8 2015 Reese B E Bachman K E Baylin S B Rountree M R 2003 The methyl CpG binding protein MBD1 interacts with the p150 subunit of chromatin assembly factor 1 Mol Cell Biol 23 3226 3236 PMID 12697822 DOI 10 1128 MCB 23 9 3226 3236 2003 Sarraf S A Stancheva I 2004 Methyl CpG binding protein MBD1 couples histone H3 methylation at lysine 9 by SETDB1 to DNA replication and chromatin assembly Mol Cell 15 595 605 PMID 15327775 DOI 10 1016 j molcel 2004 06 043PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 1910 angl Procitovano 12 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 23 veresnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 19 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi