CDH13 (англ. Cadherin 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 713 амінокислот, а молекулярна маса — 78 287.
CDH13 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CDH13, CDHH, P105, cadherin 13 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601364 MGI: 99551 HomoloGene: 20335 GeneCards: CDH13 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
періодонтит, шизофренія, депресія клінічна, розлад дефіциту уваги та гіперактивності | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 82.63 – 83.8 Mb | Хр. 8: 119.01 – 120.05 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MQPRTPLVLC | VLLSQVLLLT | SAEDLDCTPG | FQQKVFHINQ | PAEFIEDQSI | ||||
LNLTFSDCKG | NDKLRYEVSS | PYFKVNSDGG | LVALRNITAV | GKTLFVHART | ||||
PHAEDMAELV | IVGGKDIQGS | LQDIFKFART | SPVPRQKRSI | VVSPILIPEN | ||||
QRQPFPRDVG | KVVDSDRPER | SKFRLTGKGV | DQEPKGIFRI | NENTGSVSVT | ||||
RTLDREVIAV | YQLFVETTDV | NGKTLEGPVP | LEVIVIDQND | NRPIFREGPY | ||||
IGHVMEGSPT | GTTVMRMTAF | DADDPATDNA | LLRYNIRQQT | PDKPSPNMFY | ||||
IDPEKGDIVT | VVSPALLDRE | TLENPKYELI | IEAQDMAGLD | VGLTGTATAT | ||||
IMIDDKNDHS | PKFTKKEFQA | TVEEGAVGVI | VNLTVEDKDD | PTTGAWRAAY | ||||
TIINGNPGQS | FEIHTNPQTN | EGMLSVVKPL | DYEISAFHTL | LIKVENEDPL | ||||
VPDVSYGPSS | TATVHITVLD | VNEGPVFYPD | PMMVTRQEDL | SVGSVLLTVN | ||||
ATDPDSLQHQ | TIRYSVYKDP | AGWLNINPIN | GTVDTTAVLD | RESPFVDNSV | ||||
YTALFLAIDS | GNPPATGTGT | LLITLEDVND | NAPFIYPTVA | EVCDDAKNLS | ||||
VVILGASDKD | LHPNTDPFKF | EIHKQAVPDK | VWKISKINNT | HALVSLLQNL | ||||
NKANYNLPIM | VTDSGKPPMT | NITDLRVQVC | SCRNSKVDCN | AAGALRFSLP | ||||
SVLLLSLFSL | ACL |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Lee S.W. (1996). H-cadherin, a novel cadherin with growth inhibitory functions and diminished expression in human breast cancer. Nat. Med. 2: 776—782. PMID 8673923 DOI:10.1038/nm0796-776
- Sato M., Mori Y., Sakurada A., Fujimura S., Horii A. (1998). The H-cadherin (CDH13) gene is inactivated in human lung cancer. Hum. Genet. 103: 96—101. PMID 9737784 DOI:10.1007/s004390050790
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Niermann T., Kern F., Erne P., Resink T. (2000). The glycosyl phosphatidylinositol anchor of human T-cadherin binds lipoproteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 276: 1240—1247. PMID 11027617 DOI:10.1006/bbrc.2000.3465
- Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з CDH13 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CDH13 angl Cadherin 13 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 713 aminokislot a molekulyarna masa 78 287 CDH13Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2V37IdentifikatoriSimvoliCDH13 CDHH P105 cadherin 13Zovnishni ID OMIM 601364 MGI 99551 HomoloGene 20335 GeneCards CDH13Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaperiodontit shizofreniya depresiya klinichna rozlad deficitu uvagi ta giperaktivnosti Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding protein homodimerization activity adiponectin binding cadherin binding zv yazuvannya z ionom metalu low density lipoprotein particle binding lipoprotein particle binding cytoskeletal protein bindingKlitinna komponenta citoplazma membrana focal adhesion klitinna membrana perinuclear region of cytoplasm caveola anchored component of membrane neuron projection ekzosoma external side of plasma membrane mizhklitinnij prostir GO 0005578 Pozaklitinna matricya extracellular region cell surface catenin complex sinaps collagen containing extracellular matrix GABA ergic synapseBiologichnij proces calcium dependent cell cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules regulation of endocytosis positive regulation of smooth muscle cell proliferation negative regulation of cell adhesion positive regulation of calcium mediated signaling positive regulation of endothelial cell proliferation positive regulation of cell matrix adhesion positive regulation of cell migration low density lipoprotein particle mediated signaling regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway sprouting angiogenesis response to organic substance positive regulation of positive chemotaxis keratinocyte proliferation adgeziya klitin Rho protein signal transduction GO 0007067 mitoz Rac protein signal transduction localization within membrane adherens junction organization endothelial cell migration negative regulation of cell population proliferation lamellipodium assembly homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0000767 cell morphogenesis cell cell junction assembly cell cell adhesion mediated by cadherin cell cell adhesionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1012 12554Ensembl ENSG00000140945 ENSMUSG00000031841UniProt P55290 Q9WTR5RefSeq mRNK NM 001220488 NM 001220489 NM 001220490 NM 001220491 NM 001220492NM 001257NM 019707RefSeq bilok NP 001207417 NP 001207418 NP 001207419 NP 001207420 NP 001207421NP 001248NP 062681Lokus UCSC Hr 16 82 63 83 8 MbHr 8 119 01 120 05 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSI LNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHART PHAEDMAELVIVGGKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPEN QRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVT RTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPY IGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFY IDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATAT IMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPTTGAWRAAY TIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPL VPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVN ATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSV YTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLS VVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNL NKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLP SVLLLSLFSLACL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani LiteraturaLee S W 1996 H cadherin a novel cadherin with growth inhibitory functions and diminished expression in human breast cancer Nat Med 2 776 782 PMID 8673923 DOI 10 1038 nm0796 776 Sato M Mori Y Sakurada A Fujimura S Horii A 1998 The H cadherin CDH13 gene is inactivated in human lung cancer Hum Genet 103 96 101 PMID 9737784 DOI 10 1007 s004390050790 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Niermann T Kern F Erne P Resink T 2000 The glycosyl phosphatidylinositol anchor of human T cadherin binds lipoproteins Biochem Biophys Res Commun 276 1240 1247 PMID 11027617 DOI 10 1006 bbrc 2000 3465 Tanihara H Sano K Heimark R L St John T Suzuki S 1994 Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin Cell Adhes Commun 2 15 26 PMID 7982033PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CDH13 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 14 veresnya 2015 Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 27 veresnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij