CCR5 (англ. C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 40 524.
CCR5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | CCR5, CC-CKR-5, CCCKR5, CCR-5, CD195, CKR-5, CKR5, CMKBR5, IDDM22, C-C motif chemokine receptor 5 (gene/pseudogene), C-C motif chemokine receptor 5 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601373 MGI: 107182 HomoloGene: 37325 GeneCards: CCR5 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
type 1 diabetes mellitus 22, ВІЛ-заворювання | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
aplaviroc, ценікрівірок, маравірок, vicriviroc, aplaviroc hydrochloride, AZD5672 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 3: 46.37 – 46.38 Mb | Хр. 9: 123.92 – 123.95 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDYQVSSPIY | DINYYTSEPC | QKINVKQIAA | RLLPPLYSLV | FIFGFVGNML | ||||
VILILINCKR | LKSMTDIYLL | NLAISDLFFL | LTVPFWAHYA | AAQWDFGNTM | ||||
CQLLTGLYFI | GFFSGIFFII | LLTIDRYLAV | VHAVFALKAR | TVTFGVVTSV | ||||
ITWVVAVFAS | LPGIIFTRSQ | KEGLHYTCSS | HFPYSQYQFW | KNFQTLKIVI | ||||
LGLVLPLLVM | VICYSGILKT | LLRCRNEKKR | HRAVRLIFTI | MIVYFLFWAP | ||||
YNIVLLLNTF | QEFFGLNNCS | SSNRLDQAMQ | VTETLGMTHC | CINPIIYAFV | ||||
GEKFRNYLLV | FFQKHIAKRF | CKCCSIFQQE | APERASSVYT | RSTGEQEISV | ||||
GL |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Samson M., Labbe O., Mollereau C., Vassart G., Parmentier M. (1996). Molecular cloning and functional expression of a new human CC-chemokine receptor gene. Biochemistry. 35: 3362—3367. PMID 8639485 DOI:10.1021/bi952950g
- Raport C.J., Gosling J., Schweichart V.L., Gray P.W., Charo I.F. (1996). Molecular cloning and functional characterization of a novel human CC chemokine receptor (CCR5) for RANTES, MIP-1beta, and MIP-1alpha. J. Biol. Chem. 271: 17161—17166. PMID 8663314 DOI:10.1074/jbc.271.29.17161
- Mummidi S., Ahuja S.S., McDaniel B.L., Ahuja S.K. (1997). The human CC chemokine receptor 5 (CCR5) gene. Multiple transcripts with 5'-end heterogeneity, dual promoter usage, and evidence for polymorphisms within the regulatory regions and noncoding exons. J. Biol. Chem. 272: 30662—30671. PMID 9388201 DOI:10.1074/jbc.272.49.30662
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Oppermann M., Mack M., Proudfoot A.E., Olbrich H. (1999). Differential effects of CC chemokines on CC chemokine receptor 5 (CCR5) phosphorylation and identification of phosphorylation sites on the CCR5 carboxyl terminus. J. Biol. Chem. 274: 8875—8885. PMID 10085131 DOI:10.1074/jbc.274.13.8875
- Schweneker M., Bachmann A.S., Moelling K. (2005). JM4 is a four-transmembrane protein binding to the CCR5 receptor. FEBS Lett. 579: 1751—1758. PMID 15757671 DOI:10.1016/j.febslet.2005.02.037
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з CCR5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
CCR5 angl C C motif chemokine receptor 5 gene pseudogene bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 3 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 352 aminokislot a molekulyarna masa 40 524 CCR5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2L87 2RLL 2RRS 2MZX 4MBSIdentifikatoriSimvoliCCR5 CC CKR 5 CCCKR5 CCR 5 CD195 CKR 5 CKR5 CMKBR5 IDDM22 C C motif chemokine receptor 5 gene pseudogene C C motif chemokine receptor 5Zovnishni ID OMIM 601373 MGI 107182 HomoloGene 37325 GeneCards CCR5Pov yazani genetichni zahvoryuvannyatype 1 diabetes mellitus 22 VIL zavoryuvannya Reaguye na spolukuaplaviroc cenikrivirok maravirok vicriviroc aplaviroc hydrochloride AZD5672 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya G protein coupled receptor activity coreceptor activity chemokine C C motif ligand 5 binding virus receptor activity signal transducer activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding chemokine receptor activity C C chemokine receptor activity actin binding phosphatidylinositol phospholipase C activity C C chemokine binding chemokine bindingKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane endosoma membrana klitinna membrana integral component of plasma membrane external side of plasma membrane cell surfaceBiologichnij proces G protein coupled receptor signaling pathway signaling response to cholesterol release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum positive regulation of cytosolic calcium ion concentration cell cell signaling dendritic cell chemotaxis MAPK cascade hemotaksis cellular defense response cell surface receptor signaling pathway GO 0046730 GO 0046737 GO 0046738 GO 0046736 imunna vidpovid inflammatory response cellular response to lipopolysaccharide calcium ion transport calcium mediated signaling GO 0072468 signalna transdukciya fusion of virus membrane with host plasma membrane chemokine mediated signaling pathway GO 0022415 viral process defense response negative regulation of macrophage apoptotic process cytokine mediated signaling pathway cell chemotaxisDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez1234 12774Ensembl ENSG00000160791 ENSMUSG00000079227UniProt P51681 P51682RefSeq mRNK NM 001100168 NM 000579 NM 001394783NM 009917RefSeq bilok NP 000570 NP 001093638NP 034047Lokus UCSC Hr 3 46 37 46 38 MbHr 9 123 92 123 95 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFVGNML VILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTM CQLLTGLYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSV ITWVVAVFASLPGIIFTRSQKEGLHYTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVI LGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAP YNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLGMTHCCINPIIYAFV GEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQEISV GL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv klitini hazyayina dlya vhodu virusu receptoriv g bilokspryazhenih receptoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus polimorfizm Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani LiteraturaSamson M Labbe O Mollereau C Vassart G Parmentier M 1996 Molecular cloning and functional expression of a new human CC chemokine receptor gene Biochemistry 35 3362 3367 PMID 8639485 DOI 10 1021 bi952950g Raport C J Gosling J Schweichart V L Gray P W Charo I F 1996 Molecular cloning and functional characterization of a novel human CC chemokine receptor CCR5 for RANTES MIP 1beta and MIP 1alpha J Biol Chem 271 17161 17166 PMID 8663314 DOI 10 1074 jbc 271 29 17161 Mummidi S Ahuja S S McDaniel B L Ahuja S K 1997 The human CC chemokine receptor 5 CCR5 gene Multiple transcripts with 5 end heterogeneity dual promoter usage and evidence for polymorphisms within the regulatory regions and noncoding exons J Biol Chem 272 30662 30671 PMID 9388201 DOI 10 1074 jbc 272 49 30662 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Oppermann M Mack M Proudfoot A E Olbrich H 1999 Differential effects of CC chemokines on CC chemokine receptor 5 CCR5 phosphorylation and identification of phosphorylation sites on the CCR5 carboxyl terminus J Biol Chem 274 8875 8885 PMID 10085131 DOI 10 1074 jbc 274 13 8875 Schweneker M Bachmann A S Moelling K 2005 JM4 is a four transmembrane protein binding to the CCR5 receptor FEBS Lett 579 1751 1758 PMID 15757671 DOI 10 1016 j febslet 2005 02 037PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z CCR5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z CCR5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 12 veresnya 2015 Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 17 serpnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 3 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi