ATRN (англ. Attractin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 429 амінокислот, а молекулярна маса — 158 537.
ATRN | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ATRN, DPPT-L, MGCA, attractin | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603130 MGI: 1341628 HomoloGene: 22542 GeneCards: ATRN | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 20: 3.47 – 3.65 Mb | Хр. 2: 130.75 – 130.87 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MVAAAAATEA | RLRRRTAATA | ALAGRSGGPH | WDWDVTRAGR | PGLGAGLRLP | ||||
RLLSPPLRPR | LLLLLLLLSP | PLLLLLLPCE | AEAAAAAAAV | SGSAAAEAKE | ||||
CDRPCVNGGR | CNPGTGQCVC | PAGWVGEQCQ | HCGGRFRLTG | SSGFVTDGPG | ||||
NYKYKTKCTW | LIEGQPNRIM | RLRFNHFATE | CSWDHLYVYD | GDSIYAPLVA | ||||
AFSGLIVPER | DGNETVPEVV | ATSGYALLHF | FSDAAYNLTG | FNITYSFDMC | ||||
PNNCSGRGEC | KISNSSDTVE | CECSENWKGE | ACDIPHCTDN | CGFPHRGICN | ||||
SSDVRGCSCF | SDWQGPGCSV | PVPANQSFWT | REEYSNLKLP | RASHKAVVNG | ||||
NIMWVVGGYM | FNHSDYNMVL | AYDLASREWL | PLNRSVNNVV | VRYGHSLALY | ||||
KDKIYMYGGK | IDSTGNVTNE | LRVFHIHNES | WVLLTPKAKE | QYAVVGHSAH | ||||
IVTLKNGRVV | MLVIFGHCPL | YGYISNVQEY | DLDKNTWSIL | HTQGALVQGG | ||||
YGHSSVYDHR | TRALYVHGGY | KAFSANKYRL | ADDLYRYDVD | TQMWTILKDS | ||||
RFFRYLHTAV | IVSGTMLVFG | GNTHNDTSMS | HGAKCFSSDF | MAYDIACDRW | ||||
SVLPRPDLHH | DVNRFGHSAV | LHNSTMYVFG | GFNSLLLSDI | LVFTSEQCDA | ||||
HRSEAACLAA | GPGIRCVWNT | GSSQCISWAL | ATDEQEEKLK | SECFSKRTLD | ||||
HDRCDQHTDC | YSCTANTNDC | HWCNDHCVPR | NHSCSEGQIS | IFRYENCPKD | ||||
NPMYYCNKKT | SCRSCALDQN | CQWEPRNQEC | IALPENICGI | GWHLVGNSCL | ||||
KITTAKENYD | NAKLFCRNHN | ALLASLTTQK | KVEFVLKQLR | IMQSSQSMSK | ||||
LTLTPWVGLR | KINVSYWCWE | DMSPFTNSLL | QWMPSEPSDA | GFCGILSEPS | ||||
TRGLKAATCI | NPLNGSVCER | PANHSAKQCR | TPCALRTACG | DCTSGSSECM | ||||
WCSNMKQCVD | SNAYVASFPF | GQCMEWYTMS | TCPPENCSGY | CTCSHCLEQP | ||||
GCGWCTDPSN | TGKGKCIEGS | YKGPVKMPSQ | APTGNFYPQP | LLNSSMCLED | ||||
SRYNWSFIHC | PACQCNGHSK | CINQSICEKC | ENLTTGKHCE | TCISGFYGDP | ||||
TNGGKCQPCK | CNGHASLCNT | NTGKCFCTTK | GVKGDECQLC | EVENRYQGNP | ||||
LRGTCYYTLL | IDYQFTFSLS | QEDDRYYTAI | NFVATPDEQN | RDLDMFINAS | ||||
KNFNLNITWA | ASFSAGTQAG | EEMPVVSKTN | IKEYKDSFSN | EKFDFRNHPN | ||||
ITFFVYVSNF | TWPIKIQIAF | SQHSNFMDLV | QFFVTFFSCF | LSLLLVAAVV | ||||
WKIKQSCWAS | RRREQLLREM | QQMASRPFAS | VNVALETDEE | PPDLIGGSIK | ||||
TVPKPIALEP | CFGNKAAVLS | VFVRLPRGLG | GIPPPGQSGL | AVASALVDIS | ||||
QQMPIVYKEK | SGAVRNRKQQ | PPAQPGTCI |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Duke-Cohan J.S., Morimoto C., Rocker J.A., Schlossman S.F. (1995). A novel form of dipeptidylpeptidase IV found in human serum. Isolation, characterization, and comparison with T lymphocyte membrane dipeptidylpeptidase IV (CD26). J. Biol. Chem. 270: 14107—14114. PMID 7539799 DOI:10.1074/jbc.270.23.14107
- Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:885 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
{{}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url () - UniProt, O75882 (англ.) . Архів оригіналу за 30 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ATRN angl Attractin bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi 3 Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 429 aminokislot a molekulyarna masa 158 537 4 ATRNIdentifikatoriSimvoliATRN DPPT L MGCA attractinZovnishni ID OMIM 603130 MGI 1341628 HomoloGene 22542 GeneCards ATRNOntologiya genaMolekulyarna funkciya carbohydrate binding signaling receptor activityKlitinna komponenta citoplazma integral component of membrane extracellular region klitinna membrana integral component of plasma membrane ekzosoma membrana mizhklitinnij prostirBiologichnij proces myelination pigmentation inflammatory response GO 0001306 response to oxidative stress cerebellum development regulation of multicellular organism growth animal organ morphogenesis gistogenezDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez8455 11990Ensembl ENSG00000088812 ENSMUSG00000027312UniProt O75882 Q9WU60RefSeq mRNK NM 001207047 NM 012070 NM 139321 NM 139322 NM 001323332NM 009730RefSeq bilok NP 001193976 NP 001310261 NP 647537 NP 647538NP 033860Lokus UCSC Hr 20 3 47 3 65 MbHr 2 130 75 130 87 MbPubMed search 1 2 VikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MVAAAAATEARLRRRTAATAALAGRSGGPHWDWDVTRAGRPGLGAGLRLP RLLSPPLRPRLLLLLLLLSPPLLLLLLPCEAEAAAAAAAVSGSAAAEAKE CDRPCVNGGRCNPGTGQCVCPAGWVGEQCQHCGGRFRLTGSSGFVTDGPG NYKYKTKCTWLIEGQPNRIMRLRFNHFATECSWDHLYVYDGDSIYAPLVA AFSGLIVPERDGNETVPEVVATSGYALLHFFSDAAYNLTGFNITYSFDMC PNNCSGRGECKISNSSDTVECECSENWKGEACDIPHCTDNCGFPHRGICN SSDVRGCSCFSDWQGPGCSVPVPANQSFWTREEYSNLKLPRASHKAVVNG NIMWVVGGYMFNHSDYNMVLAYDLASREWLPLNRSVNNVVVRYGHSLALY KDKIYMYGGKIDSTGNVTNELRVFHIHNESWVLLTPKAKEQYAVVGHSAH IVTLKNGRVVMLVIFGHCPLYGYISNVQEYDLDKNTWSILHTQGALVQGG YGHSSVYDHRTRALYVHGGYKAFSANKYRLADDLYRYDVDTQMWTILKDS RFFRYLHTAVIVSGTMLVFGGNTHNDTSMSHGAKCFSSDFMAYDIACDRW SVLPRPDLHHDVNRFGHSAVLHNSTMYVFGGFNSLLLSDILVFTSEQCDA HRSEAACLAAGPGIRCVWNTGSSQCISWALATDEQEEKLKSECFSKRTLD HDRCDQHTDCYSCTANTNDCHWCNDHCVPRNHSCSEGQISIFRYENCPKD NPMYYCNKKTSCRSCALDQNCQWEPRNQECIALPENICGIGWHLVGNSCL KITTAKENYDNAKLFCRNHNALLASLTTQKKVEFVLKQLRIMQSSQSMSK LTLTPWVGLRKINVSYWCWEDMSPFTNSLLQWMPSEPSDAGFCGILSEPS TRGLKAATCINPLNGSVCERPANHSAKQCRTPCALRTACGDCTSGSSECM WCSNMKQCVDSNAYVASFPFGQCMEWYTMSTCPPENCSGYCTCSHCLEQP GCGWCTDPSNTGKGKCIEGSYKGPVKMPSQAPTGNFYPQPLLNSSMCLED SRYNWSFIHCPACQCNGHSKCINQSICEKCENLTTGKHCETCISGFYGDP TNGGKCQPCKCNGHASLCNTNTGKCFCTTKGVKGDECQLCEVENRYQGNP LRGTCYYTLLIDYQFTFSLSQEDDRYYTAINFVATPDEQNRDLDMFINAS KNFNLNITWAASFSAGTQAGEEMPVVSKTNIKEYKDSFSNEKFDFRNHPN ITFFVYVSNFTWPIKIQIAFSQHSNFMDLVQFFVTFFSCFLSLLLVAAVV WKIKQSCWASRRREQLLREMQQMASRPFASVNVALETDEEPPDLIGGSIK TVPKPIALEPCFGNKAAVLSVFVRLPRGLGGIPPPGQSGLAVASALVDIS QQMPIVYKEKSGAVRNRKQQPPAQPGTCI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do receptoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak zapalna vidpovid alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z lektinami Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani Takozh sekretovanij nazovni Literaturared The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Duke Cohan J S Morimoto C Rocker J A Schlossman S F 1995 A novel form of dipeptidylpeptidase IV found in human serum Isolation characterization and comparison with T lymphocyte membrane dipeptidylpeptidase IV CD26 J Biol Chem 270 14107 14114 PMID 7539799 DOI 10 1074 jbc 270 23 14107 Bunkenborg J Pilch B J Podtelejnikov A V Wisniewski J R 2004 Screening for N glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry Proteomics 4 454 465 PMID 14760718 DOI 10 1002 pmic 200300556Primitkired Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 885 angl Procitovano 12 veresnya 2017 a href wiki D0 A8 D0 B0 D0 B1 D0 BB D0 BE D0 BD Cite web title Shablon Cite web cite web a Obslugovuvannya CS1 Storinki z parametrom url status ale bez parametra archive url posilannya UniProt O75882 angl Arhiv originalu za 30 serpnya 2017 Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhred Hromosoma 20 nbsp Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Otrimano z https uk wikipedia org w index php title ATRN amp oldid 43411038