ATG5 (англ. Autophagy related 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 32 447.
ATG5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ATG5, APG5, APG5-LIKE, APG5L, ASP, hAPG5, autophagy related 5, SCAR25 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604261 MGI: 1277186 HomoloGene: 3566 GeneCards: ATG5 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
ревматоїдний артрит, spinocerebellar ataxia, autosomal recessive 25 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 106.05 – 106.33 Mb | Хр. 10: 44.14 – 44.24 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTDDKDVLRD | VWFGRIPTCF | TLYQDEITER | EAEPYYLLLP | RVSYLTLVTD | ||||
KVKKHFQKVM | RQEDISEIWF | EYEGTPLKWH | YPIGLLFDLL | ASSSALPWNI | ||||
TVHFKSFPEK | DLLHCPSKDA | IEAHFMSCMK | EADALKHKSQ | VINEMQKKDH | ||||
KQLWMGLQND | RFDQFWAINR | KLMEYPAEEN | GFRYIPFRIY | QTTTERPFIQ | ||||
KLFRPVAADG | QLHTLGDLLK | EVCPSAIDPE | DGEKKNQVMI | HGIEPMLETP | ||||
LQWLSEHLSY | PDNFLHISII | PQPTD |
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Mizushima N., Sugita H., Yoshimori T., Ohsumi Y. (1998). A new protein conjugation system in human. The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy. J. Biol. Chem. 273: 33889—33892. PMID 9852036 DOI:10.1074/jbc.273.51.33889
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Ueno T., Kominami E. (2001). The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein-activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3. J. Biol. Chem. 276: 1701—1706. PMID 11096062 DOI:10.1074/jbc.C000752200
- Tanida I., Nishitani T., Nemoto T., Ueno T., Kominami E. (2002). Mammalian Apg12p, but not the Apg12p.Apg5p conjugate, facilitates LC3 processing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1164—1170. PMID 12207896 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02057-0
- Tanida I., Tanida-Miyake E., Komatsu M., Ueno T., Kominami E. (2002). Human Apg3p/Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates, GATE-16, GABARAP, and MAP-LC3, and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p. J. Biol. Chem. 277: 13739—13744. PMID 11825910 DOI:10.1074/jbc.M200385200
- Shao Y., Gao Z., Feldman T., Jiang X. (2007). Stimulation of ATG12-ATG5 conjugation by ribonucleic acid. Autophagy. 3: 10—16. PMID 16963840 DOI:10.4161/auto.3270
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з ATG5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:589 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ATG5 angl Autophagy related 5 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 275 aminokislot a molekulyarna masa 32 447 ATG5Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4GDK 4GDL 4NAW 4TQ0 4TQ1 5D7GIdentifikatoriSimvoliATG5 APG5 APG5 LIKE APG5L ASP hAPG5 autophagy related 5 SCAR25Zovnishni ID OMIM 604261 MGI 1277186 HomoloGene 3566 GeneCards ATG5Pov yazani genetichni zahvoryuvannyarevmatoyidnij artrit spinocerebellar ataxia autosomal recessive 25 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya Atg8 ligase activity GO 0001948 GO 0016582 protein bindingKlitinna komponenta citoplazma phagophore assembly site membrane gialoplazma phagocytic vesicle membrane membrana Atg12 Atg5 Atg16 complex autophagosome GO 0035085 Aksonema mitochondria associated endoplasmic reticulum membraneBiologichnij proces proces imunnoyi sistemi negative regulation of cell death C terminal protein lipidation autophagy of nucleus cellular response to nitrogen starvation GO 0097285 apoptoz autophagosome assembly autophagy of mitochondrion blood vessel remodeling cellular response to starvation response to fungus macroautophagy cellular homeostasis antigen processing and presentation of endogenous antigen negative regulation of protein ubiquitination aggrephagy negative stranded viral RNA replication vazodilataciya negative regulation of apoptotic process posttranslyacijna modifikaciya negative thymic T cell selection otolith development negative regulation of phagocytosis regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol ventricular cardiac muscle cell development heart contraction protein lipidation involved in autophagosome assembly positive regulation of mucus secretion cellular response to nitrosative stress regulation of cilium assembly GO 1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process negative regulation of reactive oxygen species metabolic process negative regulation of histone H4 K16 acetylation avtofagiyaDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez9474 11793Ensembl ENSG00000057663 ENSMUSG00000038160UniProt Q9H1Y0 Q99J83RefSeq mRNK NM 001286106 NM 001286107 NM 001286108 NM 001286111 NM 004849NM 053069 NM 001314013 NM 001358596RefSeq bilok NP 001273035 NP 001273036 NP 001273037 NP 001273040 NP 004840NP 001300942 NP 444299 NP 001345525Lokus UCSC Hr 6 106 05 106 33 MbHr 10 44 14 44 24 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTD KVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNI TVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDH KQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQ KLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETP LQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak apoptoz imunitet vrodzhenij imunitet avtofagiya acetilyuvannya alternativnij splajsing Lokalizovanij u citoplazmi membrani LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Mizushima N Sugita H Yoshimori T Ohsumi Y 1998 A new protein conjugation system in human The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy J Biol Chem 273 33889 33892 PMID 9852036 DOI 10 1074 jbc 273 51 33889 Tanida I Tanida Miyake E Ueno T Kominami E 2001 The human homolog of Saccharomyces cerevisiae Apg7p is a Protein activating enzyme for multiple substrates including human Apg12p GATE 16 GABARAP and MAP LC3 J Biol Chem 276 1701 1706 PMID 11096062 DOI 10 1074 jbc C000752200 Tanida I Nishitani T Nemoto T Ueno T Kominami E 2002 Mammalian Apg12p but not the Apg12p Apg5p conjugate facilitates LC3 processing Biochem Biophys Res Commun 296 1164 1170 PMID 12207896 DOI 10 1016 S0006 291X 02 02057 0 Tanida I Tanida Miyake E Komatsu M Ueno T Kominami E 2002 Human Apg3p Aut1p homologue is an authentic E2 enzyme for multiple substrates GATE 16 GABARAP and MAP LC3 and facilitates the conjugation of hApg12p to hApg5p J Biol Chem 277 13739 13744 PMID 11825910 DOI 10 1074 jbc M200385200 Shao Y Gao Z Feldman T Jiang X 2007 Stimulation of ATG12 ATG5 conjugation by ribonucleic acid Autophagy 3 10 16 PMID 16963840 DOI 10 4161 auto 3270PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z ATG5 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 589 angl Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 3 lyutogo 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi