ATF6 (англ. Activating transcription factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 670 амінокислот, а молекулярна маса — 74 585.
ATF6 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ATF6, ATF6A, ACHM7, activating transcription factor 6 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605537 MGI: 1926157 HomoloGene: 32015 GeneCards: ATF6 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
хвороба Паркінсона, achromatopsia 7, achromatopsia | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 161.77 – 161.98 Mb | Хр. 1: 170.53 – 170.7 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGEPAGVAGT | MESPFSPGLF | HRLDEDWDSA | LFAELGYFTD | TDELQLEAAN | ||||
ETYENNFDNL | DFDLDLMPWE | SDIWDINNQI | CTVKDIKAEP | QPLSPASSSY | ||||
SVSSPRSVDS | YSSTQHVPEE | LDLSSSSQMS | PLSLYGENSN | SLSSAEPLKE | ||||
DKPVTGPRNK | TENGLTPKKK | IQVNSKPSIQ | PKPLLLPAAP | KTQTNSSVPA | ||||
KTIIIQTVPT | LMPLAKQQPI | ISLQPAPTKG | QTVLLSQPTV | VQLQAPGVLP | ||||
SAQPVLAVAG | GVTQLPNHVV | NVVPAPSANS | PVNGKLSVTK | PVLQSTMRNV | ||||
GSDIAVLRRQ | QRMIKNRESA | CQSRKKKKEY | MLGLEARLKA | ALSENEQLKK | ||||
ENGTLKRQLD | EVVSENQRLK | VPSPKRRVVC | VMIVLAFIIL | NYGPMSMLEQ | ||||
DSRRMNPSVS | PANQRRHLLG | FSAKEAQDTS | DGIIQKNSYR | YDHSVSNDKA | ||||
LMVLTEEPLL | YIPPPPCQPL | INTTESLRLN | HELRGWVHRH | EVERTKSRRM | ||||
TNNQQKTRIL | QGALEQGSNS | QLMAVQYTET | TSSISRNSGS | ELQVYYASPR | ||||
SYQDFFEAIR | RRGDTFYVVS | FRRDHLLLPA | TTHNKTTRPK | MSIVLPAINI | ||||
NENVINGQDY | EVMMQIDCQV | MDTRILHIKS | SSVPPYLRDQ | QRNQTNTFFG | ||||
SPPAATEATH | VVSTIPESLQ |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, відповідь на порушення конформації білку, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Zhu C., Johansen F.E., Prywes R. (1997). Interaction of ATF6 and serum response factor. Mol. Cell. Biol. 17: 4957—4966. PMID 9271374 DOI:10.1128/MCB.17.9.4957
- Yoshida H., Haze K., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1998). Identification of the cis-acting endoplasmic reticulum stress response element responsible for transcriptional induction of mammalian glucose-regulated proteins; involvement of basic-leucine zipper transcription factors. J. Biol. Chem. 273: 33741—33749. PMID 9837962 DOI:10.1074/jbc.273.50.33741
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
- Haze K., Yoshida H., Yanagi H., Yura T., Mori K. (1999). Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol. Biol. Cell. 10: 3787—3799. PMID 10564271 DOI:10.1091/mbc.10.11.3787
- Yoshida H., Matsui T., Yamamoto A., Okada T., Mori K. (2001). XBP1 mRNA is induced by ATF6 and spliced by IRE1 in response to ER stress to produce a highly active transcription factor. Cell. 107: 881—891. PMID 11779464 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00611-0
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з ATF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 4 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ATF6 angl Activating transcription factor 6 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 670 aminokislot a molekulyarna masa 74 585 ATF6IdentifikatoriSimvoliATF6 ATF6A ACHM7 activating transcription factor 6Zovnishni ID OMIM 605537 MGI 1926157 HomoloGene 32015 GeneCards ATF6Pov yazani genetichni zahvoryuvannyahvoroba Parkinsona achromatopsia 7 achromatopsia Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0001105 transcription coactivator activity GO 0000975 transcription cis regulatory region binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein binding protein heterodimerization activity ubiquitin protein ligase binding cAMP response element binding GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific sequence specific DNA binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta integral component of membrane kompleks Goldzhi nuclear envelope membrana endoplasmic reticulum membrane Golgi membrane nukleoplazma integral component of endoplasmic reticulum membrane endoplazmatichnij retikulum klitinne yadro gialoplazmaBiologichnij proces rozvitok oka GO 0009373 regulation of transcription DNA templated positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II transcription DNA templated Vidpovid na nezgornuti bilki ATF6 mediated unfolded protein response response to unfolded protein zgortannya bilkiv GO 0072468 signalna transdukciya zir positive regulation of apoptotic process transcription by RNA polymerase II GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of ATF6 mediated unfolded protein responseDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez22926 226641Ensembl ENSG00000118217 ENSMUSG00000026663UniProt P18850 F6VAN0RefSeq mRNK NM 007348NM 001081304RefSeq bilok NP 031374NP 001074773Lokus UCSC Hr 1 161 77 161 98 MbHr 1 170 53 170 7 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAAN ETYENNFDNLDFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSY SVSSPRSVDSYSSTQHVPEELDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKE DKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQPKPLLLPAAPKTQTNSSVPA KTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTVVQLQAPGVLP SAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKK ENGTLKRQLDEVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQ DSRRMNPSVSPANQRRHLLGFSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKA LMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRM TNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPR SYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFG SPPAATEATHVVSTIPESLQ A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi vidpovid na porushennya konformaciyi bilku polimorfizm Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u yadri membrani endoplazmatichnomu retikulumi LiteraturaZhu C Johansen F E Prywes R 1997 Interaction of ATF6 and serum response factor Mol Cell Biol 17 4957 4966 PMID 9271374 DOI 10 1128 MCB 17 9 4957 Yoshida H Haze K Yanagi H Yura T Mori K 1998 Identification of the cis acting endoplasmic reticulum stress response element responsible for transcriptional induction of mammalian glucose regulated proteins involvement of basic leucine zipper transcription factors J Biol Chem 273 33741 33749 PMID 9837962 DOI 10 1074 jbc 273 50 33741 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Hai T Liu F Coukos W J Green M R 1989 Transcription factor ATF cDNA clones an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA binding heterodimers Genes Dev 3 2083 2090 PMID 2516827 DOI 10 1101 gad 3 12b 2083 Haze K Yoshida H Yanagi H Yura T Mori K 1999 Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress Mol Biol Cell 10 3787 3799 PMID 10564271 DOI 10 1091 mbc 10 11 3787 Yoshida H Matsui T Yamamoto A Okada T Mori K 2001 XBP1 mRNA is induced by ATF6 and spliced by IRE1 in response to ER stress to produce a highly active transcription factor Cell 107 881 891 PMID 11779464 DOI 10 1016 S0092 8674 01 00611 0PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z ATF6 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 18 chervnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 4 lipnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi