ARNTL (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 68 762.
ARNTL | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ARNTL, BMAL1, BMAL1c, JAP3, MOP3, PASD3, TIC, bHLHe5, aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 602550 MGI: 1096381 HomoloGene: 910 GeneCards: ARNTL | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
шизофренія | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 7: 112.81 – 112.91 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MADQRMDISS | TISDFMSPGP | TDLLSSSLGT | SGVDCNRKRK | GSSTDYQESM | ||||
DTDKDDPHGR | LEYTEHQGRI | KNAREAHSQI | EKRRRDKMNS | FIDELASLVP | ||||
TCNAMSRKLD | KLTVLRMAVQ | HMKTLRGATN | PYTEANYKPT | FLSDDELKHL | ||||
ILRAADGFLF | VVGCDRGKIL | FVSESVFKIL | NYSQNDLIGQ | SLFDYLHPKD | ||||
IAKVKEQLSS | SDTAPRERLI | DAKTGLPVKT | DITPGPSRLC | SGARRSFFCR | ||||
MKCNRPSVKV | EDKDFPSTCS | KKKADRKSFC | TIHSTGYLKS | WPPTKMGLDE | ||||
DNEPDNEGCN | LSCLVAIGRL | HSHVVPQPVN | GEIRVKSMEY | VSRHAIDGKF | ||||
VFVDQRATAI | LAYLPQELLG | TSCYEYFHQD | DIGHLAECHR | QVLQTREKIT | ||||
TNCYKFKIKD | GSFITLRSRW | FSFMNPWTKE | VEYIVSTNTV | VLANVLEGGD | ||||
PTFPQLTASP | HSMDSMLPSG | EGGPKRTHPT | VPGIPGGTRA | GAGKIGRMIA | ||||
EEIMEIHRIR | GSSPSSCGSS | PLNITSTPPP | DASSPGGKKI | LNGGTPDIPS | ||||
SGLLSGQAQE | NPGYPYSDSS | SILGENPHIG | IDMIDNDQGS | SSPSNDEAAM | ||||
AVIMSLLEAD | AGLGGPVDFS | DLPWPL |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Ikeda M., Nomura M. (1997). cDNA cloning and tissue-specific expression of a novel basic helix-loop-helix/PAS protein (BMAL1) and identification of alternatively spliced variants with alternative translation initiation site usage. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 258—264. PMID 9144434 DOI:10.1006/bbrc.1997.6371
- Hogenesch J.B., Gu Y.Z., Jain S., Bradfield C.A. (1998). The basic-helix-loop-helix-PAS orphan MOP3 forms transcriptionally active complexes with circadian and hypoxia factors. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 5474—5479. PMID 9576906 DOI:10.1073/pnas.95.10.5474
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rutter J., Reick M., Wu L.C., McKnight S.L. (2001). Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors. Science. 293: 510—514. PMID 11441146 DOI:10.1126/science.1060698
- Richards J., Gumz M.L. (2013). Mechanism of the circadian clock in physiology. Am. J. Physiol. 304: R1053—R1064. PMID 23576606 DOI:10.1152/ajpregu.00066.2013
- Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з ARNTL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:701 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ARNTL angl Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator like bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 626 aminokislot a molekulyarna masa 68 762 ARNTLNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4H10IdentifikatoriSimvoliARNTL BMAL1 BMAL1c JAP3 MOP3 PASD3 TIC bHLHe5 aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator likeZovnishni ID OMIM 602550 MGI 1096381 HomoloGene 910 GeneCards ARNTLPov yazani genetichni zahvoryuvannyashizofreniya Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding Hsp90 protein binding protein dimerization activity GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity aryl hydrocarbon receptor binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding GO 0000975 transcription cis regulatory region binding transcription factor activity RNA polymerase II core promoter proximal region sequence specific binding core promoter sequence specific DNA binding bHLH transcription factor binding sequence specific DNA binding protein heterodimerization activity E box binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specific GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta citoplazma PML body vnutrishnoklitinna membranna organela transcription regulator complex nukleoplazma klitinne yadro yaderni tilcya chromatoid bodyBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated ritmichnij proces transcription DNA templated regulation of hair cycle transcription by RNA polymerase II Spermatogenez cirkadnij ritm negative regulation of TOR signaling circadian regulation of gene expression GO 1903362 regulation of protein catabolic process positive regulation of circadian rhythm proteasome mediated ubiquitin dependent protein catabolic process negative regulation of fat cell differentiation GO 0045996 negative regulation of transcription DNA templated GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of neurogenesis regulation of insulin secretion regulation of cell cycle response to redox state maternal process involved in parturition positive regulation of canonical Wnt signaling pathway oxidative stress induced premature senescence regulation of type B pancreatic cell development negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway regulation of cellular senescence positive regulation of skeletal muscle cell differentiation positive regulation of protein acetylation negative regulation of cold induced thermogenesis protein import into nucleusDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez406 11865Ensembl ENSG00000133794 ENSMUSG00000055116UniProt O00327 Q9WTL8RefSeq mRNK NM 001030272 NM 001030273 NM 001178 NM 001297719 NM 001297722NM 001297724NM 001243048 NM 007489 NM 001357070 NM 001368412 NM 001374642RefSeq bilok NP 001025443 NP 001025444 NP 001169 NP 001284648 NP 001284651NP 001284653 NP 001338733 NP 001338734 NP 001338735 NP 001338736 NP 001338737 NP 001338738 NP 001338739 NP 001338740 NP 001338741 NP 001338742 NP 001338743 NP 001338744 NP 001338745 NP 001338746 NP 001338747 NP 001338748 NP 001338749 NP 001338750 NP 001338751 NP 001338752 NP 001338753NP 001229977 NP 031515 NP 001343999 NP 001355341 NP 001361571Lokus UCSC n dHr 7 112 81 112 91 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESM DTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVP TCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHL ILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKD IAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCR MKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDE DNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKF VFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKIT TNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGD PTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIA EEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPS SGLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAM AVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi biologichni ritmi acetilyuvannya alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaIkeda M Nomura M 1997 cDNA cloning and tissue specific expression of a novel basic helix loop helix PAS protein BMAL1 and identification of alternatively spliced variants with alternative translation initiation site usage Biochem Biophys Res Commun 233 258 264 PMID 9144434 DOI 10 1006 bbrc 1997 6371 Hogenesch J B Gu Y Z Jain S Bradfield C A 1998 The basic helix loop helix PAS orphan MOP3 forms transcriptionally active complexes with circadian and hypoxia factors Proc Natl Acad Sci U S A 95 5474 5479 PMID 9576906 DOI 10 1073 pnas 95 10 5474 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Rutter J Reick M Wu L C McKnight S L 2001 Regulation of clock and NPAS2 DNA binding by the redox state of NAD cofactors Science 293 510 514 PMID 11441146 DOI 10 1126 science 1060698 Richards J Gumz M L 2013 Mechanism of the circadian clock in physiology Am J Physiol 304 R1053 R1064 PMID 23576606 DOI 10 1152 ajpregu 00066 2013 Eckel Mahan K Sassone Corsi P 2013 Metabolism and the circadian clock converge Physiol Rev 93 107 135 PMID 23303907 DOI 10 1152 physrev 00016 2012PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z ARNTL pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 701 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 13 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 11 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi