APOBEC2 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 25 703.
APOBEC2 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | APOBEC2, ARCD1, ARP1, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604797 MGI: 1343178 HomoloGene: 4941 GeneCards: APOBEC2 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 41.05 – 41.06 Mb | Хр. 17: 48.73 – 48.74 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAQKEEAAVA | TEAASQNGED | LENLDDPEKL | KELIELPPFE | IVTGERLPAN | ||||
FFKFQFRNVE | YSSGRNKTFL | CYVVEAQGKG | GQVQASRGYL | EDEHAAAHAE | ||||
EAFFNTILPA | FDPALRYNVT | WYVSSSPCAA | CADRIIKTLS | KTKNLRLLIL | ||||
VGRLFMWEEP | EIQAALKKLK | EAGCKLRIMK | PQDFEYVWQN | FVEQEEGESK | ||||
AFQPWEDIQE | NFLYYEEKLA | DILK |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
- Prochnow C., Bransteitter R., Klein M.G., Goodman M.F., Chen X.S. (2007). The APOBEC-2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID. Nature. 445: 447—451. PMID 17187054 DOI:10.1038/nature05492
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 22 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
APOBEC2 angl Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 224 aminokislot a molekulyarna masa 25 703 APOBEC2Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2NYTIdentifikatoriSimvoliAPOBEC2 ARCD1 ARP1 apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2Zovnishni ID OMIM 604797 MGI 1343178 HomoloGene 4941 GeneCards APOBEC2Ontologiya genaMolekulyarna funkciya hydrolase activity acting on carbon nitrogen but not peptide bonds in cyclic amidines zinc ion binding katalitichna aktivnist hydrolase activity zv yazuvannya z ionom metalu RNA binding cytidine deaminase activity identical protein bindingKlitinna komponenta klitinne yadro citoplazmaBiologichnij proces DNA demethylation mRNA processing mRNA modification cytidine deamination cytidine to uridine editingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10930 11811Ensembl ENSG00000124701 ENSMUSG00000040694UniProt Q9Y235 Q9WV35RefSeq mRNK NM 006789NM 009694RefSeq bilok NP 006780NP 033824Lokus UCSC Hr 6 41 05 41 06 MbHr 17 48 73 48 74 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAQKEEAAVATEAASQNGEDLENLDDPEKLKELIELPPFEIVTGERLPAN FFKFQFRNVEYSSGRNKTFLCYVVEAQGKGGQVQASRGYLEDEHAAAHAE EAFFNTILPAFDPALRYNVTWYVSSSPCAACADRIIKTLSKTKNLRLLIL VGRLFMWEEPEIQAALKKLKEAGCKLRIMKPQDFEYVWQNFVEQEEGESK AFQPWEDIQENFLYYEEKLADILK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak procesing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Guo J U Su Y Zhong C Ming G L Song H 2011 Hydroxylation of 5 methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain Cell 145 423 434 PMID 21496894 DOI 10 1016 j cell 2011 03 022 Prochnow C Bransteitter R Klein M G Goodman M F Chen X S 2007 The APOBEC 2 crystal structure and functional implications for the deaminase AID Nature 445 447 451 PMID 17187054 DOI 10 1038 nature05492PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 4 kvitnya 2016 Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 18 chervnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi