APEX1

APEX1 (англ. DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 263 амінокислот, а молекулярна маса — 29 190.

APEX1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BIX, 1CQH, 4LND, 4QH9, 5DFF, 4QHD, 1E9N, 3U8U, 5DFI, 1HD7, 5DG0, 5DFJ, 4QHE, 5DFH, 1DE9, 4IEM, 2ISI, 1DE8, 2O3H, 1CQG, 1DEW, 5CFG
Ідентифікатори
Символи	APEX1, APE, APE1, APEN, APEX, APX, HAP1, REF1, apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 1
Зовнішні ІД	OMIM: 107748 MGI: 88042 HomoloGene: 1241 GeneCards: APEX1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • lyase activity • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • exonuclease activity • phosphodiesterase I activity • double-stranded DNA 3'-5' exodeoxyribonuclease activity • endodeoxyribonuclease activity • chromatin DNA binding • endoribonuclease activity • uracil DNA N-glycosylase activity • phosphoric diester hydrolase activity • site-specific endodeoxyribonuclease activity, specific for altered base • double-stranded telomeric DNA binding • oxidoreductase activity • double-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • NF-kappaB binding • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity • damaged DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • 3'-5' exonuclease activity • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity • RNA binding • class III/IV DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity Клітинна компонента • цитоплазма • центросома • внутрішньоклітинний • мітохондрія • клітинне ядро • perinuclear region of cytoplasm • рибосома • transcription regulator complex • nuclear speck • нуклеоплазма • ядерце • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • GO:0100026 Репарація ДНК • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • cellular response to DNA damage stimulus • DNA recombination • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • negative regulation of smooth muscle cell migration • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • DNA demethylation • cellular response to cAMP • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • transcription, DNA-templated • response to organonitrogen compound • cellular response to hydrogen peroxide • cellular response to peptide hormone stimulus • regulation of mRNA stability • cellular response to organonitrogen compound • cell redox homeostasis • GO:0010260 старіння людини • base-excision repair • telomere maintenance • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • telomere maintenance via base-excision repair • regulation of apoptotic process • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	328	11792
Ensembl	ENSG00000100823	ENSMUSG00000035960
UniProt	P27695	P28352
RefSeq (мРНК)	NM_001244249 NM_001641 NM_080648 NM_080649	NM_009687
RefSeq (білок)	NP_001231178 NP_001632 NP_542379 NP_542380	NP_033817
Локус (UCSC)	Хр. 14: 20.46 – 20.46 Mb	Хр. 14: 51.16 – 51.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKRGKKGAV		AEDGDELRTE		PEAKKSKTAA		KKNDKEAAGE		GPALYEDPPD
QKTSPSGKPA		TLKICSWNVD		GLRAWIKKKG		LDWVKEEAPD		ILCLQETKCS
ENKLPAELQE		LPGLSHQYWS		APSDKEGYSG		VGLLSRQCPL		KVSYGIGDEE
HDQEGRVIVA		EFDSFVLVTA		YVPNAGRGLV		RLEYRQRWDE		AFRKFLKGLA
SRKPLVLCGD		LNVAHEEIDL		RNPKGNKKNA		GFTPQERQGF		GELLQAVPLA
DSFRHLYPNT		PYA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії.

Література

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:587 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.
4. UniProt, G3V3M6 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 14