AICDA (англ. Activation induced cytidine deaminase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 23 954.
AICDA | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | AICDA, AID, ARP2, CDA2, HEL-S-284, HIGM2, activation-induced cytidine deaminase, activation induced cytidine deaminase | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605257 MGI: 1342279 HomoloGene: 7623 GeneCards: AICDA | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
hyper-IgM syndrome type 2 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 8.6 – 8.61 Mb | Хр. 6: 122.53 – 122.54 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDSLLMNRRK | FLYQFKNVRW | AKGRRETYLC | YVVKRRDSAT | SFSLDFGYLR | ||||
NKNGCHVELL | FLRYISDWDL | DPGRCYRVTW | FTSWSPCYDC | ARHVADFLRG | ||||
NPNLSLRIFT | ARLYFCEDRK | AEPEGLRRLH | RAGVQIAIMT | FKDYFYCWNT | ||||
FVENHERTFK | AWEGLHENSV | RLSRQLRRIL | LPLYEVDDLR | DAFRTLGL |
Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Muto T., Muramatsu M., Taniwaki M., Kinoshita K., Honjo T. (2000). Isolation, tissue distribution, and chromosomal localization of the human activation-induced cytidine deaminase (hAID) gene. Genomics. 68: 85—88. PMID 10950930 DOI:10.1006/geno.2000.6268
- Martin A., Scharff M.D. (2002). Somatic hypermutation of the AID transgene in B and non-B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 12304—12308. PMID 12202747 DOI:10.1073/pnas.192442899
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Pasqualucci L., Kitaura Y., Gu H., Dalla-Favera R. (2006). PKA-mediated phosphorylation regulates the function of activation-induced deaminase (AID) in B cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 395—400. PMID 16387847 DOI:10.1073/pnas.0509969103
- Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
- Demorest Z.L., Li M., Harris R.S. (2011). Phosphorylation directly regulates the intrinsic DNA cytidine deaminase activity of activation-induced deaminase and APOBEC3G protein. J. Biol. Chem. 286: 26568—26575. PMID 21659520 DOI:10.1074/jbc.M111.235721
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з AICDA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 21 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 8 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
AICDA angl Activation induced cytidine deaminase bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 198 aminokislot a molekulyarna masa 23 954 AICDANayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB5JJ4IdentifikatoriSimvoliAICDA AID ARP2 CDA2 HEL S 284 HIGM2 activation induced cytidine deaminase activation induced cytidine deaminaseZovnishni ID OMIM 605257 MGI 1342279 HomoloGene 7623 GeneCards AICDAPov yazani genetichni zahvoryuvannyahyper IgM syndrome type 2 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya hydrolase activity acting on carbon nitrogen but not peptide bonds in cyclic amidines zinc ion binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding katalitichna aktivnist hydrolase activity ubiquitin protein ligase binding zv yazuvannya z ionom metalu cytidine deaminase activity identical protein binding RNA bindingKlitinna komponenta Ekzosoma klitinne yadro citoplazma P body GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces somatic hypermutation of immunoglobulin genes DNA demethylation mRNA processing B cell differentiation somatic diversification of immunoglobulins negative regulation of DNA methylation dependent heterochromatin assembly cytidine deamination cellular response to lipopolysaccharide Peremikannya klasu imunoglobuliniv defense response to bacterium regulation of DNA stability negative regulation of transposition cytidine to uridine editing regulation of nuclear cell cycle DNA replication negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate defense response to virus DNA cytosine deaminationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez57379 11628Ensembl ENSG00000111732 ENSMUSG00000040627UniProt Q9GZX7 Q9WVE0RefSeq mRNK NM 020661 NM 001330343NM 009645RefSeq bilok NP 001317272 NP 065712NP 033775Lokus UCSC Hr 12 8 6 8 61 MbHr 6 122 53 122 54 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDSLLMNRRKFLYQFKNVRWAKGRRETYLCYVVKRRDSATSFSLDFGYLR NKNGCHVELLFLRYISDWDLDPGRCYRVTWFTSWSPCYDCARHVADFLRG NPNLSLRIFTARLYFCEDRKAEPEGLRRLHRAGVQIAIMTFKDYFYCWNT FVENHERTFKAWEGLHENSVRLSRQLRRILLPLYEVDDLRDAFRTLGL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do gidrolaz Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak procesing mRNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaMuto T Muramatsu M Taniwaki M Kinoshita K Honjo T 2000 Isolation tissue distribution and chromosomal localization of the human activation induced cytidine deaminase hAID gene Genomics 68 85 88 PMID 10950930 DOI 10 1006 geno 2000 6268 Martin A Scharff M D 2002 Somatic hypermutation of the AID transgene in B and non B cells Proc Natl Acad Sci U S A 99 12304 12308 PMID 12202747 DOI 10 1073 pnas 192442899 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Pasqualucci L Kitaura Y Gu H Dalla Favera R 2006 PKA mediated phosphorylation regulates the function of activation induced deaminase AID in B cells Proc Natl Acad Sci U S A 103 395 400 PMID 16387847 DOI 10 1073 pnas 0509969103 Guo J U Su Y Zhong C Ming G L Song H 2011 Hydroxylation of 5 methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain Cell 145 423 434 PMID 21496894 DOI 10 1016 j cell 2011 03 022 Demorest Z L Li M Harris R S 2011 Phosphorylation directly regulates the intrinsic DNA cytidine deaminase activity of activation induced deaminase and APOBEC3G protein J Biol Chem 286 26568 26575 PMID 21659520 DOI 10 1074 jbc M111 235721PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z AICDA pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 4 kvitnya 2016 Procitovano 21 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 zhovtnya 2017 Procitovano 21 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi