AGO1 (англ. Argonaute 1, RISC catalytic component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 857 амінокислот, а молекулярна маса — 97 214.
AGO1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | AGO1, EIF2C, EIF2C1, GERP95, Q99, hAgo1, argonaute 1, RISC catalytic component, argonaute RISC catalytic component 1, argonaute RISC component 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606228 MGI: 2446630 HomoloGene: 81826 GeneCards: AGO1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 35.87 – 35.93 Mb | Хр. 4: 126.33 – 126.36 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEAGPSGAAA | GAYLPPLQQV | FQAPRRPGIG | TVGKPIKLLA | NYFEVDIPKI | ||||
DVYHYEVDIK | PDKCPRRVNR | EVVEYMVQHF | KPQIFGDRKP | VYDGKKNIYT | ||||
VTALPIGNER | VDFEVTIPGE | GKDRIFKVSI | KWLAIVSWRM | LHEALVSGQI | ||||
PVPLESVQAL | DVAMRHLASM | RYTPVGRSFF | SPPEGYYHPL | GGGREVWFGF | ||||
HQSVRPAMWK | MMLNIDVSAT | AFYKAQPVIE | FMCEVLDIRN | IDEQPKPLTD | ||||
SQRVRFTKEI | KGLKVEVTHC | GQMKRKYRVC | NVTRRPASHQ | TFPLQLESGQ | ||||
TVECTVAQYF | KQKYNLQLKY | PHLPCLQVGQ | EQKHTYLPLE | VCNIVAGQRC | ||||
IKKLTDNQTS | TMIKATARSA | PDRQEEISRL | MKNASYNLDP | YIQEFGIKVK | ||||
DDMTEVTGRV | LPAPILQYGG | RNRAIATPNQ | GVWDMRGKQF | YNGIEIKVWA | ||||
IACFAPQKQC | REEVLKNFTD | QLRKISKDAG | MPIQGQPCFC | KYAQGADSVE | ||||
PMFRHLKNTY | SGLQLIIVIL | PGKTPVYAEV | KRVGDTLLGM | ATQCVQVKNV | ||||
VKTSPQTLSN | LCLKINVKLG | GINNILVPHQ | RSAVFQQPVI | FLGADVTHPP | ||||
AGDGKKPSIT | AVVGSMDAHP | SRYCATVRVQ | RPRQEIIEDL | SYMVRELLIQ | ||||
FYKSTRFKPT | RIIFYRDGVP | EGQLPQILHY | ELLAIRDACI | KLEKDYQPGI | ||||
TYIVVQKRHH | TRLFCADKNE | RIGKSGNIPA | GTTVDTNITH | PFEFDFYLCS | ||||
HAGIQGTSRP | SHYYVLWDDN | RFTADELQIL | TYQLCHTYVR | CTRSVSIPAP | ||||
AYYARLVAFR | ARYHLVDKEH | DSGEGSHISG | QSNGRDPQAL | AKAVQVHQDT | ||||
LRTMYFA |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chu C.-Y., Rana T.M. (2006). Translation repression in human cells by microRNA-induced gene silencing requires RCK/p54. PLoS Biol. 4: E210—E210. PMID 16756390 DOI:10.1371/journal.pbio.0040210
- Wu L., Fan J., Belasco J.G. (2008). Importance of translation and nonnucleolytic ago proteins for on-target RNA interference. Curr. Biol. 18: 1327—1332. PMID 18771919 DOI:10.1016/j.cub.2008.07.072
- Phalora P.K., Sherer N.M., Wolinsky S.M., Swanson C.M., Malim M.H. (2012). HIV-1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies. J. Virol. 86: 11712—11724. PMID 22915799 DOI:10.1128/JVI.00595-12
- Ma J.-B., Ye K., Patel D.J. (2004). Structural basis for overhang-specific small interfering RNA recognition by the PAZ domain. Nature. 429: 318—322. PMID 15152257 DOI:10.1038/nature02519
- Faehnle C.R., Elkayam E., Haase A.D., Hannon G.J., Joshua-Tor L. (2013). The making of a slicer: activation of human Argonaute-1. Cell Rep. 3: 1901—1909. PMID 23746446 DOI:10.1016/j.celrep.2013.05.033
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
AGO1 angl Argonaute 1 RISC catalytic component bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 857 aminokislot a molekulyarna masa 97 214 AGO1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1SI2 1SI3 4KRE 4KRF 4KXTIdentifikatoriSimvoliAGO1 EIF2C EIF2C1 GERP95 Q99 hAgo1 argonaute 1 RISC catalytic component argonaute RISC catalytic component 1 argonaute RISC component 1Zovnishni ID OMIM 606228 MGI 2446630 HomoloGene 81826 GeneCards AGO1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya RNA polymerase II complex binding miRNA binding endoribonuclease activity GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding single stranded RNA binding RNA binding nucleic acid binding double stranded RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma Polisoma gialoplazma RISC P body nukleoplazma RISC loading complex klitinne yadro RibonukleoproteyiniBiologichnij proces mRNA destabilization mediated gene silencing by siRNA GO 0009373 regulation of transcription DNA templated transcription DNA templated pre miRNA processing nuclear transcribed mRNA catabolic process GO 1901313 positive regulation of gene expression GO 0035194 RNK interferenciya miRNA mediated gene silencing by inhibition of translation RNA secondary structure unwinding mRNA destabilization mediated gene silencing by miRNA GO 0061715 miRNA metabolic process regulation of translation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA positive regulation of NIK NF kappaB signaling Wnt signaling pathway calcium modulating pathway Sajlensing geniv GO 1905616 regulation of gene silencing by miRNA regulation of megakaryocyte differentiation negative regulation of gene expression negative regulation of angiogenesis RNA phosphodiester bond hydrolysis endonucleolyticDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez26523 236511Ensembl ENSG00000092847 ENSMUSG00000041530UniProt Q9UL18 Q8CJG1RefSeq mRNK NM 012199 NM 001317122 NM 001317123NM 153403 NM 001317173 NM 001317174 NM 001378879RefSeq bilok NP 001304051 NP 001304052 NP 036331NP 001304102 NP 001304103 NP 700452 NP 001365808Lokus UCSC Hr 1 35 87 35 93 MbHr 4 126 33 126 36 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MEAGPSGAAAGAYLPPLQQVFQAPRRPGIGTVGKPIKLLANYFEVDIPKI DVYHYEVDIKPDKCPRRVNREVVEYMVQHFKPQIFGDRKPVYDGKKNIYT VTALPIGNERVDFEVTIPGEGKDRIFKVSIKWLAIVSWRMLHEALVSGQI PVPLESVQALDVAMRHLASMRYTPVGRSFFSPPEGYYHPLGGGREVWFGF HQSVRPAMWKMMLNIDVSATAFYKAQPVIEFMCEVLDIRNIDEQPKPLTD SQRVRFTKEIKGLKVEVTHCGQMKRKYRVCNVTRRPASHQTFPLQLESGQ TVECTVAQYFKQKYNLQLKYPHLPCLQVGQEQKHTYLPLEVCNIVAGQRC IKKLTDNQTSTMIKATARSAPDRQEEISRLMKNASYNLDPYIQEFGIKVK DDMTEVTGRVLPAPILQYGGRNRAIATPNQGVWDMRGKQFYNGIEIKVWA IACFAPQKQCREEVLKNFTDQLRKISKDAGMPIQGQPCFCKYAQGADSVE PMFRHLKNTYSGLQLIIVILPGKTPVYAEVKRVGDTLLGMATQCVQVKNV VKTSPQTLSNLCLKINVKLGGINNILVPHQRSAVFQQPVIFLGADVTHPP AGDGKKPSITAVVGSMDAHPSRYCATVRVQRPRQEIIEDLSYMVRELLIQ FYKSTRFKPTRIIFYRDGVPEGQLPQILHYELLAIRDACIKLEKDYQPGI TYIVVQKRHHTRLFCADKNERIGKSGNIPAGTTVDTNITHPFEFDFYLCS HAGIQGTSRPSHYYVLWDDNRFTADELQILTYQLCHTYVRCTRSVSIPAP AYYARLVAFRARYHLVDKEHDSGEGSHISGQSNGRDPQALAKAVQVHQDT LRTMYFA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv ribonukleoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak regulyaciya translyaciyi transkripciya regulyaciya transkripciyi RNK zalezhne zaglushennya geniv Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z RNK Lokalizovanij u citoplazmi LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Chu C Y Rana T M 2006 Translation repression in human cells by microRNA induced gene silencing requires RCK p54 PLoS Biol 4 E210 E210 PMID 16756390 DOI 10 1371 journal pbio 0040210 Wu L Fan J Belasco J G 2008 Importance of translation and nonnucleolytic ago proteins for on target RNA interference Curr Biol 18 1327 1332 PMID 18771919 DOI 10 1016 j cub 2008 07 072 Phalora P K Sherer N M Wolinsky S M Swanson C M Malim M H 2012 HIV 1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies J Virol 86 11712 11724 PMID 22915799 DOI 10 1128 JVI 00595 12 Ma J B Ye K Patel D J 2004 Structural basis for overhang specific small interfering RNA recognition by the PAZ domain Nature 429 318 322 PMID 15152257 DOI 10 1038 nature02519 Faehnle C R Elkayam E Haase A D Hannon G J Joshua Tor L 2013 The making of a slicer activation of human Argonaute 1 Cell Rep 3 1901 1909 PMID 23746446 DOI 10 1016 j celrep 2013 05 033PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2015 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 26 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi