AGMAT

AGMAT (англ. Agmatinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 37 660.

AGMAT
Ідентифікатори
Символи	AGMAT, Agmatinase
Зовнішні ІД	OMIM: 617887 MGI: 1923236 HomoloGene: 99855 GeneCards: AGMAT
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amidines • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • agmatinase activity Клітинна компонента • мітохондрія Біологічний процес • putrescine biosynthetic process • agmatine biosynthetic process • spermidine biosynthetic process • putrescine biosynthetic process from arginine Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79814	75986
Ensembl	ENSG00000116771	ENSMUSG00000040706
UniProt	Q9BSE5	A2AS89
RefSeq (мРНК)	NM_024758	NM_001081408 NM_001378862
RefSeq (білок)	NP_079034	NP_001074877 NP_001365791
Локус (UCSC)	Хр. 1: 15.57 – 15.59 Mb	Хр. 4: 141.47 – 141.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRLLASGCA		RGPGPGVGAR		PAAGLFHPGR		RQSRQASDAP		RNQPPSPEFV
ARPVGVCSMM		RLPVQTSPEG		LDAAFIGVPL		DTGTSNRPGA		RFGPRRIREE
SVMLGTVNPS		TGALPFQSLM		VADLGDVNVN		LYNLQDSCRR		IQEAYEKIVA
AGCIPLTLGG		DHTITYPILQ		AMAKKHGPVG		LLHVDAHTDT		TDKALGEKLY
HGAPFRRCVD		EGLLDCKRVV		QIGIRGSSTT		LDPYRYNRSQ		GFRVVLAEDC
WMKSLVPLMG		EVRQQMGGKP		IYISFDIDAL		DPAYAPGTGT		PEIAGLTPSQ
ALEIIRGCQG		LNVMGCDLVE		VSPPYDLSGN		TALLAANLLF		EMLCALPKVT
TV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном марганцю. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Iyer R.K., Kim H.K., Tsoa R.W., Grody W.W., Cederbaum S.D. (2002). Cloning and characterization of human agmatinase. Mol. Genet. Metab. 75: 209—218. PMID 11914032 DOI:10.1006/mgme.2001.3277

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18407 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url ()
4. UniProt, Q9BSE5 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1