ABCF1 (англ. ATP binding cassette subfamily F member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 95 926.
ABCF1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ABCF1, ABC27, ABC50, ATP binding cassette subfamily F member 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603429 MGI: 1351658 HomoloGene: 849 GeneCards: ABCF1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 6: 30.57 – 30.6 Mb | Хр. 17: 36.27 – 36.28 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPKAPKQQPP | EPEWIGDGES | TSPSDKVVKK | GKKDKKIKKT | FFEELAVEDK | ||||
QAGEEEKVLK | EKEQQQQQQQ | QQQKKKRDTR | KGRRKKDVDD | DGEEKELMER | ||||
LKKLSVPTSD | EEDEVPAPKP | RGGKKTKGGN | VFAALIQDQS | EEEEEEEKHP | ||||
PKPAKPEKNR | INKAVSEEQQ | PALKGKKGKE | EKSKGKAKPQ | NKFAALDNEE | ||||
EDKEEEIIKE | KEPPKQGKEK | AKKAEQGSEE | EGEGEEEEEE | GGESKADDPY | ||||
AHLSKKEKKK | LKKQMEYERQ | VASLKAANAA | ENDFSVSQAE | MSSRQAMLEN | ||||
ASDIKLEKFS | ISAHGKELFV | NADLYIVAGR | RYGLVGPNGK | GKTTLLKHIA | ||||
NRALSIPPNI | DVLLCEQEVV | ADETPAVQAV | LRADTKRLKL | LEEERRLQGQ | ||||
LEQGDDTAAE | RLEKVYEELR | ATGAAAAEAK | ARRILAGLGF | DPEMQNRPTQ | ||||
KFSGGWRMRV | SLARALFMEP | TLLMLDEPTN | HLDLNAVIWL | NNYLQGWRKT | ||||
LLIVSHDQGF | LDDVCTDIIH | LDAQRLHYYR | GNYMTFKKMY | QQKQKELLKQ | ||||
YEKQEKKLKE | LKAGGKSTKQ | AEKQTKEALT | RKQQKCRRKN | QDEESQEAPE | ||||
LLKRPKEYTV | RFTFPDPPPL | SPPVLGLHGV | TFGYQGQKPL | FKNLDFGIDM | ||||
DSRICIVGPN | GVGKSTLLLL | LTGKLTPTHG | EMRKNHRLKI | GFFNQQYAEQ | ||||
LRMEETPTEY | LQRGFNLPYQ | DARKCLGRFG | LESHAHTIQI | CKLSGGQKAR | ||||
VVFAELACRE | PDVLILDEPT | NNLDIESIDA | LGEAINEYKG | AVIVVSHDAR | ||||
LITETNCQLW | VVEEQSVSQI | DGDFEDYKRE | VLEALGEVMV | SRPRE |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Richard M., Drouin R., Beaulieu A.D. (1998). ABC50, a novel human ATP-binding cassette protein found in tumor necrosis factor-alpha-stimulated synoviocytes. Genomics. 53: 137—145. PMID 9790762 DOI:10.1006/geno.1998.5480
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Paytubi S., Morrice N.A., Boudeau J., Proud C.G. (2008). The N-terminal region of ABC50 interacts with eukaryotic initiation factor eIF2 and is a target for regulatory phosphorylation by CK2. Biochem. J. 409: 223—231. PMID 17894550 DOI:10.1042/BJ20070811
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ABCF1 angl ATP binding cassette subfamily F member 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 6 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 845 aminokislot a molekulyarna masa 95 926 ABCF1IdentifikatoriSimvoliABCF1 ABC27 ABC50 ATP binding cassette subfamily F member 1Zovnishni ID OMIM 603429 MGI 1351658 HomoloGene 849 GeneCards ABCF1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding ribosome binding translation activator activity translation factor activity RNA binding ATPase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding ATP binding RNA bindingKlitinna komponenta citoplazma ribosoma nuclear envelope membrana nukleoplazma klitinne yadro polysomal ribosome gialoplazmaBiologichnij proces Biosintez bilkiv ribosome biogenesis positive regulation of translation transmembrannij transport translational initiation inflammatory responseDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez23 224742Ensembl ENSG00000206490 ENSG00000225989 ENSG00000236149 ENSG00000232169 ENSG00000204574ENSG00000236342 ENSG00000231129 ENSMUSG00000038762UniProt Q8NE71 Q6P542RefSeq mRNK NM 001090 NM 001025091NM 013854RefSeq bilok NP 001020262 NP 001081NP 038882Lokus UCSC Hr 6 30 57 30 6 MbHr 17 36 27 36 28 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPKAPKQQPPEPEWIGDGESTSPSDKVVKKGKKDKKIKKTFFEELAVEDK QAGEEEKVLKEKEQQQQQQQQQQKKKRDTRKGRRKKDVDDDGEEKELMER LKKLSVPTSDEEDEVPAPKPRGGKKTKGGNVFAALIQDQSEEEEEEEKHP PKPAKPEKNRINKAVSEEQQPALKGKKGKEEKSKGKAKPQNKFAALDNEE EDKEEEIIKEKEPPKQGKEKAKKAEQGSEEEGEGEEEEEEGGESKADDPY AHLSKKEKKKLKKQMEYERQVASLKAANAAENDFSVSQAEMSSRQAMLEN ASDIKLEKFSISAHGKELFVNADLYIVAGRRYGLVGPNGKGKTTLLKHIA NRALSIPPNIDVLLCEQEVVADETPAVQAVLRADTKRLKLLEEERRLQGQ LEQGDDTAAERLEKVYEELRATGAAAAEAKARRILAGLGFDPEMQNRPTQ KFSGGWRMRVSLARALFMEPTLLMLDEPTNHLDLNAVIWLNNYLQGWRKT LLIVSHDQGFLDDVCTDIIHLDAQRLHYYRGNYMTFKKMYQQKQKELLKQ YEKQEKKLKELKAGGKSTKQAEKQTKEALTRKQQKCRRKNQDEESQEAPE LLKRPKEYTVRFTFPDPPPLSPPVLGLHGVTFGYQGQKPLFKNLDFGIDM DSRICIVGPNGVGKSTLLLLLTGKLTPTHGEMRKNHRLKIGFFNQQYAEQ LRMEETPTEYLQRGFNLPYQDARKCLGRFGLESHAHTIQICKLSGGQKAR VVFAELACREPDVLILDEPTNNLDIESIDALGEAINEYKGAVIVVSHDAR LITETNCQLWVVEEQSVSQIDGDFEDYKREVLEALGEVMVSRPRE A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak alternativnij splajsing Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u citoplazmi yadri LiteraturaRichard M Drouin R Beaulieu A D 1998 ABC50 a novel human ATP binding cassette protein found in tumor necrosis factor alpha stimulated synoviocytes Genomics 53 137 145 PMID 9790762 DOI 10 1006 geno 1998 5480 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PMID 16964243 DOI 10 1038 nbt1240 Paytubi S Morrice N A Boudeau J Proud C G 2008 The N terminal region of ABC50 interacts with eukaryotic initiation factor eIF2 and is a target for regulatory phosphorylation by CK2 Biochem J 409 223 231 PMID 17894550 DOI 10 1042 BJ20070811PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 10 veresnya 2015 Procitovano 6 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 16 veresnya 2017 Procitovano 6 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 6 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi