Циклофилін B

Циклофилін B (англ. Peptidylprolyl isomerase B) – білок, який кодується геном PPIB, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 216 амінокислот, а молекулярна маса — 23 743.

Циклофилін B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CYN, 3ICH, 3ICI
Ідентифікатори
Символи	PPIB, CYP-S1, CYPB, HEL-S-39, OI9, SCYLP, peptidylprolyl isomerase B, B
Зовнішні ІД	OMIM: 123841 MGI: 97750 HomoloGene: 726 GeneCards: PPIB
Пов'язані генетичні захворювання
osteogenesis imperfecta type 9
Онтологія гена Молекулярна функція • collagen binding • unfolded protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • isomerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase binding • RNA binding • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • cyclosporin A binding Клітинна компонента • GO:0009327 protein-containing complex • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • focal adhesion • Меланосома • smooth endoplasmic reticulum • endoplasmic reticulum chaperone complex • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • екзосома • клітинне ядро Біологічний процес • protein stabilization • regulation of post-translational protein modification • protein peptidyl-prolyl isomerization • positive regulation by host of viral genome replication • positive regulation by host of viral process • згортання білків • positive regulation of multicellular organism growth • bone development • chaperone-mediated protein folding • protein refolding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5479	19035
Ensembl	ENSG00000166794	ENSMUSG00000032383
UniProt	P23284	P24369
RefSeq (мРНК)	NM_000942	NM_011149
RefSeq (білок)	NP_000933	NP_035279
Локус (UCSC)	Хр. 15: 64.16 – 64.16 Mb	Хр. 9: 65.97 – 65.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLRLSERNMK		VLLAAALIAG		SVFFLLLPGP		SAADEKKKGP		KVTVKVYFDL
RIGDEDVGRV		IFGLFGKTVP		KTVDNFVALA		TGEKGFGYKN		SKFHRVIKDF
MIQGGDFTRG		DGTGGKSIYG		ERFPDENFKL		KHYGPGWVSM		ANAGKDTNGS
QFFITTVKTA		WLDGKHVVFG		KVLEGMEVVR		KVESTKTDSR		DKPLKDVIIA
DCGKIEVEKP		FAIAKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до ізомераз, . Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hasel K.W., Glass J.R., Godbout M., Sutcliffe J.G. (1991). An endoplasmic reticulum-specific cyclophilin. Mol. Cell. Biol. 11: 3484—3491. PMID 1710767 DOI:10.1128/MCB.11.7.3484
• Arber S., Krause K.-H., Caroni P. (1992). S-cyclophilin is retained intracellularly via a unique COOH-terminal sequence and colocalizes with the calcium storage protein calreticulin. J. Cell Biol. 116: 113—125. PMID 1530944 DOI:10.1083/jcb.116.1.113
• Mikol V., Kallen J., Walkinshaw M.D. (1994). X-ray structure of a cyclophilin B/cyclosporin complex: comparison with cyclophilin A and delineation of its calcineurin-binding domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 5183—5186. PMID 8197205 DOI:10.1073/pnas.91.11.5183

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з Циклофилін B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9255 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.
5. UniProt, P23284 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

• Хромосома 15