THBD (англ. Thrombomodulin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 575 амінокислот, а молекулярна маса — 60 329.
THBD | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | THBD, AHUS6, BDCA3, CD141, THPH12, THRM, TM, thrombomodulin, BDCA-3 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 188040 MGI: 98736 HomoloGene: 308 GeneCards: THBD | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 20: 23.05 – 23.05 Mb | Хр. 2: 148.25 – 148.25 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLGVLVLGAL | ALAGLGFPAP | AEPQPGGSQC | VEHDCFALYP | GPATFLNASQ | ||||
ICDGLRGHLM | TVRSSVAADV | ISLLLNGDGG | VGRRRLWIGL | QLPPGCGDPK | ||||
RLGPLRGFQW | VTGDNNTSYS | RWARLDLNGA | PLCGPLCVAV | SAAEATVPSE | ||||
PIWEEQQCEV | KADGFLCEFH | FPATCRPLAV | EPGAAAAAVS | ITYGTPFAAR | ||||
GADFQALPVG | SSAAVAPLGL | QLMCTAPPGA | VQGHWAREAP | GAWDCSVENG | ||||
GCEHACNAIP | GAPRCQCPAG | AALQADGRSC | TASATQSCND | LCEHFCVPNP | ||||
DQPGSYSCMC | ETGYRLAADQ | HRCEDVDDCI | LEPSPCPQRC | VNTQGGFECH | ||||
CYPNYDLVDG | ECVEPVDPCF | RANCEYQCQP | LNQTSYLCVC | AEGFAPIPHE | ||||
PHRCQMFCNQ | TACPADCDPN | TQASCECPEG | YILDDGFICT | DIDECENGGF | ||||
CSGVCHNLPG | TFECICGPDS | ALARHIGTDC | DSGKVDGGDS | GSGEPPPSPT | ||||
PGSTLTPPAV | GLVHSGLLIG | ISIASLCLVV | ALLALLCHLR | KKQGAARAKM | ||||
EYKCAAPSKE | VVLQHVRTER | TPQRL |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як зсідання крові, гемостаз. Локалізований у мембрані.
Література
- Jackman R.W., Beeler D.L., Fritze L., Soff G., Rosenberg R.D. (1987). Human thrombomodulin gene is intron depleted: nucleic acid sequences of the cDNA and gene predict protein structure and suggest sites of regulatory control. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 6425—6429. PMID 2819876 DOI:10.1073/pnas.84.18.6425
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Meininger D.P., Hunter M.J., Komives E.A. (1995). Synthesis, activity, and preliminary structure of the fourth EGF-like domain of thrombomodulin. Protein Sci. 4: 1683—1695. PMID 8528067 DOI:10.1002/pro.5560040904
- Hrabal R., Komives E.A., Ni F. (1996). Structural resiliency of an EGF-like subdomain bound to its target protein, thrombin. Protein Sci. 5: 195—203. PMID 8745396 DOI:10.1002/pro.5560050202
- Sampoli Benitez B.A., Hunter M.J., Meininger D.P., Komives E.A. (1997). Structure of the fifth EGF-like domain of thrombomodulin: an EGF-like domain with a novel disulfide-bonding pattern. J. Mol. Biol. 273: 913—926. PMID 9367781 DOI:10.1006/jmbi.1997.1356
- Faioni E.M., Franchi F., Castaman G., Biguzzi E., Rodeghiero F. (2002). Mutations in the thrombomodulin gene are rare in patients with severe thrombophilia. Br. J. Haematol. 118: 595—599. PMID 12139752 DOI:10.1046/j.1365-2141.2002.03644.x
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11784 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, P07204 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
THBD angl Thrombomodulin bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 20 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 575 aminokislot a molekulyarna masa 60 329 THBDNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1ADX 1DQB 1DX5 1EGT 1FGD 1FGE 1HLT 1TMR 1ZAQ 2ADX 3GISIdentifikatoriSimvoliTHBD AHUS6 BDCA3 CD141 THPH12 THRM TM thrombomodulin BDCA 3Zovnishni ID OMIM 188040 MGI 98736 HomoloGene 308 GeneCards THBDOntologiya genaMolekulyarna funkciya calcium ion binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding transmembrane signaling receptor activity signaling receptor activityKlitinna komponenta integral component of membrane cell surface klitinna membrana integral component of plasma membrane membrana apicolateral plasma membrane vacuolar membrane mizhklitinnij prostirBiologichnij proces gemostaz zhinocha vagitnist negative regulation of platelet activation response to lipopolysaccharide response to cAMP negative regulation of fibrinolysis zsidannya krovi response to X ray GO 0072468 signalna transdukciya negative regulation of blood coagulation leukocyte migrationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7056 21824Ensembl ENSG00000178726 ENSMUSG00000074743UniProt P07204 P15306RefSeq mRNK NM 000361NM 009378RefSeq bilok NP 000352NP 033404Lokus UCSC Hr 20 23 05 23 05 MbHr 2 148 25 148 25 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MLGVLVLGALALAGLGFPAPAEPQPGGSQCVEHDCFALYPGPATFLNASQ ICDGLRGHLMTVRSSVAADVISLLLNGDGGVGRRRLWIGLQLPPGCGDPK RLGPLRGFQWVTGDNNTSYSRWARLDLNGAPLCGPLCVAVSAAEATVPSE PIWEEQQCEVKADGFLCEFHFPATCRPLAVEPGAAAAAVSITYGTPFAAR GADFQALPVGSSAAVAPLGLQLMCTAPPGAVQGHWAREAPGAWDCSVENG GCEHACNAIPGAPRCQCPAGAALQADGRSCTASATQSCNDLCEHFCVPNP DQPGSYSCMCETGYRLAADQHRCEDVDDCILEPSPCPQRCVNTQGGFECH CYPNYDLVDGECVEPVDPCFRANCEYQCQPLNQTSYLCVCAEGFAPIPHE PHRCQMFCNQTACPADCDPNTQASCECPEGYILDDGFICTDIDECENGGF CSGVCHNLPGTFECICGPDSALARHIGTDCDSGKVDGGDSGSGEPPPSPT PGSTLTPPAVGLVHSGLLIGISIASLCLVVALLALLCHLRKKQGAARAKM EYKCAAPSKEVVLQHVRTERTPQRL A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do receptoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak zsidannya krovi gemostaz Lokalizovanij u membrani LiteraturaJackman R W Beeler D L Fritze L Soff G Rosenberg R D 1987 Human thrombomodulin gene is intron depleted nucleic acid sequences of the cDNA and gene predict protein structure and suggest sites of regulatory control Proc Natl Acad Sci U S A 84 6425 6429 PMID 2819876 DOI 10 1073 pnas 84 18 6425 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Meininger D P Hunter M J Komives E A 1995 Synthesis activity and preliminary structure of the fourth EGF like domain of thrombomodulin Protein Sci 4 1683 1695 PMID 8528067 DOI 10 1002 pro 5560040904 Hrabal R Komives E A Ni F 1996 Structural resiliency of an EGF like subdomain bound to its target protein thrombin Protein Sci 5 195 203 PMID 8745396 DOI 10 1002 pro 5560050202 Sampoli Benitez B A Hunter M J Meininger D P Komives E A 1997 Structure of the fifth EGF like domain of thrombomodulin an EGF like domain with a novel disulfide bonding pattern J Mol Biol 273 913 926 PMID 9367781 DOI 10 1006 jmbi 1997 1356 Faioni E M Franchi F Castaman G Biguzzi E Rodeghiero F 2002 Mutations in the thrombomodulin gene are rare in patients with severe thrombophilia Br J Haematol 118 595 599 PMID 12139752 DOI 10 1046 j 1365 2141 2002 03644 xPrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 11784 angl Procitovano 12 veresnya 2017 UniProt P07204 angl Procitovano 12 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 20 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi