Псевдоуридин ψ від грецької літери псі 5 рибозил урацил ізомер уридину 1 рибозил урацилу піримідин найпоширеніший вид мо

Псевдоуридин, ψ (від грецької літери «псі») — 5'рибозил-урацил, ізомер уридину (1'рибозил урацилу) — піримідин, найпоширеніший вид модифікацій РНК, які виникають після її синтезу з ДНК-матриці під час процесингу та модифікації.

Псевдоуридин

Інші назви	psi-Uridine, 5-Ribosyluracil, beta-D-Pseudouridine, 5-(beta-D-Ribofuranosyl)uracil
Ідентифікатори
Номер CAS	1445-07-4
PubChem	15047
KEGG	C02067
Назва MeSH	D03.383.742.680.852.628, D13.570.685.852.628 і D13.570.800.892.628
ChEBI	17802
SMILES	C1=C(C(=O)NC(=O)N1)C2C(C(C(O2)CO)O)O^[1]
InChI	InChI=1S/C9H12N2O6/c12-2-4-5(13)6(14)7(17-4)3-1-10-9(16)11-8(3)15/h1,4-7,12-14H,2H2,(H2,10,11,15,16)/t4-,5-,6-,7+/m1/s1
Номер Бельштейна	621385 і 32779
Властивості
Молекулярна формула	C₉H₁₂N₂O₆
Молярна маса	244.20 g/mol
Зовнішній вигляд	білий порошок
Якщо не зазначено інше, дані наведено для речовин у стандартному стані (за 25 °C, 100 кПа)

Примітки картки

Присутність псевдоуридину в молекулах РНК надає більшої жорсткості фосфодіестеразному «хребту» молекули, та додає міцності комплементарній парі ψ-А (замість У-А), звідси псевдоуридинова модифікація грає роль у функціонуванні мяРНК у складі сплайсосом та трансляції у складі рРНК та тРНК. Нещодавно було відкрито присутність ψ у мРНК..

Історія відкриття

Псевдоуридин вперше було відкрито у 1951 році при дослідженнях хімічного складу РНК печінки телят. Псеводуридин виявився настільки поширеним, що деякий час його називали «п'ятий рибонкуклеотид». Впродовж довгого часу вважалося, що псевдоуридинилювання притаманно лише некодуючим РНК, проте у 2014 році знайдені мРНК з ψ.

Псевдоуридинилювання РНК

Див. також: Процесинг РНК

Псевдоуриднилювання РНК за допомогою псевдоуридин синтаз

Додавання псевдоуридину до молекул РНК відбувається шляхом ізомеризації уридину — трансглікозилюванні, тобто переміщенні звя'язку з цукром, рибозою, від першого положення урацилу до п'ятого. Таким чином 1-рибозил урацил стає 5-рибозил-урацилом. Реакція відбувається за допомогою ферментів псевдоуридин-синтаз (англ. pseudouridine synthase, PUS). Така модифікація змінює C-N глікозидний зв'язок між рибозою та азотистою основою (див. рис. «псевдоуриднилювання РНК») на C-C зв'язок, який є більш міцним. Також додається ще один донор гідрогену, який збільшує стійкість ψ-А пари. -

Див. також

Примітки

PSEUDOURIDINE
d:Track:Q278487
John Karijolich, Chengqi Yi]] & Yi-Tao Yu (October 2015). Transcriptome-wide dynamics of RNA pseudouridylation. . 16 (10): 581—585. doi:10.1038/nrm4040. PMID 26285676.
Schwartz Schraga, Bernstein Douglas A., Mumbach Maxwell R. та ін. (September 2014). Transcriptome-wide Mapping Reveals Widespread Dynamic-Regulated Pseudouridylation of ncRNA and mRNA. Cell. doi:10.1016/j.cell.2014.08.028. ISSN 0092-8674. {{}}: Явне використання «та ін.» у: |author= ()

[<span_class="wikidata_cite_citetype_Q2881060_citetype_Q4117139_citetype_Q5227240"_data-entity-id="Q278487">PSEUDOURIDINE<span_class="wef_low_priority_links"></span></span><div_style="display:none">[[d:Track:Q278487]]</div>-1] PSEUDOURIDINE
d:Track:Q278487

[Tr-w_PsU-2] John Karijolich, Chengqi Yi]] & Yi-Tao Yu (October 2015). Transcriptome-wide dynamics of RNA pseudouridylation. . 16 (10): 581—585. doi:10.1038/nrm4040. PMID 26285676.

[SchwartzBernstein2014-3] Schwartz Schraga, Bernstein Douglas A., Mumbach Maxwell R. та ін. (September 2014). Transcriptome-wide Mapping Reveals Widespread Dynamic-Regulated Pseudouridylation of ncRNA and mRNA. Cell. doi:10.1016/j.cell.2014.08.028. ISSN 0092-8674. {{}}: Явне використання «та ін.» у: |author= ()

[1]