KARS (англ. Lysyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людини на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 597 амінокислот, а молекулярна маса — 68 048.
KARS | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | KARS1, KARS2, CMTRIB, lysyl-tRNA synthetase 1, KRS, Lysyl-tRNA synthetase, KARS, DFNB89, LEPID, DEAPLE | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601421 MGI: 1934754 HomoloGene: 4053 GeneCards: KARS1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Charcot-Marie-Tooth disease recessive intermediate B, autosomal recessive nonsyndromic deafness 89 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 75.63 – 75.65 Mb | Хр. 8: 112.72 – 112.74 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAAVQAAEVK | VDGSEPKLSK | NELKRRLKAE | KKVAEKEAKQ | KELSEKQLSQ | ||||
ATAAATNHTT | DNGVGPEEES | VDPNQYYKIR | SQAIHQLKVN | GEDPYPHKFH | ||||
VDISLTDFIQ | KYSHLQPGDH | LTDITLKVAG | RIHAKRASGG | KLIFYDLRGE | ||||
GVKLQVMANS | RNYKSEEEFI | HINNKLRRGD | IIGVQGNPGK | TKKGELSIIP | ||||
YEITLLSPCL | HMLPHLHFGL | KDKETRYRQR | YLDLILNDFV | RQKFIIRSKI | ||||
ITYIRSFLDE | LGFLEIETPM | MNIIPGGAVA | KPFITYHNEL | DMNLYMRIAP | ||||
ELYHKMLVVG | GIDRVYEIGR | QFRNEGIDLT | HNPEFTTCEF | YMAYADYHDL | ||||
MEITEKMVSG | MVKHITGSYK | VTYHPDGPEG | QAYDVDFTPP | FRRINMVEEL | ||||
EKALGMKLPE | TNLFETEETR | KILDDICVAK | AVECPPPRTT | ARLLDKLVGE | ||||
FLEVTCINPT | FICDHPQIMS | PLAKWHRSKE | GLTERFELFV | MKKEICNAYT | ||||
ELNDPMRQRQ | LFEEQAKAKA | AGDDEAMFID | ENFCTALEYG | LPPTAGWGMG | ||||
IDRVAMFLTD | SNNIKEVLLF | PAMKPEDKKE | NVATTDTLES | TTVGTSV |
Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії. Також секретований назовні.
Література
- Tolkunova E., Park H., Xia J., King M.P., Davidson E. (2000). The human lysyl-tRNA synthetase gene encodes both the cytoplasmic and mitochondrial enzymes by means of an unusual alternative splicing of the primary transcript. J. Biol. Chem. 275: 35063—35069. PMID 10952987 DOI:10.1074/jbc.M006265200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zamecnik P.C., Stephenson M.L., Janeway C.M., Randerath K. (1966). Enzymatic synthesis of diadenosine tetraphosphate and diadenosine triphosphate with a purified lysyl-tRNA synthetase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 24: 91—97. PMID 5338216 DOI:10.1016/0006-291X(66)90415-3
- Quevillon S., Robinson J.-C., Berthonneau E., Siatecka M., Mirande M. (1999). Macromolecular assemblage of aminoacyl-tRNA synthetases: identification of protein-protein interactions and characterization of a core protein. J. Mol. Biol. 285: 183—195. PMID 9878398 DOI:10.1006/jmbi.1998.2316
- Tan M., Wei C., Price C.M. (2003). The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes. Gene. 323: 1—10. PMID 14659874 DOI:10.1016/j.gene.2003.08.026
- Lee Y.N., Nechushtan H., Figov N., Razin E. (2004). The function of lysyl-tRNA synthetase and Ap4A as signaling regulators of MITF activity in FcepsilonRI-activated mast cells. Immunity. 20: 145—151. PMID 14975237 DOI:10.1016/S1074-7613(04)00020-2
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з KARS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
KARS angl Lysyl tRNA synthetase bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudini na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 597 aminokislot a molekulyarna masa 68 048 KARSNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3BJU 4DPG 4YCU 4YCWIdentifikatoriSimvoliKARS1 KARS2 CMTRIB lysyl tRNA synthetase 1 KRS Lysyl tRNA synthetase KARS DFNB89 LEPID DEAPLEZovnishni ID OMIM 601421 MGI 1934754 HomoloGene 4053 GeneCards KARS1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaCharcot Marie Tooth disease recessive intermediate B autosomal recessive nonsyndromic deafness 89 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya aminoacyl tRNA ligase activity nucleotide binding amino acid binding tRNA binding lysine tRNA ligase activity ligase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding ATP binding ATP adenylyltransferase activity protein homodimerization activity transferase activity identical protein bindingKlitinna komponenta membrana klitinna membrana extracellular region mitohondrialnij matriks mitohondriya mizhklitinnij prostir aminoacyl tRNA synthetase multienzyme complex klitinne yadro citoplazma gialoplazmaBiologichnij proces Biosintez bilkiv tRNA processing tRNA aminoacylation for protein translation lysyl tRNA aminoacylation GO 0022415 viral process basophil activation involved in immune response negative regulation of cell population proliferation positive regulation of macrophage chemotaxis tumor necrosis factor mediated signaling pathway positive regulation of macrophage activation GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated ERK1 and ERK2 cascade positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response positive regulation of p38MAPK cascade positive regulation of metallopeptidase activity diadenosine tetraphosphate biosynthetic process response to X rayDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3735 85305Ensembl ENSG00000065427 ENSMUSG00000031948UniProt Q15046 Q99MN1RefSeq mRNK NM 005548 NM 001130089 NM 001378148NM 001130868 NM 001286384 NM 053092 NM 001363429 NM 001363430RefSeq bilok NP 001123561 NP 005539 NP 001365077NP 001124340 NP 001273313 NP 444322 NP 001350358 NP 001350359Lokus UCSC Hr 16 75 63 75 65 MbHr 8 112 72 112 74 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAAVQAAEVKVDGSEPKLSKNELKRRLKAEKKVAEKEAKQKELSEKQLSQ ATAAATNHTTDNGVGPEEESVDPNQYYKIRSQAIHQLKVNGEDPYPHKFH VDISLTDFIQKYSHLQPGDHLTDITLKVAGRIHAKRASGGKLIFYDLRGE GVKLQVMANSRNYKSEEEFIHINNKLRRGDIIGVQGNPGKTKKGELSIIP YEITLLSPCLHMLPHLHFGLKDKETRYRQRYLDLILNDFVRQKFIIRSKI ITYIRSFLDELGFLEIETPMMNIIPGGAVAKPFITYHNELDMNLYMRIAP ELYHKMLVVGGIDRVYEIGRQFRNEGIDLTHNPEFTTCEFYMAYADYHDL MEITEKMVSGMVKHITGSYKVTYHPDGPEGQAYDVDFTPPFRRINMVEEL EKALGMKLPETNLFETEETRKILDDICVAKAVECPPPRTTARLLDKLVGE FLEVTCINPTFICDHPQIMSPLAKWHRSKEGLTERFELFVMKKEICNAYT ELNDPMRQRQLFEEQAKAKAAGDDEAMFIDENFCTALEYGLPPTAGWGMG IDRVAMFLTDSNNIKEVLLFPAMKPEDKKENVATTDTLESTTVGTSV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do ligaz aminoacil tRNK sintetaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak vzayemodiya hazyayin virus biosintez bilka Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv Lokalizovanij u klitinnij membrani citoplazmi yadri membrani mitohondriyi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaTolkunova E Park H Xia J King M P Davidson E 2000 The human lysyl tRNA synthetase gene encodes both the cytoplasmic and mitochondrial enzymes by means of an unusual alternative splicing of the primary transcript J Biol Chem 275 35063 35069 PMID 10952987 DOI 10 1074 jbc M006265200 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Zamecnik P C Stephenson M L Janeway C M Randerath K 1966 Enzymatic synthesis of diadenosine tetraphosphate and diadenosine triphosphate with a purified lysyl tRNA synthetase Biochem Biophys Res Commun 24 91 97 PMID 5338216 DOI 10 1016 0006 291X 66 90415 3 Quevillon S Robinson J C Berthonneau E Siatecka M Mirande M 1999 Macromolecular assemblage of aminoacyl tRNA synthetases identification of protein protein interactions and characterization of a core protein J Mol Biol 285 183 195 PMID 9878398 DOI 10 1006 jmbi 1998 2316 Tan M Wei C Price C M 2003 The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes Gene 323 1 10 PMID 14659874 DOI 10 1016 j gene 2003 08 026 Lee Y N Nechushtan H Figov N Razin E 2004 The function of lysyl tRNA synthetase and Ap4A as signaling regulators of MITF activity in FcepsilonRI activated mast cells Immunity 20 145 151 PMID 14975237 DOI 10 1016 S1074 7613 04 00020 2PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z KARS pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 22 serpnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 22 serpnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi