NID1 (англ. Nidogen 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 247 амінокислот, а молекулярна маса — 136 377.
NID1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NID1, NID, nidogen 1, entactin | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 131390 MGI: 97342 HomoloGene: 1878 GeneCards: NID1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 235.98 – 236.07 Mb | Хр. 13: 13.61 – 13.69 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MLASSSRIRA | AWTRALLLPL | LLAGPVGCLS | RQELFPFGPG | QGDLELEDGD | ||||
DFVSPALELS | GALRFYDRSD | IDAVYVTTNG | IIATSEPPAK | ESHPGLFPPT | ||||
FGAVAPFLAD | LDTTDGLGKV | YYREDLSPSI | TQRAAECVHR | GFPEISFQPS | ||||
SAVVVTWESV | APYQGPSRDP | DQKGKRNTFQ | AVLASSDSSS | YAIFLYPEDG | ||||
LQFHTTFSKK | ENNQVPAVVA | FSQGSVGFLW | KSNGAYNIFA | NDRESVENLA | ||||
KSSNSGQQGV | WVFEIGSPAT | TNGVVPADVI | LGTEDGAEYD | DEDEDYDLAT | ||||
TRLGLEDVGT | TPFSYKALRR | GGADTYSVPS | VLSPRRAATE | RPLGPPTERT | ||||
RSFQLAVETF | HQQHPQVIDV | DEVEETGVVF | SYNTDSRQTC | ANNRHQCSVH | ||||
AECRDYATGF | CCSCVAGYTG | NGRQCVAEGS | PQRVNGKVKG | RIFVGSSQVP | ||||
IVFENTDLHS | YVVMNHGRSY | TAISTIPETV | GYSLLPLAPV | GGIIGWMFAV | ||||
EQDGFKNGFS | ITGGEFTRQA | EVTFVGHPGN | LVIKQRFSGI | DEHGHLTIDT | ||||
ELEGRVPQIP | FGSSVHIEPY | TELYHYSTSV | ITSSSTREYT | VTEPERDGAS | ||||
PSRIYTYQWR | QTITFQECVH | DDSRPALPST | QQLSVDSVFV | LYNQEEKILR | ||||
YALSNSIGPV | REGSPDALQN | PCYIGTHGCD | TNAACRPGPR | TQFTCECSIG | ||||
FRGDGRTCYD | IDECSEQPSV | CGSHTICNNH | PGTFRCECVE | GYQFSDEGTC | ||||
VAVVDQRPIN | YCETGLHNCD | IPQRAQCIYT | GGSSYTCSCL | PGFSGDGQAC | ||||
QDVDECQPSR | CHPDAFCYNT | PGSFTCQCKP | GYQGDGFRCV | PGEVEKTRCQ | ||||
HEREHILGAA | GATDPQRPIP | PGLFVPECDA | HGHYAPTQCH | GSTGYCWCVD | ||||
RDGREVEGTR | TRPGMTPPCL | STVAPPIHQG | PAVPTAVIPL | PPGTHLLFAQ | ||||
TGKIERLPLE | GNTMRKTEAK | AFLHVPAKVI | IGLAFDCVDK | MVYWTDITEP | ||||
SIGRASLHGG | EPTTIIRQDL | GSPEGIAVDH | LGRNIFWTDS | NLDRIEVAKL | ||||
DGTQRRVLFE | TDLVNPRGIV | TDSVRGNLYW | TDWNRDNPKI | ETSYMDGTNR | ||||
RILVQDDLGL | PNGLTFDAFS | SQLCWVDAGT | NRAECLNPSQ | PSRRKALEGL | ||||
QYPFAVTSYG | KNLYFTDWKM | NSVVALDLAI | SKETDAFQPH | KQTRLYGITT | ||||
ALSQCPQGHN | YCSVNNGGCT | HLCLATPGSR | TCRCPDNTLG | VDCIEQK |
Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Zimmermann K., Hoischen S., Hafner M., Nischt R. (1995). Genomic sequences and structural organization of the human nidogen gene (NID). Genomics. 27: 245—250. PMID 7557988 DOI:10.1006/geno.1995.1038
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lee H.K., Seo I.A., Park H.K., Park H.T. (2006). Identification of the basement membrane protein nidogen as a candidate ligand for tumor endothelial marker 7 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 580: 2253—2257. PMID 16574105 DOI:10.1016/j.febslet.2006.03.033
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7821 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- UniProt, P14543 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NID1 angl Nidogen 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 247 aminokislot a molekulyarna masa 136 377 NID1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSBSpisok kodiv PDB1NDXIdentifikatoriSimvoliNID1 NID nidogen 1 entactinZovnishni ID OMIM 131390 MGI 97342 HomoloGene 1878 GeneCards NID1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya laminin 1 binding calcium ion binding laminin binding collagen binding extracellular matrix binding proteoglycan binding extracellular matrix structural constituentKlitinna komponenta GO 0005578 Pozaklitinna matricya extracellular region bazalna membrana ekzosoma cell periphery mizhklitinnij prostir collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces cell matrix adhesion extracellular matrix disassembly extracellular matrix organization adgeziya klitin glomerular basement membrane development basement membrane organization positive regulation of cell substrate adhesionDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4811 18073Ensembl ENSG00000116962 ENSMUSG00000005397UniProt P14543 P10493RefSeq mRNK NM 002508NM 010917RefSeq bilok NP 002499NP 035047Lokus UCSC Hr 1 235 98 236 07 MbHr 13 13 61 13 69 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MLASSSRIRAAWTRALLLPLLLAGPVGCLSRQELFPFGPGQGDLELEDGDDFVSPALELSGALRFYDRSDIDAVYVTTNGIIATSEPPAKESHPGLFPPTFGAVAPFLADLDTTDGLGKVYYREDLSPSITQRAAECVHRGFPEISFQPSSAVVVTWESVAPYQGPSRDPDQKGKRNTFQAVLASSDSSSYAIFLYPEDGLQFHTTFSKKENNQVPAVVAFSQGSVGFLWKSNGAYNIFANDRESVENLAKSSNSGQQGVWVFEIGSPATTNGVVPADVILGTEDGAEYDDEDEDYDLATTRLGLEDVGTTPFSYKALRRGGADTYSVPSVLSPRRAATERPLGPPTERTRSFQLAVETFHQQHPQVIDVDEVEETGVVFSYNTDSRQTCANNRHQCSVHAECRDYATGFCCSCVAGYTGNGRQCVAEGSPQRVNGKVKGRIFVGSSQVPIVFENTDLHSYVVMNHGRSYTAISTIPETVGYSLLPLAPVGGIIGWMFAVEQDGFKNGFSITGGEFTRQAEVTFVGHPGNLVIKQRFSGIDEHGHLTIDTELEGRVPQIPFGSSVHIEPYTELYHYSTSVITSSSTREYTVTEPERDGASPSRIYTYQWRQTITFQECVHDDSRPALPSTQQLSVDSVFVLYNQEEKILRYALSNSIGPVREGSPDALQNPCYIGTHGCDTNAACRPGPRTQFTCECSIGFRGDGRTCYDIDECSEQPSVCGSHTICNNHPGTFRCECVEGYQFSDEGTCVAVVDQRPINYCETGLHNCDIPQRAQCIYTGGSSYTCSCLPGFSGDGQACQDVDECQPSRCHPDAFCYNTPGSFTCQCKPGYQGDGFRCVPGEVEKTRCQHEREHILGAAGATDPQRPIPPGLFVPECDAHGHYAPTQCHGSTGYCWCVDRDGREVEGTRTRPGMTPPCLSTVAPPIHQGPAVPTAVIPLPPGTHLLFAQTGKIERLPLEGNTMRKTEAKAFLHVPAKVIIGLAFDCVDKMVYWTDITEPSIGRASLHGGEPTTIIRQDLGSPEGIAVDHLGRNIFWTDSNLDRIEVAKLDGTQRRVLFETDLVNPRGIVTDSVRGNLYWTDWNRDNPKIETSYMDGTNRRILVQDDLGLPNGLTFDAFSSQLCWVDAGTNRAECLNPSQPSRRKALEGLQYPFAVTSYGKNLYFTDWKMNSVVALDLAISKETDAFQPHKQTRLYGITTALSQCPQGHNYCSVNNGGCTHLCLATPGSRTCRCPDNTLGVDCIEQKA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak klitinna adgeziya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionom kalciyu Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi bazalnij membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaZimmermann K Hoischen S Hafner M Nischt R 1995 Genomic sequences and structural organization of the human nidogen gene NID Genomics 27 245 250 PMID 7557988 DOI 10 1006 geno 1995 1038 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Lee H K Seo I A Park H K Park H T 2006 Identification of the basement membrane protein nidogen as a candidate ligand for tumor endothelial marker 7 in vitro and in vivo FEBS Lett 580 2253 2257 PMID 16574105 DOI 10 1016 j febslet 2006 03 033PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 7821 angl Procitovano 22 serpnya 2017 UniProt P14543 angl Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi