SYT11

SYT11 (англ. Synaptotagmin 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 48 297.

SYT11
Ідентифікатори
Символи	SYT11, SYT12, sytXI, synaptotagmin 11
Зовнішні ІД	OMIM: 608741 MGI: 1859547 HomoloGene: 23120 GeneCards: SYT11
Онтологія гена Молекулярна функція • clathrin binding • calcium ion binding • syntaxin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • translation initiation factor binding • ubiquitin protein ligase binding • SNARE binding • protein homodimerization activity • beta-tubulin binding • calcium-dependent phospholipid binding • phosphatidylserine binding Клітинна компонента • integral component of membrane • міжклітинні контакти • синапс • integral component of plasma membrane • synaptic vesicle membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • везикула • phagocytic cup • presynaptic active zone membrane • inhibitory synapse • Синаптичні бульбашки • presynapse • dendritic spine • лізосома • цитоплазма • recycling endosome • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • cell body • аксон • early phagosome • excitatory synapse • neuron projection • terminal bouton • phagocytic vesicle • perinuclear region of cytoplasm • integral component of synaptic vesicle membrane • Schaffer collateral - CA1 synapse • postsynapse • integral component of presynaptic active zone membrane • exocytic vesicle Біологічний процес • negative regulation of neurotransmitter secretion • regulation of phagosome maturation • regulation of defense response to bacterium • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • negative regulation of synaptic vesicle endocytosis • negative regulation of membrane invagination • vesicle fusion • protein homotetramerization • negative regulation of clathrin-dependent endocytosis • negative regulation of phagocytosis • positive regulation of protein localization to phagocytic vesicle • plasma membrane repair • response to wounding • negative regulation of clathrin-coated pit assembly • calcium ion regulated lysosome exocytosis • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • regulation of dopamine secretion • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23208	229521
Ensembl	ENSG00000132718	ENSMUSG00000068923
UniProt	Q9BT88	Q9R0N3
RefSeq (мРНК)	NM_152280	NM_018804
RefSeq (білок)	NP_689493	NP_061274
Локус (UCSC)	Хр. 1: 155.86 – 155.89 Mb	Хр. 3: 88.65 – 88.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEITNIRPS		FDVSPVVAGL		IGASVLVVCV		SVTVFVWSCC		HQQAEKKQKN
PPYKFIHMLK		GISIYPETLS		NKKKIIKVRR		DKDGPGREGG		RRNLLVDAAE
AGLLSRDKDP		RGPSSGSCID		QLPIKMDYGE		ELRSPITSLT		PGESKTTSPS
SPEEDVMLGS		LTFSVDYNFP		KKALVVTIQE		AHGLPVMDDQ		TQGSDPYIKM
TILPDKRHRV		KTRVLRKTLD		PVFDETFTFY		GIPYSQLQDL		VLHFLVLSFD
RFSRDDVIGE		VMVPLAGVDP		STGKVQLTRD		IIKRNIQKCI		SRGELQVSLS
YQPVAQRMTV		VVLKARHLPK		MDITGLSGNP		YVKVNVYYGR		KRIAKKKTHV
KKCTLNPIFN		ESFIYDIPTD		LLPDISIEFL		VIDFDRTTKN		EVVGRLILGA
HSVTASGAEH		WREVCESPRK		PVAKWHSLSE		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Huynh D.P., Scoles D.R., Nguyen D., Pulst S.M. (2003). The autosomal recessive juvenile Parkinson disease gene product, parkin, interacts with and ubiquitinates synaptotagmin XI. Hum. Mol. Genet. 12: 2587—2597. PMID 12925569 DOI:10.1093/hmg/ddg269

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19239 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1