SETD7 (англ. SET domain containing lysine methyltransferase 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 40 721.
SETD7 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SETD7, KMT7, SET7, SET7/9, SET9, SET domain containing lysine methyltransferase 7, SET domain containing 7, histone lysine methyltransferase | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606594 MGI: 1920501 HomoloGene: 12741 GeneCards: SETD7 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 139.5 – 139.61 Mb | Хр. 3: 51.42 – 51.47 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDSDDEMVEE | AVEGHLDDDG | LPHGFCTVTY | SSTDRFEGNF | VHGEKNGRGK | ||||
FFFFDGSTLE | GYYVDDALQG | QGVYTYEDGG | VLQGTYVDGE | LNGPAQEYDT | ||||
DGRLIFKGQY | KDNIRHGVCW | IYYPDGGSLV | GEVNEDGEMT | GEKIAYVYPD | ||||
ERTALYGKFI | DGEMIEGKLA | TLMSTEEGRP | HFELMPGNSV | YHFDKSTSSC | ||||
ISTNALLPDP | YESERVYVAE | SLISSAGEGL | FSKVAVGPNT | VMSFYNGVRI | ||||
THQEVDSRDW | ALNGNTLSLD | EETVIDVPEP | YNHVSKYCAS | LGHKANHSFT | ||||
PNCIYDMFVH | PRFGPIKCIR | TLRAVEADEE | LTVAYGYDHS | PPGKSGPEAP | ||||
EWYQVELKAF | QATQQK |
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, , метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з . Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Martens J.H., Verlaan M., Kalkhoven E., Zantema A. (2003). Cascade of distinct histone modifications during collagenase gene activation. Mol. Cell. Biol. 23: 1808—1816. PMID 12588998 DOI:10.1128/MCB.23.5.1808-1816.2003
- Kouskouti A., Scheer E., Staub A., Tora L., Talianidis I. (2004). Gene-specific modulation of TAF10 function by SET9-mediated methylation. Mol. Cell. 14: 175—182. PMID 15099517 DOI:10.1016/S1097-2765(04)00182-0
- Francis J., Chakrabarti S.K., Garmey J.C., Mirmira R.G. (2005). Pdx-1 links histone H3-Lys-4 methylation to RNA polymerase II elongation during activation of insulin transcription. J. Biol. Chem. 280: 36244—36253. PMID 16141209 DOI:10.1074/jbc.M505741200
- Hu P., Zhang Y. (2006). Catalytic mechanism and product specificity of the histone lysine methyltransferase SET7/9: an ab initio QM/MM-FE study with multiple initial structures. J. Am. Chem. Soc. 128: 1272—1278. PMID 16433545 DOI:10.1021/ja056153+
- Couture J.-F., Collazo E., Hauk G., Trievel R.C. (2006). Structural basis for the methylation site specificity of SET7/9. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 140—146. PMID 16415881 DOI:10.1038/nsmb1045
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30412 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SETD7 angl SET domain containing lysine methyltransferase 7 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 4 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 366 aminokislot a molekulyarna masa 40 721 SETD7Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1H3I 1MT6 1MUF 1N6A 1N6C 1O9S 1XQH 2F69 3CBM 3CBO 3CBP 3M53 3M54 3M55 3M56 3M57 3M58 3M59 3M5A 3OS5 3VUZ 3VV0 4E47 4J7F 4J8O 4JDS 4JLG 5EG2 5AYFIdentifikatoriSimvoliSETD7 KMT7 SET7 SET7 9 SET9 SET domain containing lysine methyltransferase 7 SET domain containing 7 histone lysine methyltransferaseZovnishni ID OMIM 606594 MGI 1920501 HomoloGene 12741 GeneCards SETD7Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0102674 GO 0102675 methyltransferase activity transferase activity p53 binding chromatin binding protein lysine N methyltransferase activity GO 0001948 GO 0016582 protein binding histone lysine N methyltransferase activityKlitinna komponenta nukleoplazma hromosoma yaderce klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated peptidyl lysine monomethylation transcription DNA templated cellular response to DNA damage stimulus GO 0060469 GO 0009371 positive regulation of transcription DNA templated peptidyl lysine methylation Metilyuvannya heterochromatin organization peptidyl lysine dimethylation histone lysine methylation response to ethanol regulation of histone H3 K9 methylation GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organizationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez80854 73251Ensembl ENSG00000145391 ENSMUSG00000037111UniProt Q8WTS6 Q8VHL1RefSeq mRNK NM 001306199 NM 001306200 NM 030648NM 080793RefSeq bilok NP 001293128 NP 001293129 NP 085151NP 542983Lokus UCSC Hr 4 139 5 139 61 MbHr 3 51 42 51 47 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MDSDDEMVEEAVEGHLDDDGLPHGFCTVTYSSTDRFEGNFVHGEKNGRGK FFFFDGSTLEGYYVDDALQGQGVYTYEDGGVLQGTYVDGELNGPAQEYDT DGRLIFKGQYKDNIRHGVCWIYYPDGGSLVGEVNEDGEMTGEKIAYVYPD ERTALYGKFIDGEMIEGKLATLMSTEEGRPHFELMPGNSVYHFDKSTSSC ISTNALLPDPYESERVYVAESLISSAGEGLFSKVAVGPNTVMSFYNGVRI THQEVDSRDWALNGNTLSLDEETVIDVPEPYNHVSKYCASLGHKANHSFT PNCIYDMFVHPRFGPIKCIRTLRAVEADEELTVAYGYDHSPPGKSGPEAP EWYQVELKAFQATQQK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do transferaz aktivatoriv metiltransferaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z Lokalizovanij u yadri hromosomah LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Martens J H Verlaan M Kalkhoven E Zantema A 2003 Cascade of distinct histone modifications during collagenase gene activation Mol Cell Biol 23 1808 1816 PMID 12588998 DOI 10 1128 MCB 23 5 1808 1816 2003 Kouskouti A Scheer E Staub A Tora L Talianidis I 2004 Gene specific modulation of TAF10 function by SET9 mediated methylation Mol Cell 14 175 182 PMID 15099517 DOI 10 1016 S1097 2765 04 00182 0 Francis J Chakrabarti S K Garmey J C Mirmira R G 2005 Pdx 1 links histone H3 Lys 4 methylation to RNA polymerase II elongation during activation of insulin transcription J Biol Chem 280 36244 36253 PMID 16141209 DOI 10 1074 jbc M505741200 Hu P Zhang Y 2006 Catalytic mechanism and product specificity of the histone lysine methyltransferase SET7 9 an ab initio QM MM FE study with multiple initial structures J Am Chem Soc 128 1272 1278 PMID 16433545 DOI 10 1021 ja056153 Couture J F Collazo E Hauk G Trievel R C 2006 Structural basis for the methylation site specificity of SET7 9 Nat Struct Mol Biol 13 140 146 PMID 16415881 DOI 10 1038 nsmb1045PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 30412 angl Procitovano 30 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 25 serpnya 2017 Procitovano 30 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 4 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi