OPTC (англ. Opticin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 37 261.
OPTC | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | OPTC, OPT, opticin | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605127 MGI: 2151113 HomoloGene: 8652 GeneCards: OPTC | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 203.49 – 203.51 Mb | Хр. 1: 133.82 – 133.84 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRLLAFLSLL | ALVLQETGTA | SLPRKERKRR | EEQMPREGDS | FEVLPLRNDV | ||||
LNPDNYGEVI | DLSNYEELTD | YGDQLPEVKV | TSLAPATSIS | PAKSTTAPGT | ||||
PSSNPTMTRP | TTAGLLLSSQ | PNHGLPTCLV | CVCLGSSVYC | DDIDLEDIPP | ||||
LPRRTAYLYA | RFNRISRIRA | EDFKGLTKLK | RIDLSNNLIS | SIDNDAFRLL | ||||
HALQDLILPE | NQLEALPVLP | SGIEFLDVRL | NRLQSSGIQP | AAFRAMEKLQ | ||||
FLYLSDNLLD | SIPGPLPLSL | RSVHLQNNLI | ETMQRDVFCD | PEEHKHTRRQ | ||||
LEDIRLDGNP | INLSLFPSAY | FCLPRLPIGR | FT |
Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Friedman J.S., Ducharme R., Raymond V., Walter M.A. (2000). Isolation of a novel iris-specific and leucine-rich repeat protein (oculoglycan) using differential selection. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 41: 2059—2066. PMID 10892843
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8158 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
OPTC angl Opticin bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 332 aminokislot a molekulyarna masa 37 261 OPTCIdentifikatoriSimvoliOPTC OPT opticinZovnishni ID OMIM 605127 MGI 2151113 HomoloGene 8652 GeneCards OPTCOntologiya genaMolekulyarna funkciya extracellular matrix structural constituentKlitinna komponenta extracellular region GO 0005578 Pozaklitinna matricyaBiologichnij proces extracellular matrix disassemblyDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez26254 269120Ensembl ENSG00000188770 ENSMUSG00000010311UniProt Q9UBM4 Q920A0RefSeq mRNK NM 014359NM 001160420 NM 001160421 NM 001160422 NM 054076 NM 001395557NM 001395558RefSeq bilok NP 055174NP 001153892 NP 001153893 NP 001153894 NP 473417 NP 001382486NP 001382487Lokus UCSC Hr 1 203 49 203 51 MbHr 1 133 82 133 84 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRLLAFLSLLALVLQETGTASLPRKERKRREEQMPREGDSFEVLPLRNDV LNPDNYGEVIDLSNYEELTDYGDQLPEVKVTSLAPATSISPAKSTTAPGT PSSNPTMTRPTTAGLLLSSQPNHGLPTCLVCVCLGSSVYCDDIDLEDIPP LPRRTAYLYARFNRISRIRAEDFKGLTKLKRIDLSNNLISSIDNDAFRLL HALQDLILPENQLEALPVLPSGIEFLDVRLNRLQSSGIQPAAFRAMEKLQ FLYLSDNLLDSIPGPLPLSLRSVHLQNNLIETMQRDVFCDPEEHKHTRRQ LEDIRLDGNPINLSLFPSAYFCLPRLPIGRFT A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak polimorfizm Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Friedman J S Ducharme R Raymond V Walter M A 2000 Isolation of a novel iris specific and leucine rich repeat protein oculoglycan using differential selection Invest Ophthalmol Vis Sci 41 2059 2066 PMID 10892843PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 8158 angl Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 10 listopada 2016 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi