Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

LIG4 англ DNA ligase 4 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 13 ї хромосоми Дов

LIG4

LIG4

LIG4 (англ. DNA ligase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 911 амінокислот, а молекулярна маса — 103 971.

LIG4
image
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LIG4, LIG4S, DNA ligase 4
Зовнішні ІД OMIM: 601837 MGI: 1335098 HomoloGene: 1736 GeneCards: LIG4
Пов'язані генетичні захворювання
DNA ligase IV deficiency
Шаблон експресії
image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3981
319583
Ensembl
ENSG00000174405
ENSMUSG00000049717
UniProt
P49917
Q8BTF7
RefSeq (мРНК)
NM_176953
NM_001377042
RefSeq (білок)
NP_795927
NP_001363971
Локус (UCSC) Хр. 13: 108.21 – 108.22 Mb Хр. 8: 10.02 – 10.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAASQTSQTVASHVPFADLCSTLERIQKSKGRAEKIRHFREFLDSWRKFH
DALHKNHKDVTDSFYPAMRLILPQLERERMAYGIKETMLAKLYIELLNLP
RDGKDALKLLNYRTPTGTHGDAGDFAMIAYFVLKPRCLQKGSLTIQQVND
LLDSIASNNSAKRKDLIKKSLLQLITQSSALEQKWLIRMIIKDLKLGVSQ
QTIFSVFHNDAAELHNVTTDLEKVCRQLHDPSVGLSDISITLFSAFKPML
AAIADIEHIEKDMKHQSFYIETKLDGERMQMHKDGDVYKYFSRNGYNYTD
QFGASPTEGSLTPFIHNAFKADIQICILDGEMMAYNPNTQTFMQKGTKFD
IKRMVEDSDLQTCYCVFDVLMVNNKKLGHETLRKRYEILSSIFTPIPGRI
EIVQKTQAHTKNEVIDALNEAIDKREEGIMVKQPLSIYKPDKRGEGWLKI
KPEYVSGLMDELDILIVGGYWGKGSRGGMMSHFLCAVAEKPPPGEKPSVF
HTLSRVGSGCTMKELYDLGLKLAKYWKPFHRKAPPSSILCGTEKPEVYIE
PCNSVIVQIKAAEIVPSDMYKTGCTLRFPRIEKIRDDKEWHECMTLDDLE
QLRGKASGKLASKHLYIGGDDEPQEKKRKAAPKMKKVIGIIEHLKAPNLT
NVNKISNIFEDVEFCVMSGTDSQPKPDLENRIAEFGGYIVQNPGPDTYCV
IAGSENIRVKNIILSNKHDVVKPAWLLECFKTKSFVPWQPRFMIHMCPST
KEHFAREYDCYGDSYFIDTDLNQLKEVFSGIKNSNEQTPEEMASLIADLE
YRYSWDCSPLSMFRRHTVYLDSYAVINDLSTKNEGTRLAIKALELRFHGA
KVVSCLAEGVSHVIIGEDHSRVADFKAFRRTFKRKFKILKESWVTDSIDK
CELQEENQYLI

Кодований геном білок за функцією належить до лігаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Robins P., Lindahl T. (1996). DNA ligase IV from HeLa cell nuclei. J. Biol. Chem. 271: 24257—24261. PMID 8798671 DOI:10.1074/jbc.271.39.24257
  • Grawunder U., Zimmer D., Fugmann S., Schwarz K., Lieber M.R. (1998). DNA ligase IV is essential for V(D)J recombination and DNA double-strand break repair in human precursor lymphocytes. Mol. Cell. 2: 477—484. PMID 9809069 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80147-1
  • Critchlow S.E., Bowater R.P., Jackson S.P. (1997). Mammalian DNA double-strand break repair protein XRCC4 interacts with DNA ligase IV. Curr. Biol. 7: 588—598. PMID 9259561 DOI:10.1016/S0960-9822(06)00258-2
  • Chen L., Trujillo K., Sung P., Tomkinson A.E. (2000). Interactions of the DNA ligase IV-XRCC4 complex with DNA ends and the DNA-dependent protein kinase. J. Biol. Chem. 275: 26196—26205. PMID 10854421 DOI:10.1074/jbc.M000491200
  • Calsou P., Delteil C., Frit P., Drouet J., Salles B. (2003). Coordinated assembly of Ku and p460 subunits of the DNA-dependent protein kinase on DNA ends is necessary for XRCC4-ligase IV recruitment. J. Mol. Biol. 326: 93—103. PMID 12547193 DOI:10.1016/S0022-2836(02)01328-1

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з LIG4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6601 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

LIG4 angl DNA ligase 4 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 13 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 911 aminokislot a molekulyarna masa 103 971 LIG4Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1IK9 2E2W 3II6 3VNN 3W1B 3W1G 3W5O 4HTO 4HTPIdentifikatoriSimvoliLIG4 LIG4S DNA ligase 4Zovnishni ID OMIM 601837 MGI 1335098 HomoloGene 1736 GeneCards LIG4Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaDNA ligase IV deficiency Ontologiya genaMolekulyarna funkciya nucleotide binding zv yazuvannya z ionom metalu protein C terminus binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding ATP binding DNA ligase ATP activity ligase activity DNA binding DNA ligase activityKlitinna komponenta nukleoplazma DNA ligase IV complex nonhomologous end joining complex condensed chromosome klitinne yadro DNA dependent protein kinase DNA ligase 4 complex citoplazma cytoplasmic ribonucleoprotein granuleBiologichnij proces nucleotide excision repair DNA gap filling double strand break repair via classical nonhomologous end joining response to ionizing radiation DNA recombination lagging strand elongation DNA biosynthetic process cellular response to lithium ion single strand break repair cellular response to DNA damage stimulus podil klitini replikaciya DNK GO 1903310 positive regulation of chromosome organization establishment of integrated proviral latency klitinnij cikl response to X ray positive regulation of neurogenesis DNA ligation involved in DNA recombination DNA ligation DNA ligation involved in DNA repair somatic stem cell population maintenance GO 0051312 GO 0007083 chromosome organization T cell receptor V D J recombination neuron apoptotic process Peremikannya klasu imunoglobuliniv T cell differentiation in thymus central nervous system development immunoglobulin V D J recombination double strand break repair via nonhomologous end joining positive regulation of fibroblast proliferation in utero embryonic development proliferaciya V D J rekombinaciya pro B cell differentiation GO 0100026 Reparaciya DNK response to gamma radiation double strand break repair GO 1904089 negative regulation of neuron apoptotic process cellular response to ionizing radiationDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez3981 319583Ensembl ENSG00000174405 ENSMUSG00000049717UniProt P49917 Q8BTF7RefSeq mRNK NM 001098268 NM 002312 NM 206937 NM 001330595 NM 001352598NM 001352599 NM 001352600 NM 001352601 NM 001352602 NM 001352603 NM 001352604 NM 001379095NM 176953 NM 001377042RefSeq bilok NP 001091738 NP 001317524 NP 002303 NP 996820 NP 001339527NP 001339528 NP 001339529 NP 001339530 NP 001339531 NP 001339532 NP 001339533 NP 001366024NP 795927 NP 001363971Lokus UCSC Hr 13 108 21 108 22 MbHr 8 10 02 10 03 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAASQTSQTVASHVPFADLCSTLERIQKSKGRAEKIRHFREFLDSWRKFH DALHKNHKDVTDSFYPAMRLILPQLERERMAYGIKETMLAKLYIELLNLP RDGKDALKLLNYRTPTGTHGDAGDFAMIAYFVLKPRCLQKGSLTIQQVND LLDSIASNNSAKRKDLIKKSLLQLITQSSALEQKWLIRMIIKDLKLGVSQ QTIFSVFHNDAAELHNVTTDLEKVCRQLHDPSVGLSDISITLFSAFKPML AAIADIEHIEKDMKHQSFYIETKLDGERMQMHKDGDVYKYFSRNGYNYTD QFGASPTEGSLTPFIHNAFKADIQICILDGEMMAYNPNTQTFMQKGTKFD IKRMVEDSDLQTCYCVFDVLMVNNKKLGHETLRKRYEILSSIFTPIPGRI EIVQKTQAHTKNEVIDALNEAIDKREEGIMVKQPLSIYKPDKRGEGWLKI KPEYVSGLMDELDILIVGGYWGKGSRGGMMSHFLCAVAEKPPPGEKPSVF HTLSRVGSGCTMKELYDLGLKLAKYWKPFHRKAPPSSILCGTEKPEVYIE PCNSVIVQIKAAEIVPSDMYKTGCTLRFPRIEKIRDDKEWHECMTLDDLE QLRGKASGKLASKHLYIGGDDEPQEKKRKAAPKMKKVIGIIEHLKAPNLT NVNKISNIFEDVEFCVMSGTDSQPKPDLENRIAEFGGYIVQNPGPDTYCV IAGSENIRVKNIILSNKHDVVKPAWLLECFKTKSFVPWQPRFMIHMCPST KEHFAREYDCYGDSYFIDTDLNQLKEVFSGIKNSNEQTPEEMASLIADLE YRYSWDCSPLSMFRRHTVYLDSYAVINDLSTKNEGTRLAIKALELRFHGA KVVSCLAEGVSHVIIGEDHSRVADFKAFRRTFKRKFKILKESWVTDSIDK CELQEENQYLI A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do ligaz Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinnij cikl podil klitini poshkodzhennya DNK reparaciya DNK rekombinaciya DNK replikaciya DNK Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami ionami metaliv ionom magniyu Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Robins P Lindahl T 1996 DNA ligase IV from HeLa cell nuclei J Biol Chem 271 24257 24261 PMID 8798671 DOI 10 1074 jbc 271 39 24257 Grawunder U Zimmer D Fugmann S Schwarz K Lieber M R 1998 DNA ligase IV is essential for V D J recombination and DNA double strand break repair in human precursor lymphocytes Mol Cell 2 477 484 PMID 9809069 DOI 10 1016 S1097 2765 00 80147 1 Critchlow S E Bowater R P Jackson S P 1997 Mammalian DNA double strand break repair protein XRCC4 interacts with DNA ligase IV Curr Biol 7 588 598 PMID 9259561 DOI 10 1016 S0960 9822 06 00258 2 Chen L Trujillo K Sung P Tomkinson A E 2000 Interactions of the DNA ligase IV XRCC4 complex with DNA ends and the DNA dependent protein kinase J Biol Chem 275 26196 26205 PMID 10854421 DOI 10 1074 jbc M000491200 Calsou P Delteil C Frit P Drouet J Salles B 2003 Coordinated assembly of Ku and p460 subunits of the DNA dependent protein kinase on DNA ends is necessary for XRCC4 ligase IV recruitment J Mol Biol 326 93 103 PMID 12547193 DOI 10 1016 S0022 2836 02 01328 1PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z LIG4 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 6601 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 8 serpnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 13 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ