Люмікан (англ. Lumican) – білок, який кодується геном LUM, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 429.
Люмікан | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | LUM, LDC, SLRR2D, lumican | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 600616 MGI: 109347 HomoloGene: 37614 GeneCards: LUM | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 12: 91.1 – 91.11 Mb | Хр. 10: 97.4 – 97.41 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSLSAFTLFL | ALIGGTSGQY | YDYDFPLSIY | GQSSPNCAPE | CNCPESYPSA | ||||
MYCDELKLKS | VPMVPPGIKY | LYLRNNQIDH | IDEKAFENVT | DLQWLILDHN | ||||
LLENSKIKGR | VFSKLKQLKK | LHINHNNLTE | SVGPLPKSLE | DLQLTHNKIT | ||||
KLGSFEGLVN | LTFIHLQHNR | LKEDAVSAAF | KGLKSLEYLD | LSFNQIARLP | ||||
SGLPVSLLTL | YLDNNKISNI | PDEYFKRFNA | LQYLRLSHNE | LADSGIPGNS | ||||
FNVSSLVELD | LSYNKLKNIP | TVNENLENYY | LEVNQLEKFD | IKSFCKILGP | ||||
LSYSKIKHLR | LDGNRISETS | LPPDMYECLR | VANEVTLN |
Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Grover J., Chen X.-N., Korenberg J.R., Roughley P.J. (1995). The human lumican gene. Organization, chromosomal location, and expression in articular cartilage. J. Biol. Chem. 270: 21942—21949. PMID 7665616 DOI:10.1074/jbc.270.37.21942
- Chakravarti S., Stallings R.L., Sundar-Raj N., Cornuet P.K., Hassell J.R. (1995). Primary structure of human lumican (keratan sulfate proteoglycan) and localization of the gene (LUM) to chromosome 12q21.3-q22. Genomics. 27: 481—488. PMID 7558030 DOI:10.1006/geno.1995.1080
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Onnerfjord P., Heathfield T.F., Heinegaard D. (2004). Identification of tyrosine sulfation in extracellular leucine-rich repeat proteins using mass spectrometry. J. Biol. Chem. 279: 26—33. PMID 14551184 DOI:10.1074/jbc.M308689200
- Bunkenborg J., Pilch B.J., Podtelejnikov A.V., Wisniewski J.R. (2004). Screening for N-glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry. Proteomics. 4: 454—465. PMID 14760718 DOI:10.1002/pmic.200300556
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6724 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
Lyumikan angl Lumican bilok yakij koduyetsya genom LUM roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 12 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 338 aminokislot a molekulyarna masa 38 429 LyumikanIdentifikatoriSimvoliLUM LDC SLRR2D lumicanZovnishni ID OMIM 600616 MGI 109347 HomoloGene 37614 GeneCards LUMOntologiya genaMolekulyarna funkciya collagen binding extracellular matrix structural constituent GO 0001948 GO 0016582 protein binding extracellular matrix structural constituent conferring compression resistanceKlitinna komponenta GO 0005578 Pozaklitinna matricya fibrillar collagen trimer lysosomal lumen Golgi lumen ekzosoma mizhklitinnij prostir extracellular region collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces GO 1904578 response to organic cyclic compound aksonogeneza collagen fibril organization extracellular matrix organization positive regulation of transforming growth factor beta1 production cartilage development keratan sulfate catabolic process response to growth factor keratan sulfate biosynthetic process GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II zirDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4060 17022Ensembl ENSG00000139329 ENSMUSG00000036446UniProt P51884 P51885RefSeq mRNK NM 002345NM 008524RefSeq bilok NP 002336NP 032550Lokus UCSC Hr 12 91 1 91 11 MbHr 10 97 4 97 41 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSLSAFTLFLALIGGTSGQYYDYDFPLSIYGQSSPNCAPECNCPESYPSA MYCDELKLKSVPMVPPGIKYLYLRNNQIDHIDEKAFENVTDLQWLILDHN LLENSKIKGRVFSKLKQLKKLHINHNNLTESVGPLPKSLEDLQLTHNKIT KLGSFEGLVNLTFIHLQHNRLKEDAVSAAFKGLKSLEYLDLSFNQIARLP SGLPVSLLTLYLDNNKISNIPDEYFKRFNALQYLRLSHNELADSGIPGNS FNVSSLVELDLSYNKLKNIPTVNENLENYYLEVNQLEKFDIKSFCKILGP LSYSKIKHLRLDGNRISETSLPPDMYECLRVANEVTLN A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaGrover J Chen X N Korenberg J R Roughley P J 1995 The human lumican gene Organization chromosomal location and expression in articular cartilage J Biol Chem 270 21942 21949 PMID 7665616 DOI 10 1074 jbc 270 37 21942 Chakravarti S Stallings R L Sundar Raj N Cornuet P K Hassell J R 1995 Primary structure of human lumican keratan sulfate proteoglycan and localization of the gene LUM to chromosome 12q21 3 q22 Genomics 27 481 488 PMID 7558030 DOI 10 1006 geno 1995 1080 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Onnerfjord P Heathfield T F Heinegaard D 2004 Identification of tyrosine sulfation in extracellular leucine rich repeat proteins using mass spectrometry J Biol Chem 279 26 33 PMID 14551184 DOI 10 1074 jbc M308689200 Bunkenborg J Pilch B J Podtelejnikov A V Wisniewski J R 2004 Screening for N glycosylated proteins by liquid chromatography mass spectrometry Proteomics 4 454 465 PMID 14760718 DOI 10 1002 pmic 200300556PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 6724 angl Procitovano 30 sichnya 2017 angl Arhiv originalu za 29 grudnya 2016 Procitovano 30 sichnya 2017 Div takozhHromosoma 12 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi