CA9

CA9 (англ. Carbonic anhydrase 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 459 амінокислот, а молекулярна маса — 49 698.

CA9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HKF, 3IAI, 5FL4, 5FL5, 5FL6
Ідентифікатори
Символи	CA9, CAIX, MN, carbonic anhydrase 9
Зовнішні ІД	OMIM: 603179 MGI: 2447188 HomoloGene: 20325 GeneCards: CA9
Реагує на сполуку
sulthiame, ethoxzolamide
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • lyase activity • zinc ion binding • carbonate dehydratase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • карбоангідрази Клітинна компонента • ядерце • cell projection • клітинне ядро • мембрана • basolateral plasma membrane • microvillus membrane • integral component of membrane • клітинна мембрана Біологічний процес • response to hypoxia • bicarbonate transport • morphogenesis of an epithelium • секреція • response to testosterone • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	768	230099
Ensembl	ENSG00000107159	ENSMUSG00000028463
UniProt	Q16790	Q8VHB5
RefSeq (мРНК)	NM_001216	NM_139305
RefSeq (білок)	NP_001207	NP_647466
Локус (UCSC)	Хр. 9: 35.67 – 35.68 Mb	Хр. 4: 43.51 – 43.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPLCPSPWL		PLLIPAPAPG		LTVQLLLSLL		LLVPVHPQRL		PRMQEDSPLG
GGSSGEDDPL		GEEDLPSEED		SPREEDPPGE		EDLPGEEDLP		GEEDLPEVKP
KSEEEGSLKL		EDLPTVEAPG		DPQEPQNNAH		RDKEGDDQSH		WRYGGDPPWP
RVSPACAGRF		QSPVDIRPQL		AAFCPALRPL		ELLGFQLPPL		PELRLRNNGH
SVQLTLPPGL		EMALGPGREY		RALQLHLHWG		AAGRPGSEHT		VEGHRFPAEI
HVVHLSTAFA		RVDEALGRPG		GLAVLAAFLE		EGPEENSAYE		QLLSRLEEIA
EEGSETQVPG		LDISALLPSD		FSRYFQYEGS		LTTPPCAQGV		IWTVFNQTVM
LSAKQLHTLS		DTLWGPGDSR		LQLNFRATQP		LNGRVIEASF		PAGVDSSPRA
AEPVQLNSCL		AAGDILALVF		GLLFAVTSVA		FLVQMRRQHR		RGTKGGVSYR
PAEVAETGA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Pastorekova S., Zavadova Z., Kostal M., Babusikova O., Zavada J. (1992). A novel quasi-viral agent, MaTu, is a two-component system. Virology. 187: 620—626. PMID 1312272 DOI:10.1016/0042-6822(92)90464-Z
• Dorai T., Sawczuk I.S., Pastorek J., Wiernik P.H., Dutcher J.P. (2005). The role of carbonic anhydrase IX overexpression in kidney cancer. Eur. J. Cancer. 41: 2935—2947. PMID 16310354 DOI:10.1016/j.ejca.2005.09.011

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Carbonic anhydrase 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1383 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
5. (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 9