NLRP3 (англ. NLR family pyrin domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 036 амінокислот, а молекулярна маса — 118 173.
NLRP3 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | NLRP3, AGTAVPRL, AII, AVP, C1orf7, CIAS1, CLR1.1, FCAS, FCAS1, FCU, MWS, NALP3, PYPAF1, NLR family, pyrin domain containing 3, NLR family pyrin domain containing 3, DFNA34, KEFH | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 606416 MGI: 2653833 HomoloGene: 3600 GeneCards: NLRP3 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Muckle-Wells syndrome, CINCA syndrome, autosomal dominant nonsyndromic deafness 34, familial cold autoinflammatory syndrome 4 | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 247.42 – 247.45 Mb | Хр. 11: 59.43 – 59.46 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKMASTRCKL | ARYLEDLEDV | DLKKFKMHLE | DYPPQKGCIP | LPRGQTEKAD | ||||
HVDLATLMID | FNGEEKAWAM | AVWIFAAINR | RDLYEKAKRD | EPKWGSDNAR | ||||
VSNPTVICQE | DSIEEEWMGL | LEYLSRISIC | KMKKDYRKKY | RKYVRSRFQC | ||||
IEDRNARLGE | SVSLNKRYTR | LRLIKEHRSQ | QEREQELLAI | GKTKTCESPV | ||||
SPIKMELLFD | PDDEHSEPVH | TVVFQGAAGI | GKTILARKMM | LDWASGTLYQ | ||||
DRFDYLFYIH | CREVSLVTQR | SLGDLIMSCC | PDPNPPIHKI | VRKPSRILFL | ||||
MDGFDELQGA | FDEHIGPLCT | DWQKAERGDI | LLSSLIRKKL | LPEASLLITT | ||||
RPVALEKLQH | LLDHPRHVEI | LGFSEAKRKE | YFFKYFSDEA | QARAAFSLIQ | ||||
ENEVLFTMCF | IPLVCWIVCT | GLKQQMESGK | SLAQTSKTTT | AVYVFFLSSL | ||||
LQPRGGSQEH | GLCAHLWGLC | SLAADGIWNQ | KILFEESDLR | NHGLQKADVS | ||||
AFLRMNLFQK | EVDCEKFYSF | IHMTFQEFFA | AMYYLLEEEK | EGRTNVPGSR | ||||
LKLPSRDVTV | LLENYGKFEK | GYLIFVVRFL | FGLVNQERTS | YLEKKLSCKI | ||||
SQQIRLELLK | WIEVKAKAKK | LQIQPSQLEL | FYCLYEMQEE | DFVQRAMDYF | ||||
PKIEINLSTR | MDHMVSSFCI | ENCHRVESLS | LGFLHNMPKE | EEEEEKEGRH | ||||
LDMVQCVLPS | SSHAACSHGL | VNSHLTSSFC | RGLFSVLSTS | QSLTELDLSD | ||||
NSLGDPGMRV | LCETLQHPGC | NIRRLWLGRC | GLSHECCFDI | SLVLSSNQKL | ||||
VELDLSDNAL | GDFGIRLLCV | GLKHLLCNLK | KLWLVSCCLT | SACCQDLASV | ||||
LSTSHSLTRL | YVGENALGDS | GVAILCEKAK | NPQCNLQKLG | LVNSGLTSVC | ||||
CSALSSVLST | NQNLTHLYLR | GNTLGDKGIK | LLCEGLLHPD | CKLQVLELDN | ||||
CNLTSHCCWD | LSTLLTSSQS | LRKLSLGNND | LGDLGVMMFC | EVLKQQSCLL | ||||
QNLGLSEMYF | NYETKSALET | LQEEKPELTV | VFEPSW |
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.
Література
- Hoffman H.M., Mueller J.L., Broide D.H., Wanderer A.A., Kolodner R.D. (2001). Mutation of a new gene encoding a putative pyrin-like protein causes familial cold autoinflammatory syndrome and Muckle-Wells syndrome. Nat. Genet. 29: 301—305. PMID 11687797 DOI:10.1038/ng756
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- O'Connor W. Jr., Harton J.A., Zhu X., Linhoff M.W., Ting J.-P. (2003). CIAS1/cryopyrin/PYPAF1/NALP3/CATERPILLER 1.1 is an inducible inflammatory mediator with NF-kappa B suppressive properties. J. Immunol. 171: 6329—6333. PMID 14662828 DOI:10.4049/jimmunol.171.12.6329
- Haneklaus M., O'Neill L.A., Coll R.C. (2013). Modulatory mechanisms controlling the NLRP3 inflammasome in inflammation: recent developments. Curr. Opin. Immunol. 25: 40—45. PMID 23305783 DOI:10.1016/j.coi.2012.12.004
- Lu A., Wu H. (2015). Structural mechanisms of inflammasome assembly. FEBS J. 282: 435—444. PMID 25354325 DOI:10.1111/febs.13133
- Bae J.Y., Park H.H. (2011). Crystal structure of NALP3 protein pyrin domain (PYD) and its implications in inflammasome assembly. J. Biol. Chem. 286: 39528—39536. PMID 21880711 DOI:10.1074/jbc.M111.278812
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з NLRP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 22 червня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 3 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NLRP3 angl NLR family pyrin domain containing 3 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 036 aminokislot a molekulyarna masa 118 173 NLRP3Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB3QF2 2NAQIdentifikatoriSimvoliNLRP3 AGTAVPRL AII AVP C1orf7 CIAS1 CLR1 1 FCAS FCAS1 FCU MWS NALP3 PYPAF1 NLR family pyrin domain containing 3 NLR family pyrin domain containing 3 DFNA34 KEFHZovnishni ID OMIM 606416 MGI 2653833 HomoloGene 3600 GeneCards NLRP3Pov yazani genetichni zahvoryuvannyaMuckle Wells syndrome CINCA syndrome autosomal dominant nonsyndromic deafness 34 familial cold autoinflammatory syndrome 4 Ontologiya genaMolekulyarna funkciya sequence specific DNA binding nucleotide binding transcription factor binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding peptidoglycan binding ATP binding identical protein bindingKlitinna komponenta citoplazma gialoplazma extracellular region endoplazmatichnij retikulum inflammasome complex klitinne yadro NLRP3 inflammasome complex Golgi membrane kompleks Goldzhi membranaBiologichnij proces defense response detection of biotic stimulus NLRP3 inflammasome complex assembly GO 0009373 regulation of transcription DNA templated negative regulation of acute inflammatory response positive regulation of interleukin 5 production interleukin 18 production proces imunnoyi sistemi positive regulation of interleukin 4 production transcription DNA templated positive regulation of cysteine type endopeptidase activity involved in apoptotic process positive regulation of interleukin 13 production positive regulation of T helper 17 cell differentiation defense response to virus protein complex oligomerization positive regulation of T helper 2 cell differentiation regulation of inflammatory response interleukin 1 beta production positive regulation of type 2 immune response inflammatory response negative regulation of NF kappaB transcription factor activity activation of cysteine type endopeptidase activity involved in apoptotic process negative regulation of inflammatory response cellular response to lipopolysaccharide positive regulation of T helper 2 cell cytokine production GO 0072468 signalna transdukciya GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0097285 apoptoz vrodzhenij imunitet protein deubiquitination GO 0051637 defense response to Gram positive bacterium positive regulation of NF kappaB transcription factor activity cellular response to peptidoglycan negative regulation of NIK NF kappaB signalingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez114548 216799Ensembl ENSG00000162711 ENSMUSG00000032691UniProt Q96P20 Q8R4B8RefSeq mRNK NM 001079821 NM 001127461 NM 001127462 NM 001243133 NM 004895NM 183395NM 145827 NM 001359638RefSeq bilok NP 001073289 NP 001120933 NP 001120934 NP 001230062 NP 004886NP 899632NP 665826 NP 001346567Lokus UCSC Hr 1 247 42 247 45 MbHr 11 59 43 59 46 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKMASTRCKLARYLEDLEDVDLKKFKMHLEDYPPQKGCIPLPRGQTEKAD HVDLATLMIDFNGEEKAWAMAVWIFAAINRRDLYEKAKRDEPKWGSDNAR VSNPTVICQEDSIEEEWMGLLEYLSRISICKMKKDYRKKYRKYVRSRFQC IEDRNARLGESVSLNKRYTRLRLIKEHRSQQEREQELLAIGKTKTCESPV SPIKMELLFDPDDEHSEPVHTVVFQGAAGIGKTILARKMMLDWASGTLYQ DRFDYLFYIHCREVSLVTQRSLGDLIMSCCPDPNPPIHKIVRKPSRILFL MDGFDELQGAFDEHIGPLCTDWQKAERGDILLSSLIRKKLLPEASLLITT RPVALEKLQHLLDHPRHVEILGFSEAKRKEYFFKYFSDEAQARAAFSLIQ ENEVLFTMCFIPLVCWIVCTGLKQQMESGKSLAQTSKTTTAVYVFFLSSL LQPRGGSQEHGLCAHLWGLCSLAADGIWNQKILFEESDLRNHGLQKADVS AFLRMNLFQKEVDCEKFYSFIHMTFQEFFAAMYYLLEEEKEGRTNVPGSR LKLPSRDVTVLLENYGKFEKGYLIFVVRFLFGLVNQERTSYLEKKLSCKI SQQIRLELLKWIEVKAKAKKLQIQPSQLELFYCLYEMQEEDFVQRAMDYF PKIEINLSTRMDHMVSSFCIENCHRVESLSLGFLHNMPKEEEEEEKEGRH LDMVQCVLPSSSHAACSHGLVNSHLTSSFCRGLFSVLSTSQSLTELDLSD NSLGDPGMRVLCETLQHPGCNIRRLWLGRCGLSHECCFDISLVLSSNQKL VELDLSDNALGDFGIRLLCVGLKHLLCNLKKLWLVSCCLTSACCQDLASV LSTSHSLTRLYVGENALGDSGVAILCEKAKNPQCNLQKLGLVNSGLTSVC CSALSSVLSTNQNLTHLYLRGNTLGDKGIKLLCEGLLHPDCKLQVLELDN CNLTSHCCWDLSTLLTSSQSLRKLSLGNNDLGDLGVMMFCEVLKQQSCLL QNLGLSEMYFNYETKSALETLQEEKPELTVVFEPSW A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do aktivatoriv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak imunitet vrodzhenij imunitet transkripciya regulyaciya transkripciyi zapalna vidpovid Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ATF nukleotidami Lokalizovanij u citoplazmi yadri endoplazmatichnomu retikulumi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaHoffman H M Mueller J L Broide D H Wanderer A A Kolodner R D 2001 Mutation of a new gene encoding a putative pyrin like protein causes familial cold autoinflammatory syndrome and Muckle Wells syndrome Nat Genet 29 301 305 PMID 11687797 DOI 10 1038 ng756 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 O Connor W Jr Harton J A Zhu X Linhoff M W Ting J P 2003 CIAS1 cryopyrin PYPAF1 NALP3 CATERPILLER 1 1 is an inducible inflammatory mediator with NF kappa B suppressive properties J Immunol 171 6329 6333 PMID 14662828 DOI 10 4049 jimmunol 171 12 6329 Haneklaus M O Neill L A Coll R C 2013 Modulatory mechanisms controlling the NLRP3 inflammasome in inflammation recent developments Curr Opin Immunol 25 40 45 PMID 23305783 DOI 10 1016 j coi 2012 12 004 Lu A Wu H 2015 Structural mechanisms of inflammasome assembly FEBS J 282 435 444 PMID 25354325 DOI 10 1111 febs 13133 Bae J Y Park H H 2011 Crystal structure of NALP3 protein pyrin domain PYD and its implications in inflammasome assembly J Biol Chem 286 39528 39536 PMID 21880711 DOI 10 1074 jbc M111 278812PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z NLRP3 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 22 chervnya 2016 Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 3 serpnya 2017 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi