TET1 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 136 амінокислот, а молекулярна маса — 235 309.
TET1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TET1, CXXC6, LCX, bA119F7.1, MLL-TET1-MLL, Tet methylcytosine dioxygenase 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 607790 MGI: 1098693 HomoloGene: 12735 GeneCards: TET1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 10: 68.56 – 68.69 Mb | Хр. 10: 62.64 – 62.74 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSRSRHARPS | RLVRKEDVNK | KKKNSQLRKT | TKGANKNVAS | VKTLSPGKLK | ||||
QLIQERDVKK | KTEPKPPVPV | RSLLTRAGAA | RMNLDRTEVL | FQNPESLTCN | ||||
GFTMALRSTS | LSRRLSQPPL | VVAKSKKVPL | SKGLEKQHDC | DYKILPALGV | ||||
KHSENDSVPM | QDTQVLPDIE | TLIGVQNPSL | LKGKSQETTQ | FWSQRVEDSK | ||||
INIPTHSGPA | AEILPGPLEG | TRCGEGLFSE | ETLNDTSGSP | KMFAQDTVCA | ||||
PFPQRATPKV | TSQGNPSIQL | EELGSRVESL | KLSDSYLDPI | KSEHDCYPTS | ||||
SLNKVIPDLN | LRNCLALGGS | TSPTSVIKFL | LAGSKQATLG | AKPDHQEAFE | ||||
ATANQQEVSD | TTSFLGQAFG | AIPHQWELPG | ADPVHGEALG | ETPDLPEIPG | ||||
AIPVQGEVFG | TILDQQETLG | MSGSVVPDLP | VFLPVPPNPI | ATFNAPSKWP | ||||
EPQSTVSYGL | AVQGAIQILP | LGSGHTPQSS | SNSEKNSLPP | VMAISNVENE | ||||
KQVHISFLPA | NTQGFPLAPE | RGLFHASLGI | AQLSQAGPSK | SDRGSSQVSV | ||||
TSTVHVVNTT | VVTMPVPMVS | TSSSSYTTLL | PTLEKKKRKR | CGVCEPCQQK | ||||
TNCGECTYCK | NRKNSHQICK | KRKCEELKKK | PSVVVPLEVI | KENKRPQREK | ||||
KPKVLKADFD | NKPVNGPKSE | SMDYSRCGHG | EEQKLELNPH | TVENVTKNED | ||||
SMTGIEVEKW | TQNKKSQLTD | HVKGDFSANV | PEAEKSKNSE | VDKKRTKSPK | ||||
LFVQTVRNGI | KHVHCLPAET | NVSFKKFNIE | EFGKTLENNS | YKFLKDTANH | ||||
KNAMSSVATD | MSCDHLKGRS | NVLVFQQPGF | NCSSIPHSSH | SIINHHASIH | ||||
NEGDQPKTPE | NIPSKEPKDG | SPVQPSLLSL | MKDRRLTLEQ | VVAIEALTQL | ||||
SEAPSENSSP | SKSEKDEESE | QRTASLLNSC | KAILYTVRKD | LQDPNLQGEP | ||||
PKLNHCPSLE | KQSSCNTVVF | NGQTTTLSNS | HINSATNQAS | TKSHEYSKVT | ||||
NSLSLFIPKS | NSSKIDTNKS | IAQGIITLDN | CSNDLHQLPP | RNNEVEYCNQ | ||||
LLDSSKKLDS | DDLSCQDATH | TQIEEDVATQ | LTQLASIIKI | NYIKPEDKKV | ||||
ESTPTSLVTC | NVQQKYNQEK | GTIQQKPPSS | VHNNHGSSLT | KQKNPTQKKT | ||||
KSTPSRDRRK | KKPTVVSYQE | NDRQKWEKLS | YMYGTICDIW | IASKFQNFGQ | ||||
FCPHDFPTVF | GKISSSTKIW | KPLAQTRSIM | QPKTVFPPLT | QIKLQRYPES | ||||
AEEKVKVEPL | DSLSLFHLKT | ESNGKAFTDK | AYNSQVQLTV | NANQKAHPLT | ||||
QPSSPPNQCA | NVMAGDDQIR | FQQVVKEQLM | HQRLPTLPGI | SHETPLPESA | ||||
LTLRNVNVVC | SGGITVVSTK | SEEEVCSSSF | GTSEFSTVDS | AQKNFNDYAM | ||||
NFFTNPTKNL | VSITKDSELP | TCSCLDRVIQ | KDKGPYYTHL | GAGPSVAAVR | ||||
EIMENRYGQK | GNAIRIEIVV | YTGKEGKSSH | GCPIAKWVLR | RSSDEEKVLC | ||||
LVRQRTGHHC | PTAVMVVLIM | VWDGIPLPMA | DRLYTELTEN | LKSYNGHPTD | ||||
RRCTLNENRT | CTCQGIDPET | CGASFSFGCS | WSMYFNGCKF | GRSPSPRRFR | ||||
IDPSSPLHEK | NLEDNLQSLA | TRLAPIYKQY | APVAYQNQVE | YENVARECRL | ||||
GSKEGRPFSG | VTACLDFCAH | PHRDIHNMNN | GSTVVCTLTR | EDNRSLGVIP | ||||
QDEQLHVLPL | YKLSDTDEFG | SKEGMEAKIK | SGAIEVLAPR | RKKRTCFTQP | ||||
VPRSGKKRAA | MMTEVLAHKI | RAVEKKPIPR | IKRKNNSTTT | NNSKPSSLPT | ||||
LGSNTETVQP | EVKSETEPHF | ILKSSDNTKT | YSLMPSAPHP | VKEASPGFSW | ||||
SPKTASATPA | PLKNDATASC | GFSERSSTPH | CTMPSGRLSG | ANAAAADGPG | ||||
ISQLGEVAPL | PTLSAPVMEP | LINSEPSTGV | TEPLTPHQPN | HQPSFLTSPQ | ||||
DLASSPMEED | EQHSEADEPP | SDEPLSDDPL | SPAEEKLPHI | DEYWSDSEHI | ||||
FLDANIGGVA | IAPAHGSVLI | ECARRELHAT | TPVEHPNRNH | PTRLSLVFYQ | ||||
HKNLNKPQHG | FELNKIKFEA | KEAKNKKMKA | SEQKDQAANE | GPEQSSEVNE | ||||
LNQIPSHKAL | TLTHDNVVTV | SPYALTHVAG | PYNHWV |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, репресорів, активаторів, , фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kriaucionis S., Heintz N. (2009). The nuclear DNA base 5-hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain. Science. 324: 929—930. PMID 19372393 DOI:10.1126/science.1169786
- Guo J.U., Su Y., Zhong C., Ming G.L., Song H. (2011). Hydroxylation of 5-methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain. Cell. 145: 423—434. PMID 21496894 DOI:10.1016/j.cell.2011.03.022
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29484 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до . |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TET1 angl Tet methylcytosine dioxygenase 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 10 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 2 136 aminokislot a molekulyarna masa 235 309 TET1IdentifikatoriSimvoliTET1 CXXC6 LCX bA119F7 1 MLL TET1 MLL Tet methylcytosine dioxygenase 1Zovnishni ID OMIM 607790 MGI 1098693 HomoloGene 12735 GeneCards TET1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya iron ion binding zinc ion binding methylcytosine dioxygenase activity dioxygenase activity zv yazuvannya z ionom metalu oxidoreductase activity DNA binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated positive regulation of histone methylation protein O linked glycosylation negative regulation of DNA methylation dependent heterochromatin assembly transcription DNA templated stem cell population maintenance inner cell mass cell differentiation positive regulation of cell population proliferation DNA demethylation GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II GO 0031497 GO 0006336 GO 0034724 GO 0001301 GO 0007580 GO 0034652 GO 0010847 chromatin organization 5 methylcytosine catabolic process oxidative demethylationDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez80312 52463Ensembl ENSG00000138336 ENSMUSG00000047146UniProt Q8NFU7 Q3URK3RefSeq mRNK NM 030625NM 001253857 NM 027384RefSeq bilok NP 085128NP 001240786 NP 001393310 NP 001393311 NP 001393312Lokus UCSC Hr 10 68 56 68 69 MbHr 10 62 64 62 74 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSRSRHARPSRLVRKEDVNKKKKNSQLRKTTKGANKNVASVKTLSPGKLK QLIQERDVKKKTEPKPPVPVRSLLTRAGAARMNLDRTEVLFQNPESLTCN GFTMALRSTSLSRRLSQPPLVVAKSKKVPLSKGLEKQHDCDYKILPALGV KHSENDSVPMQDTQVLPDIETLIGVQNPSLLKGKSQETTQFWSQRVEDSK INIPTHSGPAAEILPGPLEGTRCGEGLFSEETLNDTSGSPKMFAQDTVCA PFPQRATPKVTSQGNPSIQLEELGSRVESLKLSDSYLDPIKSEHDCYPTS SLNKVIPDLNLRNCLALGGSTSPTSVIKFLLAGSKQATLGAKPDHQEAFE ATANQQEVSDTTSFLGQAFGAIPHQWELPGADPVHGEALGETPDLPEIPG AIPVQGEVFGTILDQQETLGMSGSVVPDLPVFLPVPPNPIATFNAPSKWP EPQSTVSYGLAVQGAIQILPLGSGHTPQSSSNSEKNSLPPVMAISNVENE KQVHISFLPANTQGFPLAPERGLFHASLGIAQLSQAGPSKSDRGSSQVSV TSTVHVVNTTVVTMPVPMVSTSSSSYTTLLPTLEKKKRKRCGVCEPCQQK TNCGECTYCKNRKNSHQICKKRKCEELKKKPSVVVPLEVIKENKRPQREK KPKVLKADFDNKPVNGPKSESMDYSRCGHGEEQKLELNPHTVENVTKNED SMTGIEVEKWTQNKKSQLTDHVKGDFSANVPEAEKSKNSEVDKKRTKSPK LFVQTVRNGIKHVHCLPAETNVSFKKFNIEEFGKTLENNSYKFLKDTANH KNAMSSVATDMSCDHLKGRSNVLVFQQPGFNCSSIPHSSHSIINHHASIH NEGDQPKTPENIPSKEPKDGSPVQPSLLSLMKDRRLTLEQVVAIEALTQL SEAPSENSSPSKSEKDEESEQRTASLLNSCKAILYTVRKDLQDPNLQGEP PKLNHCPSLEKQSSCNTVVFNGQTTTLSNSHINSATNQASTKSHEYSKVT NSLSLFIPKSNSSKIDTNKSIAQGIITLDNCSNDLHQLPPRNNEVEYCNQ LLDSSKKLDSDDLSCQDATHTQIEEDVATQLTQLASIIKINYIKPEDKKV ESTPTSLVTCNVQQKYNQEKGTIQQKPPSSVHNNHGSSLTKQKNPTQKKT KSTPSRDRRKKKPTVVSYQENDRQKWEKLSYMYGTICDIWIASKFQNFGQ FCPHDFPTVFGKISSSTKIWKPLAQTRSIMQPKTVFPPLTQIKLQRYPES AEEKVKVEPLDSLSLFHLKTESNGKAFTDKAYNSQVQLTVNANQKAHPLT QPSSPPNQCANVMAGDDQIRFQQVVKEQLMHQRLPTLPGISHETPLPESA LTLRNVNVVCSGGITVVSTKSEEEVCSSSFGTSEFSTVDSAQKNFNDYAM NFFTNPTKNLVSITKDSELPTCSCLDRVIQKDKGPYYTHLGAGPSVAAVR EIMENRYGQKGNAIRIEIVVYTGKEGKSSHGCPIAKWVLRRSSDEEKVLC LVRQRTGHHCPTAVMVVLIMVWDGIPLPMADRLYTELTENLKSYNGHPTD RRCTLNENRTCTCQGIDPETCGASFSFGCSWSMYFNGCKFGRSPSPRRFR IDPSSPLHEKNLEDNLQSLATRLAPIYKQYAPVAYQNQVEYENVARECRL GSKEGRPFSGVTACLDFCAHPHRDIHNMNNGSTVVCTLTREDNRSLGVIP QDEQLHVLPLYKLSDTDEFGSKEGMEAKIKSGAIEVLAPRRKKRTCFTQP VPRSGKKRAAMMTEVLAHKIRAVEKKPIPRIKRKNNSTTTNNSKPSSLPT LGSNTETVQPEVKSETEPHFILKSSDNTKTYSLMPSAPHPVKEASPGFSW SPKTASATPAPLKNDATASCGFSERSSTPHCTMPSGRLSGANAAAADGPG ISQLGEVAPLPTLSAPVMEPLINSEPSTGVTEPLTPHQPNHQPSFLTSPQ DLASSPMEEDEQHSEADEPPSDEPLSDDPLSPAEEKLPHIDEYWSDSEHI FLDANIGGVAIAPAHGSVLIECARRELHATTPVEHPNRNHPTRLSLVFYQ HKNLNKPQHGFELNKIKFEAKEAKNKKMKASEQKDQAANEGPEQSSEVNE LNQIPSHKALTLTHDNVVTVSPYALTHVAGPYNHWV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do oksidoreduktaz represoriv aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku ionom zaliza DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kriaucionis S Heintz N 2009 The nuclear DNA base 5 hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain Science 324 929 930 PMID 19372393 DOI 10 1126 science 1169786 Guo J U Su Y Zhong C Ming G L Song H 2011 Hydroxylation of 5 methylcytosine by TET1 promotes active DNA demethylation in the adult brain Cell 145 423 434 PMID 21496894 DOI 10 1016 j cell 2011 03 022PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 29484 angl Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 29 veresnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 10 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi Na cyu stattyu ne posilayutsya inshi statti Vikipediyi Bud laska rozstavte posilannya vidpovidno do prijnyatih rekomendacij