Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
NCALD (англ. Neurocalcin delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 193 амінокислот, а молекулярна маса — 22 245.
| NCALD | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
| Ідентифікатори | |||||||||||||||||
| Символи | NCALD, neurocalcin delta | ||||||||||||||||
| Зовнішні ІД | OMIM: 606722 MGI: 1196326 HomoloGene: 49978 GeneCards: NCALD | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| Ортологи | |||||||||||||||||
| Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
| Entrez |
|
| |||||||||||||||
| Ensembl |
|
| |||||||||||||||
| UniProt |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
| RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
| Локус (UCSC) | Хр. 8: 101.69 – 102.12 Mb | Хр. 15: 37.37 – 37.79 Mb | |||||||||||||||
| PubMed search | |||||||||||||||||
| Вікідані | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MGKQNSKLRP | EVMQDLLEST | DFTEHEIQEW | YKGFLRDCPS | GHLSMEEFKK | ||||
| IYGNFFPYGD | ASKFAEHVFR | TFDANGDGTI | DFREFIIALS | VTSRGKLEQK | ||||
| LKWAFSMYDL | DGNGYISKAE | MLEIVQAIYK | MVSSVMKMPE | DESTPEKRTE | ||||
| KIFRQMDTNR | DGKLSLEEFI | RGAKSDPSIV | RLLQCDPSSA | GQF |
Кодований геном білок за функцією належить до ліпопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.
Білок нейрокальцин-дельта належить до великої родини нейронних кальцієвих сенсорів. Білок має сайти для зв'язування з іонами кальцію. Молекула нейрокальцину має гідрофобний N-міристоїловий домен, який при зв'язуванні іону кальцію переміщується на її поверхню. Цей домен вбудовується в клітинну мембрану, дозволяючи білку переходити з цитоплазми до мембрани. Найвищий рівень експреспресії в тканинах мозку [1]. Існують дані, що нейрокальцин взаємодіє з клатрином, актином і тубуліном, і можливо бере участь в контролі клатрин-залежного ендоцитозу.
Клонування та експресія
Ген був клонований з бібліотеки кДНК. Повний ген кДНК довжиною 32,295 п.н. містить 1 відкриту рамку зчитування 3 149 по 730 нуклеотиди. Така послідовність може кодувати білок довжиною 194 амінокислотні залишки. Послідовність містить ATG старт-кодон (AGGATGG) (Консенсусна послідовність Козак (A/GXXATGG)). Три можливі сайти поліаденілювання знайдені на кінці 3' UTR. NCALD містить 6 екзонів .У людини ген розтошований в 8q22.3 локусі 8-ї хромосоми. Існує декілька (30) варіантів альтернативного сплайсингу гену. Ген має 89 ортологів, 13 парологів і ассоційований з 9-ма фенотипами [2].
Високий рівень експрессії NCALD в нейронах спинного та кори головного мозку, у містях росту аксону, пресинаптичних терміналях нейромязових контактів.
Функції гена
NCALD — консервативний білок, відіграє важливу роль у регуляції процесів передачі сигналу нейронів.
Встановлено, нокдаун гену за допомогою siRNA у клітинах нейронів викликає диференціюваю моторних нейронів та спричиняє рост відростувв нейрону. На відміну від цього, надмірна експресія NCALD порушує цей процес. Було встановлено, що NCALD зв'язував клатрин лише при низьких рівнях кальцію. Фібробласти, отримані від пацієнтів з м'язовою атрофією спинного мозку та клітинами, отриманими на тваринних моделях SMA, показали сильно знижений ендоцитоз, можливо, через знижений кальцій, який можна було б моделювати за рахунок нокдауну NCALD. Висновки показали, що низький рівень NCALD, який іноді спостерігається у безсимптомних пацієнтів з СМА, може дозволити вільному клатрину діяти брати участь в ендоцитозі навіть при низьких рівнях кальцію [3].
NCALD є кальційзалежним негативним регулятором ендоцитозу. Точковий поліморфізм 3' UTR сайта зустрічається при диабеті другого типу, можливо зумовлює схильність до діабетична нефропатія.
Література
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7655 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- UniProt, P61601 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
- Ivings, Lenka; Pennington, Stephen R.; Jenkins, Roz; Weiss, Jamie L.; Burgoyne, Robert D. (1 травня 2002). Identification of Ca2+-dependent binding partners for the neuronal calcium sensor protein neurocalcin δ: interaction with actin, clathrin and tubulin. Biochemical Journal (англ.). Т. 363, № 3. с. 599—608. doi:10.1042/0264-6021:3630599. ISSN 0264-6021. PMID 11964161. Процитовано 23 січня 2018.
- Wang, W.; Zhou, Z.; Zhao, W.; Huang, Y.; Tang, R.; Ying, K.; Xie, Y.; Mao, Y. (19 березня 2001). Molecular cloning, mapping and characterization of the human neurocalcin delta gene (NCALD). Biochimica Et Biophysica Acta. Т. 1518, № 1-2. с. 162—167. ISSN 0006-3002. PMID 11267673. Процитовано 24 січня 2018.
- Riessland, Markus; Kaczmarek, Anna; Schneider, Svenja; Swoboda, Kathryn J.; Löhr, Heiko; Bradler, Cathleen; Grysko, Vanessa; Dimitriadi, Maria; Hosseinibarkooie, Seyyedmohsen. Neurocalcin Delta Suppression Protects against Spinal Muscular Atrophy in Humans and across Species by Restoring Impaired Endocytosis. The American Journal of Human Genetics. Т. 100, № 2. с. 297—315. doi:10.1016/j.ajhg.2017.01.005. Процитовано 23 січня 2018.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
NCALD angl Neurocalcin delta bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na 8 j hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 193 aminokislot a molekulyarna masa 22 245 NCALDNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1BJFIdentifikatoriSimvoliNCALD neurocalcin deltaZovnishni ID OMIM 606722 MGI 1196326 HomoloGene 49978 GeneCards NCALDOntologiya genaMolekulyarna funkciya tubulin binding clathrin binding calcium ion binding actin binding alpha tubulin binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding zv yazuvannya z ionom metalu ligand gated ion channel activityKlitinna komponenta gialoplazma vnutrishnoklitinnij clathrin coat of trans Golgi network vesicleBiologichnij proces vesicle mediated transport calcium mediated signaling regulation of systemic arterial blood pressure ion transmembrane transportDzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez83988 52589Ensembl ENSG00000104490 ENSMUSG00000051359UniProt P61601 Q91X97RefSeq mRNK NM 001040624 NM 001040625 NM 001040626 NM 001040627 NM 001040628NM 001040629 NM 001040630 NM 032041NM 001170866 NM 001170867 NM 001170868 NM 134094 NM 001359839NM 001359840 NM 001359841 NM 001359842 NM 001359843 NM 001359844 NM 001359845RefSeq bilok NP 001035714 NP 001035715 NP 001035716 NP 001035717 NP 001035718NP 001035719 NP 001035720 NP 114430NP 001164337 NP 001164338 NP 001164339 NP 598855 NP 001346768NP 001346769 NP 001346770 NP 001346771 NP 001346772 NP 001346773 NP 001346774Lokus UCSC Hr 8 101 69 102 12 MbHr 15 37 37 37 79 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MGKQNSKLRPEVMQDLLESTDFTEHEIQEWYKGFLRDCPSGHLSMEEFKK IYGNFFPYGDASKFAEHVFRTFDANGDGTIDFREFIIALSVTSRGKLEQK LKWAFSMYDLDGNGYISKAEMLEIVQAIYKMVSSVMKMPEDESTPEKRTE KIFRQMDTNRDGKLSLEEFIRGAKSDPSIVRLLQCDPSSAGQF A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do lipoproteyiniv Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom kalciyu Bilok nejrokalcin delta nalezhit do velikoyi rodini nejronnih kalciyevih sensoriv Bilok maye sajti dlya zv yazuvannya z ionami kalciyu Molekula nejrokalcinu maye gidrofobnij N miristoyilovij domen yakij pri zv yazuvanni ionu kalciyu peremishuyetsya na yiyi poverhnyu Cej domen vbudovuyetsya v klitinnu membranu dozvolyayuchi bilku perehoditi z citoplazmi do membrani Najvishij riven eksprespresiyi v tkaninah mozku 1 Isnuyut dani sho nejrokalcin vzayemodiye z klatrinom aktinom i tubulinom i mozhlivo bere uchast v kontroli klatrin zalezhnogo endocitozu Klonuvannya ta ekspresiya Gen buv klonovanij z biblioteki kDNK Povnij gen kDNK dovzhinoyu 32 295 p n mistit 1 vidkritu ramku zchituvannya 3 149 po 730 nukleotidi Taka poslidovnist mozhe koduvati bilok dovzhinoyu 194 aminokislotni zalishki Poslidovnist mistit ATG start kodon AGGATGG Konsensusna poslidovnist Kozak A GXXATGG Tri mozhlivi sajti poliadenilyuvannya znajdeni na kinci 3 UTR NCALD mistit 6 ekzoniv U lyudini gen roztoshovanij v 8q22 3 lokusi 8 yi hromosomi Isnuye dekilka 30 variantiv alternativnogo splajsingu genu Gen maye 89 ortologiv 13 parologiv i associjovanij z 9 ma fenotipami 2 Visokij riven ekspressiyi NCALD v nejronah spinnogo ta kori golovnogo mozku u mistyah rostu aksonu presinaptichnih terminalyah nejromyazovih kontaktiv Funkciyi gena NCALD konservativnij bilok vidigraye vazhlivu rol u regulyaciyi procesiv peredachi signalu nejroniv Vstanovleno nokdaun genu za dopomogoyu siRNA u klitinah nejroniv viklikaye diferenciyuvayu motornih nejroniv ta sprichinyaye rost vidrostuvv nejronu Na vidminu vid cogo nadmirna ekspresiya NCALD porushuye cej proces Bulo vstanovleno sho NCALD zv yazuvav klatrin lishe pri nizkih rivnyah kalciyu Fibroblasti otrimani vid paciyentiv z m yazovoyu atrofiyeyu spinnogo mozku ta klitinami otrimanimi na tvarinnih modelyah SMA pokazali silno znizhenij endocitoz mozhlivo cherez znizhenij kalcij yakij mozhna bulo b modelyuvati za rahunok nokdaunu NCALD Visnovki pokazali sho nizkij riven NCALD yakij inodi sposterigayetsya u bezsimptomnih paciyentiv z SMA mozhe dozvoliti vilnomu klatrinu diyati brati uchast v endocitozi navit pri nizkih rivnyah kalciyu 3 NCALD ye kalcijzalezhnim negativnim regulyatorom endocitozu Tochkovij polimorfizm 3 UTR sajta zustrichayetsya pri diabeti drugogo tipu mozhlivo zumovlyuye shilnist do diabetichna nefropatiya LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 7655 angl Procitovano 19 veresnya 2017 UniProt P61601 angl Procitovano 19 veresnya 2017 Ivings Lenka Pennington Stephen R Jenkins Roz Weiss Jamie L Burgoyne Robert D 1 travnya 2002 Identification of Ca2 dependent binding partners for the neuronal calcium sensor protein neurocalcin d interaction with actin clathrin and tubulin Biochemical Journal angl T 363 3 s 599 608 doi 10 1042 0264 6021 3630599 ISSN 0264 6021 PMID 11964161 Procitovano 23 sichnya 2018 Wang W Zhou Z Zhao W Huang Y Tang R Ying K Xie Y Mao Y 19 bereznya 2001 Molecular cloning mapping and characterization of the human neurocalcin delta gene NCALD Biochimica Et Biophysica Acta T 1518 1 2 s 162 167 ISSN 0006 3002 PMID 11267673 Procitovano 24 sichnya 2018 Riessland Markus Kaczmarek Anna Schneider Svenja Swoboda Kathryn J Lohr Heiko Bradler Cathleen Grysko Vanessa Dimitriadi Maria Hosseinibarkooie Seyyedmohsen Neurocalcin Delta Suppression Protects against Spinal Muscular Atrophy in Humans and across Species by Restoring Impaired Endocytosis The American Journal of Human Genetics T 100 2 s 297 315 doi 10 1016 j ajhg 2017 01 005 Procitovano 23 sichnya 2018 Div takozhHromosoma 8 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi