Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

Хлорофлексія Біологічна класифікація Домен Бактерії Bacteria Тип Хлорофлекси Chloroflexi Клас Хлорофлексія Chloroflexia

Хлорофлексія (клас)

Хлорофлексія (клас)
Хлорофлексія
Біологічна класифікація
Домен: Бактерії (Bacteria)
—
Тип: Хлорофлекси (Chloroflexi)
Клас: Хлорофлексія (Chloroflexia)
Gupta et al. 2013
Ряди


Синоніми
Chloroflexia Castenholz 2001
Посилання
image Вікісховище: Chloroflexia
image EOL: 9152935
image ITIS: 956140
image NCBI: 32061

Хлорофлексія (Chloroflexia) — клас бактерій типу хлорофлексів (Chloroflexi), відомий як нитчасті зелені несірчані бактерії. Вони отримують енергію від світла і мають таку назву через зелений пігмент, який знаходиться у фотосинтезуючих тілах — хлоросомах .

Хлорофлексія, як правило, нитчаста і може рухатись за допомогою бактеріального ковзання . Вони факультативно аеробні, але не виробляють кисень у процесі отримання енергії від світла або фототрофії . Крім того, хлорофлексія має інший метод фототрофії (фотогетеротрофія), ніж справжні фотосинтетизуючі бактерії.

У той час як більшість бактерій, з точки зору різноманітності, є грамнегативними за виключенням Firmicutes, Actinobacteria і групи Deinococcus-Thermus. Члени типу Chloroflexi є грам позитивними.

Таксономія та молекулярні підписи

Клас Chloroflexia є групою широко розгалужених видів фотосинтезуючих бактерій (за винятком видів Herpetosiphon і Kallotenue), які в даний час складаються з трьох порядків: Chloroflexales, Herpetosiphonales і Kallotenuales . Кожен Herpetosiphonales і Kallotenuales складається з одного роду в межах власного сімейства, Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) і Kallotenuaceae (Kallotenue) в той чаз, тоді як хлорофлексали більш філогенетично різноманітні.

Порівняльний геномний аналіз недавно уточнив таксономію класу Хлорофлексія, розділивши Хлорофлекси на підряд Chloroflexineae, що складаються з сімейств Oscillachloridaceae та Chloroflexaceae, та підряд Roseiflexineae, що містять сімейство Roseiflexaceae . Переглянута систематика ґрунтувалася на виявленні ряду збережених сигнатурних індексів (ЗСІ), які є надійними молекулярними маркерами спільного походження. Додатковим аргументом щодо поділу хлорофлексалів на два підряди є спостережувані відмінності у фізіологічних характеристиках, коли кожен підряд характеризується чіткими профілями каротиноїдів, хінонів та жирних кислот, які відсутні в іншому підряді. Крім розмежування таксономічних рангів, ЗСІ можуть відігравати певну роль в унікальних характеристиках членів кладу. Зокрема, чотириаміно-кислотна вставка в білковий піруват флаводоксин / ферредоксин оксидоредуктаза, білок, який відіграє важливу роль у фотосинтетезуючих організмах, була виявлена серед усіх представників роду Chloroflexus і вважається, що вона відіграє важливу функціональну роль . Додаткова дослідження з використанням ЗСІ були проведені для розмежування філогенетичного положення хлорофлексії щодо сусідніх фотосинтетичних груп, таких як ціанобактерії. Види хлорофлексії проявляють чіткий зв'язок з видами хлоробі, їх найближчими філогенетичними родичами. Було встановлено, що ЗСІ є спільним серед членів хлорофлексії та хлоробі, що було трактовано як результат горизонтальної передачі гена між двома родичами.

Таксономія

В даний час є прийнятою така таксономія:

  • Ряд
    • Підряд
      • Родина Trüper 1976 emend. Gupta et al. 2013
        • Рід Pierson and Castenholz 1974
          • C. aggregans Hanada et al. 1995
          • C. aurantiacus Pierson and Castenholz 1974
      • Родина Keppen 2000 emend. Gupta et al. 2013
        • Рід Gorlenko and Pivovarova 1989 emend. Keppen et al. 2000
          • O. chrysea Gorlenko and Pivovarova 1989
          • O. trichoides (ex Szafer) Gorlenko and Korotkov1989 emend. Keppen et al. 2000
        • Рід Dubinina and Gorlenko 1975
          • Chloronema giganteum Dubinina and Gorlenko 1975
    • Підряд
      • Родина Gupta et al. 2013
        • Рід Hanada et al. 2002
          • Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002
        • Рід Pierson et al. 1986
          • Heliothrix oregonensis Pierson et al. 1986
  • Ряд
    • Родина
      • Рід Holt and Lewin 1968
        • H. aurantiacus Holt and Lewin 1968
        • H. geysericola (Copeland 1936) Lewin 1970

Крім того, «Kouleothrix aurantiaca» та «Dehalobium chlorocoercia» ще не були повністю описані.

Етимологія

Назва «Chloroflexi» — неолатинова множина «Chloroflexus», яка є назвою першого описаного роду. Іменник — це поєднання грецького chloros (χλωρός) означає «зеленувато-жовтий» та латинського flexus (від flecto) означає «зігнуте», що означає «зелений вигин». Назва не обумовлена хлором, елементом, відкритого у 1810 році сером Хамфрі Деві і названого так через блідо-зелений колір.

Примітки

  1. Sutcliffe, I. C. (2010). A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture. Trends in Microbiology. 18 (10): 464—470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
  2. Campbell C, Sutcliffe IC, Gupta RS (2014). Comparative proteome analysis of Acidaminococcus intestini supports a relationship between outer membrane biogenesis in Negativicutes and Proteobacteria (PDF). Arch Microbiol. 196 (4): 307—310. doi:10.1007/s00203-014-0964-4. PMID 24535491.
  3. Gupta RS (2003). Evolutionary relationships among photosynthetic bacteria. Photosynth Res. 76 (1–3): 173—183. doi:10.1023/A:1024999314839. PMID 16228576.
  4. Gupta RS, Chander P, George S (2013). Phylogenetic framework and molecular signatures for the class Chloroflexia and its different clades; proposal for division of the class Chloroflexia class. nov. [corrected] into the suborder Chloroflexineae subord. nov., consisting of the emended family Oscillochloridaceae and the family Chloroflexaceae fam. nov., and the suborder Roseiflexineae subord. nov., containing the family Roseiflexaceae fam. nov. Antonie van Leeuwenhoek. 103 (1): 99—119. doi:10.1007/s10482-012-9790-3. PMID 22903492.
  5. Cole JK, Gieler BA, Heisler DL, Palisoc MM, Williams AJ, Dohnalkova AC, Ming H, Yu TT, Dodsworth JA, Li WJ, Hedlund BP (2013). Kallotenue papyrolyticum gen. nov., sp. nov., a cellulolytic and filamentous thermophile that represents a novel lineage (Kallotenuales ord. nov., Kallotenuaceae fam. nov.) within the class Chloroflexia. Int J Syst Evol Microbiol. 63 (Pt 12): 4675—82. doi:10.1099/ijs.0.053348-0. PMID 23950149.
  6. Gupta RS, Mukhtar T, Singh B (1999). Evolutionary relationships among photosynthetic prokaryotes (Heliobacterium chlorum, Chloroflexus aurantiacus, cyanobacteria, Chlorobium tepidum and proteobacteria): implications regarding the origin of photosynthesis. Mol Microbiol. 32 (5): 893—906. doi:10.1046/j.1365-2958.1999.01417.x. PMID 10361294.
  7. Sayers. Chloroflexia. National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Процитовано 25 жовтня 2016.
  8. Euzeby J (2013). List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 63: 1577—1580. doi:10.1099/ijs.0.052571-0. PMC 5817221.
  9. Gupta RS (2016). Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification: the importance of Darwin's views on classification. FEMS Microbiol Rev. 40 (4): 520—53. doi:10.1093/femsre/fuw011. PMID 27279642.
  10. Gupta, R. S. (1998). Protein phylogenies and signature sequences: A reappraisal of evolutionary relationships among archaebacteria, eubacteria, and eukaryotes. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 62 (4): 1435—1491. PMC 98952. PMID 9841678.
  11. Rokas, A.; Holland, P. W. (2000). Rare genomic changes as a tool for phylogenetics. Trends in Ecology & Evolution. 15 (11): 454—459. doi:10.1016/S0169-5347(00)01967-4. PMID 11050348.
  12. Gupta, R. S.; Griffiths, E. (2002). Critical issues in bacterial phylogeny. Theoretical Population Biology. 61 (4): 423—434. doi:10.1006/tpbi.2002.1589. PMID 12167362.
  13. Hanada S, Pierson BK (2006) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes: a handbook on the biology of bacteria, pp. 815—842. Eds Dworkin M, Falkow S, Rosenberg E, Schleifer KH, Stackebrandt E Springer-: New York.
  14. Pierson BK, Castenholz RW (1992) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes, pp. 3754-3775. Eds Balows A, Truper HG, Dworkin M, Harder W, Schleifer KH Springer-: New York.
  15. Gupta RS (2010). Molecular signatures for the main phyla of photosynthetic bacteria and their subgroups. Photosynth Res. 104 (2–3): 357—372. doi:10.1007/s11120-010-9553-9. PMID 20414806.
  16. Stolz, F. M.; Hansmann, I. (1990). An MspI RFLP detected by probe pFMS76 D20S23 isolated from a flow-sorted chromosome 20-specific DNA library. Nucleic Acids Research. 18 (7): 1929. doi:10.1093/nar/18.7.1929. PMC 330654. PMID 1692410.
  17. Khadka B, Adeolu M, Blankenship RE, Gupta RS (2016). Novel insights into the origin and diversification of photosynthesis based on analyses of conserved indels in the core reaction center proteins. Photosynth Res. Epub ahead of print (2): 159—171. doi:10.1007/s11120-016-0307-1. PMID 27638319.
  18. Gupta RS (2012). Origin and spread of photosynthesis based upon conserved sequence features in key bacteriochlorophyll biosynthesis proteins. Mol Biol Evol. 29 (11): 3397—412. doi:10.1093/molbev/mss145. PMID 22628531.
  19. χλωρός. Liddell, Henry George; ; A Greek–English Lexicon at the
  20. Lewis, Charlton T. and Charles Short, A Latin Dictionary. Oxford: Clarendon Press, 1879. Online version at Perseus
  21. Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley (26 липня 2005). George M. Garrity (ред.). Introductory Essays. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Т. 2A (вид. 2nd). New York: Springer. с. 304. ISBN . British Library no. GBA561951.
image Це незавершена стаття з бактеріології.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

Hlorofleksiya Biologichna klasifikaciya Domen Bakteriyi Bacteria Tip Hlorofleksi Chloroflexi Klas Hlorofleksiya Chloroflexia Gupta et al 2013 Ryadi Sinonimi Chloroflexia Castenholz 2001 Posilannya Vikishovishe Chloroflexia EOL 9152935 ITIS 956140 NCBI 32061 Hlorofleksiya Chloroflexia klas bakterij tipu hlorofleksiv Chloroflexi vidomij yak nitchasti zeleni nesirchani bakteriyi Voni otrimuyut energiyu vid svitla i mayut taku nazvu cherez zelenij pigment yakij znahoditsya u fotosintezuyuchih tilah hlorosomah Hlorofleksiya yak pravilo nitchasta i mozhe ruhatis za dopomogoyu bakterialnogo kovzannya Voni fakultativno aerobni ale ne viroblyayut kisen u procesi otrimannya energiyi vid svitla abo fototrofiyi Krim togo hlorofleksiya maye inshij metod fototrofiyi fotogeterotrofiya nizh spravzhni fotosintetizuyuchi bakteriyi U toj chas yak bilshist bakterij z tochki zoru riznomanitnosti ye gramnegativnimi za viklyuchennyam Firmicutes Actinobacteria i grupi Deinococcus Thermus Chleni tipu Chloroflexi ye gram pozitivnimi Taksonomiya ta molekulyarni pidpisiKlas Chloroflexia ye grupoyu shiroko rozgaluzhenih vidiv fotosintezuyuchih bakterij za vinyatkom vidiv Herpetosiphon i Kallotenue yaki v danij chas skladayutsya z troh poryadkiv Chloroflexales Herpetosiphonales i Kallotenuales Kozhen Herpetosiphonales i Kallotenuales skladayetsya z odnogo rodu v mezhah vlasnogo simejstva Herpetosiphonaceae Herpetosiphon i Kallotenuaceae Kallotenue v toj chaz todi yak hlorofleksali bilsh filogenetichno riznomanitni Porivnyalnij genomnij analiz nedavno utochniv taksonomiyu klasu Hlorofleksiya rozdilivshi Hlorofleksi na pidryad Chloroflexineae sho skladayutsya z simejstv Oscillachloridaceae ta Chloroflexaceae ta pidryad Roseiflexineae sho mistyat simejstvo Roseiflexaceae Pereglyanuta sistematika gruntuvalasya na viyavlenni ryadu zberezhenih signaturnih indeksiv ZSI yaki ye nadijnimi molekulyarnimi markerami spilnogo pohodzhennya Dodatkovim argumentom shodo podilu hlorofleksaliv na dva pidryadi ye sposterezhuvani vidminnosti u fiziologichnih harakteristikah koli kozhen pidryad harakterizuyetsya chitkimi profilyami karotinoyidiv hinoniv ta zhirnih kislot yaki vidsutni v inshomu pidryadi Krim rozmezhuvannya taksonomichnih rangiv ZSI mozhut vidigravati pevnu rol v unikalnih harakteristikah chleniv kladu Zokrema chotiriamino kislotna vstavka v bilkovij piruvat flavodoksin ferredoksin oksidoreduktaza bilok yakij vidigraye vazhlivu rol u fotosintetezuyuchih organizmah bula viyavlena sered usih predstavnikiv rodu Chloroflexus i vvazhayetsya sho vona vidigraye vazhlivu funkcionalnu rol Dodatkova doslidzhennya z vikoristannyam ZSI buli provedeni dlya rozmezhuvannya filogenetichnogo polozhennya hlorofleksiyi shodo susidnih fotosintetichnih grup takih yak cianobakteriyi Vidi hlorofleksiyi proyavlyayut chitkij zv yazok z vidami hlorobi yih najblizhchimi filogenetichnimi rodichami Bulo vstanovleno sho ZSI ye spilnim sered chleniv hlorofleksiyi ta hlorobi sho bulo traktovano yak rezultat gorizontalnoyi peredachi gena mizh dvoma rodichami TaksonomiyaV danij chas ye prijnyatoyu taka taksonomiya Ryad Pidryad Rodina Truper 1976 emend Gupta et al 2013 Rid Pierson and Castenholz 1974 C aggregans Hanada et al 1995 C aurantiacus Pierson and Castenholz 1974 Rodina Keppen 2000 emend Gupta et al 2013 Rid Gorlenko and Pivovarova 1989 emend Keppen et al 2000 O chrysea Gorlenko and Pivovarova 1989 O trichoides ex Szafer Gorlenko and Korotkov1989 emend Keppen et al 2000 Rid Dubinina and Gorlenko 1975 Chloronema giganteum Dubinina and Gorlenko 1975 Pidryad Rodina Gupta et al 2013 Rid Hanada et al 2002 Roseiflexus castenholzii Hanada et al 2002 Rid Pierson et al 1986 Heliothrix oregonensis Pierson et al 1986 Ryad Rodina Rid Holt and Lewin 1968 H aurantiacus Holt and Lewin 1968 H geysericola Copeland 1936 Lewin 1970 Krim togo Kouleothrix aurantiaca ta Dehalobium chlorocoercia she ne buli povnistyu opisani EtimologiyaNazva Chloroflexi neolatinova mnozhina Chloroflexus yaka ye nazvoyu pershogo opisanogo rodu Imennik ce poyednannya greckogo chloros xlwros oznachaye zelenuvato zhovtij ta latinskogo flexus vid flecto oznachaye zignute sho oznachaye zelenij vigin Nazva ne obumovlena hlorom elementom vidkritogo u 1810 roci serom Hamfri Devi i nazvanogo tak cherez blido zelenij kolir PrimitkiSutcliffe I C 2010 A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture Trends in Microbiology 18 10 464 470 doi 10 1016 j tim 2010 06 005 PMID 20637628 Campbell C Sutcliffe IC Gupta RS 2014 Comparative proteome analysis of Acidaminococcus intestini supports a relationship between outer membrane biogenesis in Negativicutes and Proteobacteria PDF Arch Microbiol 196 4 307 310 doi 10 1007 s00203 014 0964 4 PMID 24535491 Gupta RS 2003 Evolutionary relationships among photosynthetic bacteria Photosynth Res 76 1 3 173 183 doi 10 1023 A 1024999314839 PMID 16228576 Gupta RS Chander P George S 2013 Phylogenetic framework and molecular signatures for the class Chloroflexia and its different clades proposal for division of the class Chloroflexia class nov corrected into the suborder Chloroflexineae subord nov consisting of the emended family Oscillochloridaceae and the family Chloroflexaceae fam nov and the suborder Roseiflexineae subord nov containing the family Roseiflexaceae fam nov Antonie van Leeuwenhoek 103 1 99 119 doi 10 1007 s10482 012 9790 3 PMID 22903492 Cole JK Gieler BA Heisler DL Palisoc MM Williams AJ Dohnalkova AC Ming H Yu TT Dodsworth JA Li WJ Hedlund BP 2013 Kallotenue papyrolyticum gen nov sp nov a cellulolytic and filamentous thermophile that represents a novel lineage Kallotenuales ord nov Kallotenuaceae fam nov within the class Chloroflexia Int J Syst Evol Microbiol 63 Pt 12 4675 82 doi 10 1099 ijs 0 053348 0 PMID 23950149 Gupta RS Mukhtar T Singh B 1999 Evolutionary relationships among photosynthetic prokaryotes Heliobacterium chlorum Chloroflexus aurantiacus cyanobacteria Chlorobium tepidum and proteobacteria implications regarding the origin of photosynthesis Mol Microbiol 32 5 893 906 doi 10 1046 j 1365 2958 1999 01417 x PMID 10361294 Sayers Chloroflexia National Center for Biotechnology Information NCBI taxonomy database Procitovano 25 zhovtnya 2016 Euzeby J 2013 List of new names and new combinations previously effectively but not validly published Int J Syst Evol Microbiol 63 1577 1580 doi 10 1099 ijs 0 052571 0 PMC 5817221 Gupta RS 2016 Impact of genomics on the understanding of microbial evolution and classification the importance of Darwin s views on classification FEMS Microbiol Rev 40 4 520 53 doi 10 1093 femsre fuw011 PMID 27279642 Gupta R S 1998 Protein phylogenies and signature sequences A reappraisal of evolutionary relationships among archaebacteria eubacteria and eukaryotes Microbiology and Molecular Biology Reviews 62 4 1435 1491 PMC 98952 PMID 9841678 Rokas A Holland P W 2000 Rare genomic changes as a tool for phylogenetics Trends in Ecology amp Evolution 15 11 454 459 doi 10 1016 S0169 5347 00 01967 4 PMID 11050348 Gupta R S Griffiths E 2002 Critical issues in bacterial phylogeny Theoretical Population Biology 61 4 423 434 doi 10 1006 tpbi 2002 1589 PMID 12167362 Hanada S Pierson BK 2006 The Family Chloroflexaceae In The prokaryotes a handbook on the biology of bacteria pp 815 842 Eds Dworkin M Falkow S Rosenberg E Schleifer KH Stackebrandt E Springer New York Pierson BK Castenholz RW 1992 The Family Chloroflexaceae In The prokaryotes pp 3754 3775 Eds Balows A Truper HG Dworkin M Harder W Schleifer KH Springer New York Gupta RS 2010 Molecular signatures for the main phyla of photosynthetic bacteria and their subgroups Photosynth Res 104 2 3 357 372 doi 10 1007 s11120 010 9553 9 PMID 20414806 Stolz F M Hansmann I 1990 An MspI RFLP detected by probe pFMS76 D20S23 isolated from a flow sorted chromosome 20 specific DNA library Nucleic Acids Research 18 7 1929 doi 10 1093 nar 18 7 1929 PMC 330654 PMID 1692410 Khadka B Adeolu M Blankenship RE Gupta RS 2016 Novel insights into the origin and diversification of photosynthesis based on analyses of conserved indels in the core reaction center proteins Photosynth Res Epub ahead of print 2 159 171 doi 10 1007 s11120 016 0307 1 PMID 27638319 Gupta RS 2012 Origin and spread of photosynthesis based upon conserved sequence features in key bacteriochlorophyll biosynthesis proteins Mol Biol Evol 29 11 3397 412 doi 10 1093 molbev mss145 PMID 22628531 xlwros Liddell Henry George A Greek English Lexicon at the Lewis Charlton T and Charles Short A Latin Dictionary Oxford Clarendon Press 1879 Online version at Perseus Don J Brenner Noel R Krieg James T Staley 26 lipnya 2005 George M Garrity red Introductory Essays Bergey s Manual of Systematic Bacteriology T 2A vid 2nd New York Springer s 304 ISBN 978 0 387 24143 2 British Library no GBA561951 Ce nezavershena stattya z bakteriologiyi Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ