ZKSCAN1 (англ. Zinc finger with KRAB and SCAN domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 563 амінокислот, а молекулярна маса — 63 630.
ZKSCAN1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | ZKSCAN1, 9130423L19Rik, KOX18, PHZ-37, ZNF139, ZNF36, ZSCAN33, zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 601260 MGI: 1921820 HomoloGene: 34523 GeneCards: ZKSCAN1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 7: 100.02 – 100.04 Mb | Хр. 5: 138.08 – 138.11 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MMTAESREAT | GLSPQAAQEK | DGIVIVKVEE | EDEEDHMWGQ | DSTLQDTPPP | ||||
DPEIFRQRFR | RFCYQNTFGP | REALSRLKEL | CHQWLRPEIN | TKEQILELLV | ||||
LEQFLSILPK | ELQVWLQEYR | PDSGEEAVTL | LEDLELDLSG | QQVPGQVHGP | ||||
EMLARGMVPL | DPVQESSSFD | LHHEATQSHF | KHSSRKPRLL | QSRALPAAHI | ||||
PAPPHEGSPR | DQAMASALFT | ADSQAMVKIE | DMAVSLILEE | WGCQNLARRN | ||||
LSRDNRQENY | GSAFPQGGEN | RNENEESTSK | AETSEDSASR | GETTGRSQKE | ||||
FGEKRDQEGK | TGERQQKNPE | EKTRKEKRDS | GPAIGKDKKT | ITGERGPREK | ||||
GKGLGRSFSL | SSNFTTPEEV | PTGTKSHRCD | ECGKCFTRSS | SLIRHKIIHT | ||||
GEKPYECSEC | GKAFSLNSNL | VLHQRIHTGE | KPHECNECGK | AFSHSSNLIL | ||||
HQRIHSGEKP | YECNECGKAF | SQSSDLTKHQ | RIHTGEKPYE | CSECGKAFNR | ||||
NSYLILHRRI | HTREKPYKCT | KCGKAFTRSS | TLTLHHRIHA | RERASEYSPA | ||||
SLDAFGAFLK | SCV |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tommerup N., Vissing H. (1995). Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger-encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders. Genomics. 27: 259—264. PMID 7557990 DOI:10.1006/geno.1995.1040
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- Thiesen H.-J. (1990). Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells. New Biol. 2: 363—374. PMID 2288909
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13101 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 16 жовтня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
ZKSCAN1 angl Zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 7 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 563 aminokislot a molekulyarna masa 63 630 ZKSCAN1IdentifikatoriSimvoliZKSCAN1 9130423L19Rik KOX18 PHZ 37 ZNF139 ZNF36 ZSCAN33 zinc finger with KRAB and SCAN domains 1Zovnishni ID OMIM 601260 MGI 1921820 HomoloGene 34523 GeneCards ZKSCAN1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding nucleic acid binding zv yazuvannya z ionom metalu DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta vnutrishnoklitinnij klitinne yadroBiologichnij proces GO 0009373 regulation of transcription DNA templated transcription DNA templated GO 0044324 GO 0003256 GO 1901213 GO 0046019 GO 0046020 GO 1900094 GO 0061216 GO 0060994 GO 1902064 GO 0003258 GO 0072212 regulation of transcription by RNA polymerase IIDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7586 74570Ensembl ENSG00000106261 ENSMUSG00000029729UniProt P17029 Q8BGS3RefSeq mRNK NM 001287054 NM 001287055 NM 003439 NM 001346579 NM 001346580NM 001346581NM 029869 NM 133906RefSeq bilok NP 001273983 NP 001273984 NP 001333508 NP 001333509 NP 001333510NP 003430NP 084145 NP 598667Lokus UCSC Hr 7 100 02 100 04 MbHr 5 138 08 138 11 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishejPoslidovnist aminokislot1020304050MMTAESREATGLSPQAAQEKDGIVIVKVEEEDEEDHMWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQNTFGPREALSRLKELCHQWLRPEINTKEQILELLVLEQFLSILPKELQVWLQEYRPDSGEEAVTLLEDLELDLSGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIEDMAVSLILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEEVPTGTKSHRCDECGKCFTRSSSLIRHKIIHTGEKPYECSECGKAFSLNSNLVLHQRIHTGEKPHECNECGKAFSHSSNLILHQRIHSGEKPYECNECGKAFSQSSDLTKHQRIHTGEKPYECSECGKAFNRNSYLILHRRIHTREKPYKCTKCGKAFTRSSTLTLHHRIHARERASEYSPASLDAFGAFLKSCVA Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv ionom cinku DNK Lokalizovanij u yadri LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tommerup N Vissing H 1995 Isolation and fine mapping of 16 novel human zinc finger encoding cDNAs identify putative candidate genes for developmental and malignant disorders Genomics 27 259 264 PMID 7557990 DOI 10 1006 geno 1995 1040 Hendriks I A Treffers L W Verlaan de Vries M Olsen J V Vertegaal A C 2015 SUMO 2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage Cell Rep 10 1778 1791 PMID 25772364 DOI 10 1016 j celrep 2015 02 033 Thiesen H J 1990 Multiple genes encoding zinc finger domains are expressed in human T cells New Biol 2 363 374 PMID 2288909PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 13101 angl Procitovano 7 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 16 zhovtnya 2017 Procitovano 7 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 7Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi