YBX1 (англ. Y-box binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 324 амінокислот, а молекулярна маса — 35 924.
YBX1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | YBX1, BP-8, CSDA2, CSDB, DBPB, MDR-NF1, NSEP-1, NSEP1, YB-1, YB1, CBF-A, EFI-A, Y-box binding protein 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 154030 MGI: 99146 HomoloGene: 88707 GeneCards: YBX1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 42.68 – 42.7 Mb | Хр. 4: 119.14 – 119.15 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSSEAETQQP | PAAPPAAPAL | SAADTKPGTT | GSGAGSGGPG | GLTSAAPAGG | ||||
DKKVIATKVL | GTVKWFNVRN | GYGFINRNDT | KEDVFVHQTA | IKKNNPRKYL | ||||
RSVGDGETVE | FDVVEGEKGA | EAANVTGPGG | VPVQGSKYAA | DRNHYRRYPR | ||||
RRGPPRNYQQ | NYQNSESGEK | NEGSESAPEG | QAQQRRPYRR | RRFPPYYMRR | ||||
PYGRRPQYSN | PPVQGEVMEG | ADNQGAGEQG | RPVRQNMYRG | YRPRFRRGPP | ||||
RQRQPREDGN | EEDKENQGDE | TQGQQPPQRR | YRRNFNYRRR | RPENPKPQDG | ||||
KETKAADPPA | ENSSAPEAEQ | GGAE |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, мітогенів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі. Також секретований назовні.
Література
- Sakura H., Maekawa T., Imamoto F., Yasuda K., Ishii S. (1988). Two human genes isolated by a novel method encode DNA-binding proteins containing a common region of homology. Gene. 73: 499—507. PMID 2977358 DOI:10.1016/0378-1119(88)90514-8
- Didier D.K., Schiffenbauer J., Woulfe S.L., Zacheis M., Schwartz B.D. (1988). Characterization of the cDNA encoding a protein binding to the major histocompatibility complex class II Y box. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7322—7326. PMID 3174636 DOI:10.1073/pnas.85.19.7322
- Kolluri R., Kinniburgh A.J. (1991). Full length cDNA sequence encoding a nuclease-sensitive element DNA binding protein. Nucleic Acids Res. 19: 4771—4771. PMID 1891370 DOI:10.1093/nar/19.17.4771
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Capowski E.E., Esnault S., Bhattacharya S., Malter J.S. (2001). Y box-binding factor promotes eosinophil survival by stabilizing granulocyte-macrophage colony-stimulating factor mRNA. J. Immunol. 167: 5970—5976. PMID 11698476 DOI:10.4049/jimmunol.167.10.5970
- Gaudreault I., Guay D., Lebel M. (2004). YB-1 promotes strand separation in vitro of duplex DNA containing either mispaired bases or cisplatin modifications, exhibits endonucleolytic activities and binds several DNA repair proteins. Nucleic Acids Res. 32: 316—327. PMID 14718551 DOI:10.1093/nar/gkh170
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8014 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
YBX1 angl Y box binding protein 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 324 aminokislot a molekulyarna masa 35 924 YBX1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1H95IdentifikatoriSimvoliYBX1 BP 8 CSDA2 CSDB DBPB MDR NF1 NSEP 1 NSEP1 YB 1 YB1 CBF A EFI A Y box binding protein 1Zovnishni ID OMIM 154030 MGI 99146 HomoloGene 88707 GeneCards YBX1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding GO 0001131 GO 0001151 GO 0001130 GO 0001204 DNA binding transcription factor activity GO 0001077 GO 0001212 GO 0001213 GO 0001211 GO 0001205 DNA binding transcription activator activity RNA polymerase II specific GO 0000980 RNA polymerase II cis regulatory region sequence specific DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding RNA binding nucleic acid binding GTPase binding double stranded DNA binding single stranded DNA binding chromatin binding GO 0001200 GO 0001133 GO 0001201 DNA binding transcription factor activity RNA polymerase II specificKlitinna komponenta citoplazma CRD mediated mRNA stability complex yaderna membrana vnutrishnoklitinna membranna organela U12 type spliceosomal complex nukleoplazma extracellular region cytoplasmic stress granule ekzosoma klitinne yadro histone pre mRNA 3 end processing complex gialoplazma RibonukleoproteyiniBiologichnij proces CRD mediated mRNA stabilization mRNA splicing via spliceosome GO 0009373 regulation of transcription DNA templated mRNA processing transcription by RNA polymerase II protein localization to cytoplasmic stress granule transcription DNA templated positive regulation of cell division GO 0003257 GO 0010735 GO 1901228 GO 1900622 GO 1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II in utero embryonic development Splajsing RNK negative regulation of striated muscle cell differentiation GO 1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Signalnij shlyah Notch cellular response to interleukin 7Dzherela Amigo QuickGOOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4904 22608Ensembl ENSG00000065978 ENSMUSG00000028639UniProt P67809 P62960RefSeq mRNK NM 004559NM 011732RefSeq bilok NP 004550NP 035862Lokus UCSC Hr 1 42 68 42 7 MbHr 4 119 14 119 15 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MSSEAETQQPPAAPPAAPALSAADTKPGTTGSGAGSGGPGGLTSAAPAGG DKKVIATKVLGTVKWFNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKKNNPRKYL RSVGDGETVEFDVVEGEKGAEAANVTGPGGVPVQGSKYAADRNHYRRYPR RRGPPRNYQQNYQNSESGEKNEGSESAPEGQAQQRRPYRRRRFPPYYMRR PYGRRPQYSNPPVQGEVMEGADNQGAGEQGRPVRQNMYRGYRPRFRRGPP RQRQPREDGNEEDKENQGDETQGQQPPQRRYRRNFNYRRRRPENPKPQDG KETKAADPPAENSSAPEAEQGGAE A Alanin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do represoriv aktivatoriv mitogeniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak procesing mRNK splajsing mRNK transkripciya regulyaciya transkripciyi Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z DNK RNK Lokalizovanij u citoplazmi yadri Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaSakura H Maekawa T Imamoto F Yasuda K Ishii S 1988 Two human genes isolated by a novel method encode DNA binding proteins containing a common region of homology Gene 73 499 507 PMID 2977358 DOI 10 1016 0378 1119 88 90514 8 Didier D K Schiffenbauer J Woulfe S L Zacheis M Schwartz B D 1988 Characterization of the cDNA encoding a protein binding to the major histocompatibility complex class II Y box Proc Natl Acad Sci U S A 85 7322 7326 PMID 3174636 DOI 10 1073 pnas 85 19 7322 Kolluri R Kinniburgh A J 1991 Full length cDNA sequence encoding a nuclease sensitive element DNA binding protein Nucleic Acids Res 19 4771 4771 PMID 1891370 DOI 10 1093 nar 19 17 4771 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Capowski E E Esnault S Bhattacharya S Malter J S 2001 Y box binding factor promotes eosinophil survival by stabilizing granulocyte macrophage colony stimulating factor mRNA J Immunol 167 5970 5976 PMID 11698476 DOI 10 4049 jimmunol 167 10 5970 Gaudreault I Guay D Lebel M 2004 YB 1 promotes strand separation in vitro of duplex DNA containing either mispaired bases or cisplatin modifications exhibits endonucleolytic activities and binds several DNA repair proteins Nucleic Acids Res 32 316 327 PMID 14718551 DOI 10 1093 nar gkh170PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 8014 angl Procitovano 6 lyutogo 2017 angl Arhiv originalu za 3 lyutogo 2017 Procitovano 6 lyutogo 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi