VCAM1 (англ. Vascular cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 81 276.
VCAM1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | VCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1 | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 1: 100.72 – 100.74 Mb | Хр. 3: 115.9 – 115.92 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MPGKMVVILG | ASNILWIMFA | ASQAFKIETT | PESRYLAQIG | DSVSLTCSTT | ||||
GCESPFFSWR | TQIDSPLNGK | VTNEGTTSTL | TMNPVSFGNE | HSYLCTATCE | ||||
SRKLEKGIQV | EIYSFPKDPE | IHLSGPLEAG | KPITVKCSVA | DVYPFDRLEI | ||||
DLLKGDHLMK | SQEFLEDADR | KSLETKSLEV | TFTPVIEDIG | KVLVCRAKLH | ||||
IDEMDSVPTV | RQAVKELQVY | ISPKNTVISV | NPSTKLQEGG | SVTMTCSSEG | ||||
LPAPEIFWSK | KLDNGNLQHL | SGNATLTLIA | MRMEDSGIYV | CEGVNLIGKN | ||||
RKEVELIVQE | KPFTVEISPG | PRIAAQIGDS | VMLTCSVMGC | ESPSFSWRTQ | ||||
IDSPLSGKVR | SEGTNSTLTL | SPVSFENEHS | YLCTVTCGHK | KLEKGIQVEL | ||||
YSFPRDPEIE | MSGGLVNGSS | VTVSCKVPSV | YPLDRLEIEL | LKGETILENI | ||||
EFLEDTDMKS | LENKSLEMTF | IPTIEDTGKA | LVCQAKLHID | DMEFEPKQRQ | ||||
STQTLYVNVA | PRDTTVLVSP | SSILEEGSSV | NMTCLSQGFP | APKILWSRQL | ||||
PNGELQPLSE | NATLTLISTK | MEDSGVYLCE | GINQAGRSRK | EVELIIQVTP | ||||
KDIKLTAFPS | ESVKEGDTVI | ISCTCGNVPE | TWIILKKKAE | TGDTVLKSID | ||||
GAYTIRKAQL | KDAGVYECES | KNKVGSQLRS | LTLDVQGREN | NKDYFSPELL | ||||
VLYFASSLII | PAIGMIIYFA | RKANMKGSYS | LVEAQKSKV |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.
Література
- Polte T., Newman W., Gopal T.V. (1990). Full length vascular cell adhesion molecule 1 (VCAM-1). Nucleic Acids Res. 18: 5901—5901. PMID 1699207 DOI:10.1093/nar/18.19.5901
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Osborn L., Vassallo C., Benjamin C.D. (1992). Activated endothelium binds lymphocytes through a novel binding site in the alternately spliced domain of vascular cell adhesion molecule-1. J. Exp. Med. 176: 99—107. PMID 1377228 DOI:10.1084/jem.176.1.99
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
- Iademarco M.F., McQuillan J.J., Rosen G.D., Dean D.C. (1992). Characterization of the promoter for vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1). J. Biol. Chem. 267: 16323—16329. PMID 1379595
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
VCAM1 angl Vascular cell adhesion molecule 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 1 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 739 aminokislot a molekulyarna masa 81 276 VCAM1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1IJ9 1VCA 1VSCIdentifikatoriSimvoliVCAM1 CD106 INCAM 100 vascular cell adhesion molecule 1Zovnishni ID OMIM 192225 MGI 98926 HomoloGene 838 GeneCards VCAM1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya primary amine oxidase activity integrin binding cell adhesion molecule bindingKlitinna komponenta integral component of membrane kompleks Goldzhi alpha9 beta1 integrin vascular cell adhesion molecule 1 complex membrana Filopodiya klitinna membrana apical part of cell Mikrovorsinki cell surface early endosome endoplazmatichnij retikulum podosome Sarkolema ekzosoma external side of plasma membrane mizhklitinnij prostir integral component of plasma membraneBiologichnij proces leukocyte cell cell adhesion response to ionizing radiation heterophilic cell cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules response to hypoxia response to nutrient interferon gamma mediated signaling pathway cellular response to tumor necrosis factor response to nicotine GO 0010260 starinnya lyudini response to zinc ion extracellular matrix organization amine metabolic process response to lipopolysaccharide adgeziya klitin acute inflammatory response positive regulation of T cell proliferation membrane to membrane docking regulation of immune response leukocyte tethering or rolling cell chemotaxis B cell differentiation cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus cell matrix adhesion GO 0022415 viral process response to ethanol calcium mediated signaling using intracellular calcium source chronic inflammatory response cell cell adhesion cytokine mediated signaling pathway heterotypic cell cell adhesion innervaciya cardiac neuron differentiation cell cell adhesion in response to extracellular stimulus cellular response to amyloid betaDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez7412 22329Ensembl ENSG00000162692 ENSMUSG00000027962UniProt P19320 P29533RefSeq mRNK NM 080682 NM 001078 NM 001199834NM 011693RefSeq bilok NP 001069 NP 001186763 NP 542413NP 035823Lokus UCSC Hr 1 100 72 100 74 MbHr 3 115 9 115 92 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MPGKMVVILGASNILWIMFAASQAFKIETTPESRYLAQIGDSVSLTCSTT GCESPFFSWRTQIDSPLNGKVTNEGTTSTLTMNPVSFGNEHSYLCTATCE SRKLEKGIQVEIYSFPKDPEIHLSGPLEAGKPITVKCSVADVYPFDRLEI DLLKGDHLMKSQEFLEDADRKSLETKSLEVTFTPVIEDIGKVLVCRAKLH IDEMDSVPTVRQAVKELQVYISPKNTVISVNPSTKLQEGGSVTMTCSSEG LPAPEIFWSKKLDNGNLQHLSGNATLTLIAMRMEDSGIYVCEGVNLIGKN RKEVELIVQEKPFTVEISPGPRIAAQIGDSVMLTCSVMGCESPSFSWRTQ IDSPLSGKVRSEGTNSTLTLSPVSFENEHSYLCTVTCGHKKLEKGIQVEL YSFPRDPEIEMSGGLVNGSSVTVSCKVPSVYPLDRLEIELLKGETILENI EFLEDTDMKSLENKSLEMTFIPTIEDTGKALVCQAKLHIDDMEFEPKQRQ STQTLYVNVAPRDTTVLVSPSSILEEGSSVNMTCLSQGFPAPKILWSRQL PNGELQPLSENATLTLISTKMEDSGVYLCEGINQAGRSRKEVELIIQVTP KDIKLTAFPSESVKEGDTVIISCTCGNVPETWIILKKKAETGDTVLKSID GAYTIRKAQLKDAGVYECESKNKVGSQLRSLTLDVQGRENNKDYFSPELL VLYFASSLIIPAIGMIIYFARKANMKGSYSLVEAQKSKV A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak klitinna adgeziya vzayemodiya hazyayin virus Lokalizovanij u membrani LiteraturaPolte T Newman W Gopal T V 1990 Full length vascular cell adhesion molecule 1 VCAM 1 Nucleic Acids Res 18 5901 5901 PMID 1699207 DOI 10 1093 nar 18 19 5901 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Osborn L Vassallo C Benjamin C D 1992 Activated endothelium binds lymphocytes through a novel binding site in the alternately spliced domain of vascular cell adhesion molecule 1 J Exp Med 176 99 107 PMID 1377228 DOI 10 1084 jem 176 1 99 Zhang Z Henzel W J 2004 Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites Protein Sci 13 2819 2824 PMID 15340161 DOI 10 1110 ps 04682504 Iademarco M F McQuillan J J Rosen G D Dean D C 1992 Characterization of the promoter for vascular cell adhesion molecule 1 VCAM 1 J Biol Chem 267 16323 16329 PMID 1379595PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 12663 angl Procitovano 25 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 3 zhovtnya 2017 Procitovano 25 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 1 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi