TRPM1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 603 амінокислот, а молекулярна маса — 182 178.
TRPM1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TRPM1, CSNB1C, LTRPC1, MLSN1, transient receptor potential cation channel subfamily M member 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 603576 MGI: 1330305 HomoloGene: 19940 GeneCards: TRPM1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
congenital stationary night blindness 1C | |||||||||||||||||
Реагує на сполуку | |||||||||||||||||
pregnenolone sulfate | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 15: 31 – 31.16 Mb | Хр. 7: 63.8 – 63.92 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MKDSNRCCCG | QFTNQHIPPL | PSATPSKNEE | ESKQVETQPE | KWSVAKHTQS | ||||
YPTDSYGVLE | FQGGGYSNKA | MYIRVSYDTK | PDSLLHLMVK | DWQLELPKLL | ||||
ISVHGGLQNF | EMQPKLKQVF | GKGLIKAAMT | TGAWIFTGGV | STGVISHVGD | ||||
ALKDHSSKSR | GRVCAIGIAP | WGIVENKEDL | VGKDVTRVYQ | TMSNPLSKLS | ||||
VLNNSHTHFI | LADNGTLGKY | GAEVKLRRLL | EKHISLQKIN | TRLGQGVPLV | ||||
GLVVEGGPNV | VSIVLEYLQE | EPPIPVVICD | GSGRASDILS | FAHKYCEEGG | ||||
IINESLREQL | LVTIQKTFNY | NKAQSHQLFA | IIMECMKKKE | LVTVFRMGSE | ||||
GQQDIEMAIL | TALLKGTNVS | APDQLSLALA | WNRVDIARSQ | IFVFGPHWPP | ||||
LGSLAPPTDS | KATEKEKKPP | MATTKGGRGK | GKGKKKGKVK | EEVEEETDPR | ||||
KIELLNWVNA | LEQAMLDALV | LDRVDFVKLL | IENGVNMQHF | LTIPRLEELY | ||||
NTRLGPPNTL | HLLVRDVKKS | NLPPDYHISL | IDIGLVLEYL | MGGAYRCNYT | ||||
RKNFRTLYNN | LFGPKRPKAL | KLLGMEDDEP | PAKGKKKKKK | KKEEEIDIDV | ||||
DDPAVSRFQY | PFHELMVWAV | LMKRQKMAVF | LWQRGEESMA | KALVACKLYK | ||||
AMAHESSESD | LVDDISQDLD | NNSKDFGQLA | LELLDQSYKH | DEQIAMKLLT | ||||
YELKNWSNST | CLKLAVAAKH | RDFIAHTCSQ | MLLTDMWMGR | LRMRKNPGLK | ||||
VIMGILLPPT | ILFLEFRTYD | DFSYQTSKEN | EDGKEKEEEN | TDANADAGSR | ||||
KGDEENEHKK | QRSIPIGTKI | CEFYNAPIVK | FWFYTISYLG | YLLLFNYVIL | ||||
VRMDGWPSLQ | EWIVISYIVS | LALEKIREIL | MSEPGKLSQK | IKVWLQEYWN | ||||
ITDLVAISTF | MIGAILRLQN | QPYMGYGRVI | YCVDIIFWYI | RVLDIFGVNK | ||||
YLGPYVMMIG | KMMIDMLYFV | VIMLVVLMSF | GVARQAILHP | EEKPSWKLAR | ||||
NIFYMPYWMI | YGEVFADQID | LYAMEINPPC | GENLYDEEGK | RLPPCIPGAW | ||||
LTPALMACYL | LVANILLVNL | LIAVFNNTFF | EVKSISNQVW | KFQRYQLIMT | ||||
FHDRPVLPPP | MIILSHIYII | IMRLSGRCRK | KREGDQEERD | RGLKLFLSDE | ||||
ELKRLHEFEE | QCVQEHFREK | EDEQQSSSDE | RIRVTSERVE | NMSMRLEEIN | ||||
ERETFMKTSL | QTVDLRLAQL | EELSNRMVNA | LENLAGIDRS | DLIQARSRAS | ||||
SECEATYLLR | QSSINSADGY | SLYRYHFNGE | ELLFEDTSLS | TSPGTGVRKK | ||||
TCSFRIKEEK | DVKTHLVPEC | QNSLHLSLGT | STSATPDGSH | LAVDDLKNAE | ||||
ESKLGPDIGI | SKEDDERQTD | SKKEETISPS | LNKTDVIHGQ | DKSDVQNTQL | ||||
TVETTNIEGT | ISYPLEETKI | TRYFPDETIN | ACKTMKSRSF | VYSRGRKLVG | ||||
GVNQDVEYSS | ITDQQLTTEW | QCQVQKITRS | HSTDIPYIVS | EAAVQAEHKE | ||||
QFADMQDEHH | VAEAIPRIPR | LSLTITDRNG | MENLLSVKPD | QTLGFPSLRS | ||||
KSLHGHPRNV | KSIQGKLDRS | GHASSVSSLV | IVSGMTAEEK | KVKKEKASTE | ||||
TEC |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Fang D., Setaluri V. (2000). Expression and up-regulation of alternatively spliced transcripts of melastatin, a melanoma metastasis-related gene, in human melanoma cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 53—61. PMID 11112417 DOI:10.1006/bbrc.2000.3894
- Xu X.-Z.S., Moebius F., Gill D.L., Montell C. (2001). Regulation of melastatin, a TRP-related protein, through interaction with a cytoplasmic isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10692—10697. PMID 11535825 DOI:10.1073/pnas.191360198
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з TRPM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7146 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TRPM1 angl Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 15 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 1 603 aminokislot a molekulyarna masa 182 178 TRPM1IdentifikatoriSimvoliTRPM1 CSNB1C LTRPC1 MLSN1 transient receptor potential cation channel subfamily M member 1Zovnishni ID OMIM 603576 MGI 1330305 HomoloGene 19940 GeneCards TRPM1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyacongenital stationary night blindness 1C Reaguye na spolukupregnenolone sulfate Ontologiya genaMolekulyarna funkciya calcium channel activity ion channel activity cation channel activityKlitinna komponenta integral component of membrane membrana klitinna membrana integral component of plasma membrane new growing cell tipBiologichnij proces G protein coupled glutamate receptor signaling pathway calcium ion transport into cytosol vidpovid na stimul ion transport protein tetramerization calcium ion transmembrane transport retinal rod cell development cellular response to light stimulus zir GO 0072468 signalna transdukciya ion transmembrane transport transmembrannij transport cation transmembrane transportDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez4308 17364Ensembl ENSG00000274965 ENSG00000134160 ENSMUSG00000030523UniProt Q7Z4N2 Q2TV84RefSeq mRNK NM 001252020 NM 001252024 NM 001252030 NM 002420NM 001039104 NM 018752RefSeq bilok NP 001238949 NP 001238953 NP 001238959 NP 002411NP 001034193 NP 061222Lokus UCSC Hr 15 31 31 16 MbHr 7 63 8 63 92 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MKDSNRCCCGQFTNQHIPPLPSATPSKNEEESKQVETQPEKWSVAKHTQS YPTDSYGVLEFQGGGYSNKAMYIRVSYDTKPDSLLHLMVKDWQLELPKLL ISVHGGLQNFEMQPKLKQVFGKGLIKAAMTTGAWIFTGGVSTGVISHVGD ALKDHSSKSRGRVCAIGIAPWGIVENKEDLVGKDVTRVYQTMSNPLSKLS VLNNSHTHFILADNGTLGKYGAEVKLRRLLEKHISLQKINTRLGQGVPLV GLVVEGGPNVVSIVLEYLQEEPPIPVVICDGSGRASDILSFAHKYCEEGG IINESLREQLLVTIQKTFNYNKAQSHQLFAIIMECMKKKELVTVFRMGSE GQQDIEMAILTALLKGTNVSAPDQLSLALAWNRVDIARSQIFVFGPHWPP LGSLAPPTDSKATEKEKKPPMATTKGGRGKGKGKKKGKVKEEVEEETDPR KIELLNWVNALEQAMLDALVLDRVDFVKLLIENGVNMQHFLTIPRLEELY NTRLGPPNTLHLLVRDVKKSNLPPDYHISLIDIGLVLEYLMGGAYRCNYT RKNFRTLYNNLFGPKRPKALKLLGMEDDEPPAKGKKKKKKKKEEEIDIDV DDPAVSRFQYPFHELMVWAVLMKRQKMAVFLWQRGEESMAKALVACKLYK AMAHESSESDLVDDISQDLDNNSKDFGQLALELLDQSYKHDEQIAMKLLT YELKNWSNSTCLKLAVAAKHRDFIAHTCSQMLLTDMWMGRLRMRKNPGLK VIMGILLPPTILFLEFRTYDDFSYQTSKENEDGKEKEEENTDANADAGSR KGDEENEHKKQRSIPIGTKICEFYNAPIVKFWFYTISYLGYLLLFNYVIL VRMDGWPSLQEWIVISYIVSLALEKIREILMSEPGKLSQKIKVWLQEYWN ITDLVAISTFMIGAILRLQNQPYMGYGRVIYCVDIIFWYIRVLDIFGVNK YLGPYVMMIGKMMIDMLYFVVIMLVVLMSFGVARQAILHPEEKPSWKLAR NIFYMPYWMIYGEVFADQIDLYAMEINPPCGENLYDEEGKRLPPCIPGAW LTPALMACYLLVANILLVNLLIAVFNNTFFEVKSISNQVWKFQRYQLIMT FHDRPVLPPPMIILSHIYIIIMRLSGRCRKKREGDQEERDRGLKLFLSDE ELKRLHEFEEQCVQEHFREKEDEQQSSSDERIRVTSERVENMSMRLEEIN ERETFMKTSLQTVDLRLAQLEELSNRMVNALENLAGIDRSDLIQARSRAS SECEATYLLRQSSINSADGYSLYRYHFNGEELLFEDTSLSTSPGTGVRKK TCSFRIKEEKDVKTHLVPECQNSLHLSLGTSTSATPDGSHLAVDDLKNAE ESKLGPDIGISKEDDERQTDSKKEETISPSLNKTDVIHGQDKSDVQNTQL TVETTNIEGTISYPLEETKITRYFPDETINACKTMKSRSFVYSRGRKLVG GVNQDVEYSSITDQQLTTEWQCQVQKITRSHSTDIPYIVSEAAVQAEHKE QFADMQDEHHVAEAIPRIPRLSLTITDRNGMENLLSVKPDQTLGFPSLRS KSLHGHPRNVKSIQGKLDRSGHASSVSSLVIVSGMTAEEKKVKKEKASTE TEC A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do receptoriv ionnih kanaliv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transport ioniv transport Lokalizovanij u klitinnij membrani membrani LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Fang D Setaluri V 2000 Expression and up regulation of alternatively spliced transcripts of melastatin a melanoma metastasis related gene in human melanoma cells Biochem Biophys Res Commun 279 53 61 PMID 11112417 DOI 10 1006 bbrc 2000 3894 Xu X Z S Moebius F Gill D L Montell C 2001 Regulation of melastatin a TRP related protein through interaction with a cytoplasmic isoform Proc Natl Acad Sci U S A 98 10692 10697 PMID 11535825 DOI 10 1073 pnas 191360198PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z TRPM1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Spoluki yaki fizichno vzayemodiyut z Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 7146 angl Procitovano 22 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 veresnya 2017 Procitovano 22 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 15 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi