TERF2IP (англ. TERF2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 399 амінокислот, а молекулярна маса — 44 260.
TERF2IP | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | TERF2IP, DRIP5, RAP1, TERF2 interacting protein | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 605061 MGI: 1929871 HomoloGene: 10357 GeneCards: TERF2IP | ||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 16: 75.65 – 75.76 Mb | Хр. 8: 112.74 – 112.75 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAEAMDLGKD | PNGPTHSSTL | FVRDDGSSMS | FYVRPSPAKR | RLSTLILHGG | ||||
GTVCRVQEPG | AVLLAQPGEA | LAEASGDFIS | TQYILDCVER | NERLELEAYR | ||||
LGPASAADTG | SEAKPGALAE | GAAEPEPQRH | AGRIAFTDAD | DVAILTYVKE | ||||
NARSPSSVTG | NALWKAMEKS | SLTQHSWQSL | KDRYLKHLRG | QEHKYLLGDA | ||||
PVSPSSQKLK | RKAEEDPEAA | DSGEPQNKRT | PDLPEEEYVK | EEIQENEEAV | ||||
KKMLVEATRE | FEEVVVDESP | PDFEIHITMC | DDDPPTPEED | SETQPDEEEE | ||||
EEEEKVSQPE | VGAAIKIIRQ | LMEKFNLDLS | TVTQAFLKNS | GELEATSAFL | ||||
ASGQRADGYP | IWSRQDDIDL | QKDDEDTREA | LVKKFGAQNV | ARRIEFRKK |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.
Література
- Li B., Oestreich S., de Lange T. (2000). Identification of human RAP1: implications for telomere evolution. Cell. 101: 471—483. PMID 10850490 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80858-2
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tan M., Wei C., Price C.M. (2003). The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes. Gene. 323: 1—10. PMID 14659874 DOI:10.1016/j.gene.2003.08.026
- Liu D., O'Connor M.S., Qin J., Songyang Z. (2004). Telosome, a mammalian telomere-associated complex formed by multiple telomeric proteins. J. Biol. Chem. 279: 51338—51342. PMID 15383534 DOI:10.1074/jbc.M409293200
- de Lange T. (2005). Shelterin: the protein complex that shapes and safeguards human telomeres. Genes Dev. 19: 2100—2110. PMID 16166375 DOI:10.1101/gad.1346005
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19246 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
TERF2IP angl TERF2 interacting protein bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 16 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 399 aminokislot a molekulyarna masa 44 260 TERF2IPNayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB1FEX 3K6G 4RQIIdentifikatoriSimvoliTERF2IP DRIP5 RAP1 TERF2 interacting proteinZovnishni ID OMIM 605061 MGI 1929871 HomoloGene 10357 GeneCards TERF2IPOntologiya genaMolekulyarna funkciya DNA binding telomeric DNA binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding G rich strand telomeric DNA binding phosphatase bindingKlitinna komponenta nuclear telomere cap complex nuclear envelope hromosoma shelterin complex telomera nuclear chromosome Mre11 complex klitinne yadro nukleoplazma gialoplazma yaderni tilcya citoplazmaBiologichnij proces negative regulation of DNA recombination at telomere telomere maintenance via telomerase protection from non homologous end joining at telomere regulation of double strand break repair via homologous recombination transcription DNA templated positive regulation of peptidyl serine phosphorylation protein localization to chromosome telomeric region positive regulation of protein acetylation telomere maintenance via telomere lengthening positive regulation of NF kappaB transcription factor activity positive regulation of I kappaB kinase NF kappaB signaling telomere maintenance telomere capping GO 0033128 negative regulation of protein phosphorylation GO 0009373 regulation of transcription DNA templated regulation of telomere maintenance negative regulation of telomere maintenance positive regulation of NIK NF kappaB signalingDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez54386 57321Ensembl ENSG00000166848 ENSMUSG00000033430UniProt Q9NYB0 Q91VL8RefSeq mRNK NM 018975NM 020584RefSeq bilok NP 061848NP 065609Lokus UCSC Hr 16 75 65 75 76 MbHr 8 112 74 112 75 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MAEAMDLGKDPNGPTHSSTLFVRDDGSSMSFYVRPSPAKRRLSTLILHGG GTVCRVQEPGAVLLAQPGEALAEASGDFISTQYILDCVERNERLELEAYR LGPASAADTGSEAKPGALAEGAAEPEPQRHAGRIAFTDADDVAILTYVKE NARSPSSVTGNALWKAMEKSSLTQHSWQSLKDRYLKHLRGQEHKYLLGDA PVSPSSQKLKRKAEEDPEAADSGEPQNKRTPDLPEEEYVKEEIQENEEAV KKMLVEATREFEEVVVDESPPDFEIHITMCDDDPPTPEEDSETQPDEEEE EEEEKVSQPEVGAAIKIIRQLMEKFNLDLSTVTQAFLKNSGELEATSAFL ASGQRADGYPIWSRQDDIDLQKDDEDTREALVKKFGAQNVARRIEFRKK A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyami nalezhit do aktivatoriv fosfoproteyiniv Zadiyanij u takih biologichnih procesah yak transkripciya regulyaciya transkripciyi acetilyuvannya Lokalizovanij u citoplazmi yadri hromosomah LiteraturaLi B Oestreich S de Lange T 2000 Identification of human RAP1 implications for telomere evolution Cell 101 471 483 PMID 10850490 DOI 10 1016 S0092 8674 00 80858 2 The status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tan M Wei C Price C M 2003 The telomeric protein Rap1 is conserved in vertebrates and is expressed from a bidirectional promoter positioned between the Rap1 and KARS genes Gene 323 1 10 PMID 14659874 DOI 10 1016 j gene 2003 08 026 Liu D O Connor M S Qin J Songyang Z 2004 Telosome a mammalian telomere associated complex formed by multiple telomeric proteins J Biol Chem 279 51338 51342 PMID 15383534 DOI 10 1074 jbc M409293200 de Lange T 2005 Shelterin the protein complex that shapes and safeguards human telomeres Genes Dev 19 2100 2110 PMID 16166375 DOI 10 1101 gad 1346005 Beausoleil S A Villen J Gerber S A Rush J Gygi S P 2006 A probability based approach for high throughput protein phosphorylation analysis and site localization Nat Biotechnol 24 1285 1292 PMID 16964243 DOI 10 1038 nbt1240PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference HUGO Gene Nomenclature Commitee HGNC 19246 angl Procitovano 11 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 12 zhovtnya 2017 Procitovano 11 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 16 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi