SPON1 (англ. Spondin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 807 амінокислот, а молекулярна маса — 90 973.
SPON1 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | SPON1, VSGP/F-spondin, f-spondin, Spondin 1 | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 604989 MGI: 2385287 HomoloGene: 4453 GeneCards: SPON1 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
туберкульоз | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Шаблон експресії | |||||||||||||||||
Більше даних | |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||
Ensembl |
|
| |||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 11: 13.96 – 14.27 Mb | Хр. 7: 113.37 – 113.64 Mb | |||||||||||||||
PubMed search | |||||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MRLSPAPLKL | SRTPALLALA | LPLAAALAFS | DETLDKVPKS | EGYCSRILRA | ||||
QGTRREGYTE | FSLRVEGDPD | FYKPGTSYRV | TLSAAPPSYF | RGFTLIALRE | ||||
NREGDKEEDH | AGTFQIIDEE | ETQFMSNCPV | AVTESTPRRR | TRIQVFWIAP | ||||
PAGTGCVILK | ASIVQKRIIY | FQDEGSLTKK | LCEQDSTFDG | VTDKPILDCC | ||||
ACGTAKYRLT | FYGNWSEKTH | PKDYPRRANH | WSAIIGGSHS | KNYVLWEYGG | ||||
YASEGVKQVA | ELGSPVKMEE | EIRQQSDEVL | TVIKAKAQWP | AWQPLNVRAA | ||||
PSAEFSVDRT | RHLMSFLTMM | GPSPDWNVGL | SAEDLCTKEC | GWVQKVVQDL | ||||
IPWDAGTDSG | VTYESPNKPT | IPQEKIRPLT | SLDHPQSPFY | DPEGGSITQV | ||||
ARVVIERIAR | KGEQCNIVPD | NVDDIVADLA | PEEKDEDDTP | ETCIYSNWSP | ||||
WSACSSSTCD | KGKRMRQRML | KAQLDLSVPC | PDTQDFQPCM | GPGCSDEDGS | ||||
TCTMSEWITW | SPCSISCGMG | MRSRERYVKQ | FPEDGSVCTL | PTEETEKCTV | ||||
NEECSPSSCL | MTEWGEWDEC | SATCGMGMKK | RHRMIKMNPA | DGSMCKAETS | ||||
QAEKCMMPEC | HTIPCLLSPW | SEWSDCSVTC | GKGMRTRQRM | LKSLAELGDC | ||||
NEDLEQVEKC | MLPECPIDCE | LTEWSQWSEC | NKSCGKGHVI | RTRMIQMEPQ | ||||
FGGAPCPETV | QRKKCRIRKC | LRNPSIQKLR | WREARESRRS | EQLKEESEGE | ||||
QFPGCRMRPW | TAWSECTKLC | GGGIQERYMT | VKKRFKSSQF | TSCKDKKEIR | ||||
ACNVHPC |
Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Tan K., Duquette M., Liu J.H., Lawler J., Wang J.H. (2008). The crystal structure of the heparin-binding reelin-N domain of f-spondin. J. Mol. Biol. 381: 1213—1223. PMID 18602404 DOI:10.1016/j.jmb.2008.06.045
- Tan K., Lawler J. (2011). The structure of the Ca+-binding, glycosylated F-spondin domain of F-spondin - A C2-domain variant in an extracellular matrix protein. BMC Struct. Biol. 11: 22—22. PMID 21569239 DOI:10.1186/1472-6807-11-22
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SPON1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- (англ.) . Архів оригіналу за 6 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
- (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
Це незавершена стаття про білки. Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її. |
Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет
SPON1 angl Spondin 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 11 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 807 aminokislot a molekulyarna masa 90 973 SPON1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB2ZOT 2ZOU 3COO 3Q13IdentifikatoriSimvoliSPON1 VSGP F spondin f spondin Spondin 1Zovnishni ID OMIM 604989 MGI 2385287 HomoloGene 4453 GeneCards SPON1Pov yazani genetichni zahvoryuvannyatuberkuloz Ontologiya genaMolekulyarna funkciya GO 0001948 GO 0016582 protein binding zv yazuvannya z ionom metalu extracellular matrix structural constituent LBD domain bindingKlitinna komponenta GO 0005578 Pozaklitinna matricya extracellular region endoplasmic reticulum lumen mizhklitinnij prostir collagen containing extracellular matrixBiologichnij proces adgeziya klitin protein O linked fucosylation positive regulation of protein processing positive regulation of protein binding negative regulation of amyloid beta formation positive regulation of amyloid precursor protein catabolic processDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez10418 233744Ensembl ENSG00000262655 ENSMUSG00000038156UniProt Q9HCB6 Q8VCC9RefSeq mRNK NM 006108NM 145584RefSeq bilok NP 006099NP 663559Lokus UCSC Hr 11 13 96 14 27 MbHr 7 113 37 113 64 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRLSPAPLKLSRTPALLALALPLAAALAFSDETLDKVPKSEGYCSRILRA QGTRREGYTEFSLRVEGDPDFYKPGTSYRVTLSAAPPSYFRGFTLIALRE NREGDKEEDHAGTFQIIDEEETQFMSNCPVAVTESTPRRRTRIQVFWIAP PAGTGCVILKASIVQKRIIYFQDEGSLTKKLCEQDSTFDGVTDKPILDCC ACGTAKYRLTFYGNWSEKTHPKDYPRRANHWSAIIGGSHSKNYVLWEYGG YASEGVKQVAELGSPVKMEEEIRQQSDEVLTVIKAKAQWPAWQPLNVRAA PSAEFSVDRTRHLMSFLTMMGPSPDWNVGLSAEDLCTKECGWVQKVVQDL IPWDAGTDSGVTYESPNKPTIPQEKIRPLTSLDHPQSPFYDPEGGSITQV ARVVIERIARKGEQCNIVPDNVDDIVADLAPEEKDEDDTPETCIYSNWSP WSACSSSTCDKGKRMRQRMLKAQLDLSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDEDGS TCTMSEWITWSPCSISCGMGMRSRERYVKQFPEDGSVCTLPTEETEKCTV NEECSPSSCLMTEWGEWDECSATCGMGMKKRHRMIKMNPADGSMCKAETS QAEKCMMPECHTIPCLLSPWSEWSDCSVTCGKGMRTRQRMLKSLAELGDC NEDLEQVEKCMLPECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEPQ FGGAPCPETVQRKKCRIRKCLRNPSIQKLRWREARESRRSEQLKEESEGE QFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGIQERYMTVKKRFKSSQFTSCKDKKEIR ACNVHPC A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak klitinna adgeziya Bilok maye sajt dlya zv yazuvannya z ionami metaliv Lokalizovanij u pozaklitinnomu matriksi Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Tan K Duquette M Liu J H Lawler J Wang J H 2008 The crystal structure of the heparin binding reelin N domain of f spondin J Mol Biol 381 1213 1223 PMID 18602404 DOI 10 1016 j jmb 2008 06 045 Tan K Lawler J 2011 The structure of the Ca binding glycosylated F spondin domain of F spondin A C2 domain variant in an extracellular matrix protein BMC Struct Biol 11 22 22 PMID 21569239 DOI 10 1186 1472 6807 11 22PrimitkiZahvoryuvannya genetichno pov yazani z SPON1 pereglyanuti redaguvati posilannya na VikiDanih Human PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 6 travnya 2017 Procitovano 8 veresnya 2017 angl Arhiv originalu za 24 lyutogo 2018 Procitovano 8 veresnya 2017 Div takozhHromosoma 11 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi