Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Підтримка
www.wikidata.uk-ua.nina.az

SDC1 англ Syndecan 1 білок який кодується однойменним геном розташованим у людей на короткому плечі 2 ї хромосоми Довжин

SDC1

SDC1

SDC1 (англ. Syndecan 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 310 амінокислот, а молекулярна маса — 32 462.

SDC1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SDC1, CD138, SDC, SYND1, syndecan, syndecan 1
Зовнішні ІД OMIM: 186355 MGI: 1349162 HomoloGene: 2252 GeneCards: SDC1
Шаблон експресії
image

image
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6382
20969
Ensembl
ENSG00000115884
ENSMUSG00000020592
UniProt
P18827
P18828
RefSeq (мРНК)
NM_001006946
NM_002997
NM_011519
RefSeq (білок)
NP_001006947
NP_002988
NP_035649
Локус (UCSC) Хр. 2: 20.2 – 20.23 Mb Хр. 12: 8.82 – 8.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MRRAALWLWLCALALSLQPALPQIVATNLPPEDQDGSGDDSDNFSGSGAG
ALQDITLSQQTPSTWKDTQLLTAIPTSPEPTGLEATAASTSTLPAGEGPK
EGEAVVLPEVEPGLTAREQEATPRPRETTQLPTTHLASTTTATTAQEPAT
SHPHRDMQPGHHETSTPAGPSQADLHTPHTEDGGPSATERAAEDGASSQL
PAAEGSGEQDFTFETSGENTAVVAVEPDRRNQSPVDQGATGASQGLLDRK
EVLGGVIAGGLVGLIFAVCLVGFMLYRMKKKDEGSYSLEEPKQANGGAYQ
KPTKQEEFYA

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kaukonen J., Alanen-Kurki L., Jalkanen M., Palotie A. (1997). The mapping and visual ordering of the human syndecan-1 and N-myc genes near the telomeric region of chromosome 2p. Hum. Genet. 99: 295—297. PMID 9050911 DOI:10.1007/s004390050360
  • Subramanian S.V., Fitzgerald M.L., Bernfield M. (1997). Regulated shedding of syndecan-1 and -4 ectodomains by thrombin and growth factor receptor activation. J. Biol. Chem. 272: 14713—14720. PMID 9169435 DOI:10.1074/jbc.272.23.14713
  • Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582
  • Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004
  • Lories V., Cassiman J.-J., van de Berghe H., David G. (1992). Differential expression of cell surface heparan sulfate proteoglycans in human mammary epithelial cells and lung fibroblasts. J. Biol. Chem. 267: 1116—1122. PMID 1339431

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

image Це незавершена стаття про білки.
Ви можете проєкту, виправивши або дописавши її.

Вікіпедія, Українська, Україна, книга, книги, бібліотека, стаття, читати, завантажити, безкоштовно, безкоштовно завантажити, mp3, відео, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, малюнок, музика, пісня, фільм, книга, гра, ігри, мобільний, телефон, android, ios, apple, мобільний телефон, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, ПК, web, Інтернет

SDC1 angl Syndecan 1 bilok yakij koduyetsya odnojmennim genom roztashovanim u lyudej na korotkomu plechi 2 yi hromosomi Dovzhina polipeptidnogo lancyuga bilka stanovit 310 aminokislot a molekulyarna masa 32 462 SDC1Nayavni strukturiPDBPoshuk ortologiv PDBe RCSB Spisok kodiv PDB4GVC 4GVDIdentifikatoriSimvoliSDC1 CD138 SDC SYND1 syndecan syndecan 1Zovnishni ID OMIM 186355 MGI 1349162 HomoloGene 2252 GeneCards SDC1Ontologiya genaMolekulyarna funkciya protein C terminus binding GO 0001948 GO 0016582 protein binding identical protein bindingKlitinna komponenta lysosomal lumen ekzosoma extracellular region integral component of membrane Golgi lumen integral component of plasma membrane membrana cell surface klitinna membrana external side of plasma membrane GO 0009327 protein containing complexBiologichnij proces glycosaminoglycan catabolic process canonical Wnt signaling pathway Zagoyennya ran response to calcium ion odontogenesis glycosaminoglycan biosynthetic process ureteric bud development response to cAMP positive regulation of exosomal secretion Sertoli cell development striated muscle cell development positive regulation of extracellular exosome assembly retinoid metabolic process response to glucocorticoid response to toxic substance response to organic substance response to hydrogen peroxide glycosaminoglycan metabolic process inflammatory response myoblast development leukocyte migration cell migration cytokine mediated signaling pathwayDzherela Amigo QuickGOShablon ekspresiyiBilshe danihOrtologiVidi Lyudina MishaEntrez6382 20969Ensembl ENSG00000115884 ENSMUSG00000020592UniProt P18827 P18828RefSeq mRNK NM 001006946 NM 002997NM 011519RefSeq bilok NP 001006947 NP 002988NP 035649Lokus UCSC Hr 2 20 2 20 23 MbHr 12 8 82 8 84 MbPubMed searchVikidaniDiv Red dlya lyudejDiv Red dlya mishej Poslidovnist aminokislot1020304050 MRRAALWLWLCALALSLQPALPQIVATNLPPEDQDGSGDDSDNFSGSGAG ALQDITLSQQTPSTWKDTQLLTAIPTSPEPTGLEATAASTSTLPAGEGPK EGEAVVLPEVEPGLTAREQEATPRPRETTQLPTTHLASTTTATTAQEPAT SHPHRDMQPGHHETSTPAGPSQADLHTPHTEDGGPSATERAAEDGASSQL PAAEGSGEQDFTFETSGENTAVVAVEPDRRNQSPVDQGATGASQGLLDRK EVLGGVIAGGLVGLIFAVCLVGFMLYRMKKKDEGSYSLEEPKQANGGAYQ KPTKQEEFYA A Alanin C Cisteyin D Asparaginova kislota E Glutaminova kislota F Fenilalanin G Glicin H Gistidin I Izolejcin K Lizin L Lejcin M Metionin N Asparagin P Prolin Q Glutamin R Arginin S Serin T Treonin V Valin W Triptofan Y Tirozin Kodovanij genom bilok za funkciyeyu nalezhit do fosfoproteyiniv Zadiyanij u takomu biologichnomu procesi yak polimorfizm Lokalizovanij u membrani Takozh sekretovanij nazovni LiteraturaThe status quality and expansion of the NIH full length cDNA project the Mammalian Gene Collection MGC Genome Res 14 2121 2127 2004 PMID 15489334 DOI 10 1101 gr 2596504 Kaukonen J Alanen Kurki L Jalkanen M Palotie A 1997 The mapping and visual ordering of the human syndecan 1 and N myc genes near the telomeric region of chromosome 2p Hum Genet 99 295 297 PMID 9050911 DOI 10 1007 s004390050360 Subramanian S V Fitzgerald M L Bernfield M 1997 Regulated shedding of syndecan 1 and 4 ectodomains by thrombin and growth factor receptor activation J Biol Chem 272 14713 14720 PMID 9169435 DOI 10 1074 jbc 272 23 14713 Bhatt A S Erdjument Bromage H Tempst P Craik C S Moasser M M 2005 Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases Oncogene 24 5333 5343 PMID 16007225 DOI 10 1038 sj onc 1208582 Liu X Shepherd T R Murray A M Xu Z Fuentes E J 2013 The structure of the Tiam1 PDZ domain phospho syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics Structure 21 342 354 PMID 23395182 DOI 10 1016 j str 2013 01 004 Lories V Cassiman J J van de Berghe H David G 1992 Differential expression of cell surface heparan sulfate proteoglycans in human mammary epithelial cells and lung fibroblasts J Biol Chem 267 1116 1122 PMID 1339431PrimitkiHuman PubMed Reference Mouse PubMed Reference angl Arhiv originalu za 20 travnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 angl Arhiv originalu za 10 serpnya 2017 Procitovano 28 serpnya 2017 Div takozhHromosoma 2 Ce nezavershena stattya pro bilki Vi mozhete dopomogti proyektu vipravivshi abo dopisavshi yiyi

Дата публікації:
Топ